1、使用前防范:TRIzol劇毒且易揮發(fā)(由于主要成分是苯酚),氯仿呢也是一種有毒也易揮發(fā)的試劑,有的小盆友為了防止氧化,還會(huì)加入β巰基乙醇,這個(gè)反正建議有鼻子的童鞋都做好防護(hù)。提取RNA前做好保護(hù)措施,最好在通風(fēng)廚中操作,所有接觸TRIzol的耗材,最好扔到專門的密封的桶中,等待處理。否則整個(gè)實(shí)驗(yàn)室都會(huì)彌漫著氣味,師兄師姐會(huì)打死你的! 2、必備前奏:所有耗材(槍頭、EP管)均經(jīng)過RNA酶滅活或者直接購(gòu)買無RNA酶的耗材,除RNA酶主要方法是用DEPC水浸泡48小時(shí)(DEPC雖然味道香,但卻是強(qiáng)致癌的,泡管子的時(shí)候別一直去聞它,一般來說煮沸或高溫高壓滅菌15min后,DEPC就會(huì)降解成二氧化碳和水)。順便說一句,其實(shí)我們以前也曾經(jīng)試過,濕熱滅菌兩次,也可以有效降低RNase,當(dāng)然這是偷懶的辦法啦。操作前戴口罩,你的唾沫星子是最大的RNA酶來源。 3、RNA非常容易降解,所有步驟盡量在冰盒里面操作,包括離心時(shí)需用4度預(yù)冷的離心機(jī)。根據(jù)說明書,非特別注明,所有程序均在15-30度下進(jìn)行,試劑也放置于15-30度,但是都不是溫度計(jì)的大家,還是放在冰盒上靠譜點(diǎn)。 4、1-5×10^7細(xì)胞或者50-100mg組織加入1ml TRIzol,細(xì)胞或者組織過多,TRIzol過少會(huì)導(dǎo)致裂解不充分,內(nèi)源性RNA酶抑制不完全,導(dǎo)致RNA降解。 5、TRIzol加入細(xì)胞后,反復(fù)吹打,充分裂解細(xì)胞至均一透亮,不粘稠為止。 6、加入氯仿后充分混勻,其實(shí)這步也不能過于劇烈,上層的水相含有RNA,中間的組織相含有DNA和蛋白質(zhì),剩余的一部分DNA會(huì)萃取到氯仿中,同時(shí)氯仿具有使蛋白質(zhì)變性的作用,離心完,中間那層就是組織層。 7、離心后,溶液分層,上層為含有RNA的水相,中間層乳白色的為含有部分DNA、蛋白質(zhì)的組織層,下層紅色的為含有DNA和部分蛋白質(zhì)的氯仿, 此時(shí),注意,“寧少勿多”,提取上層無色液體時(shí),小心輕柔,可以用200ul的槍抽吸,一般1ml的TRIzol時(shí)最多可以提取500ml上清,但是建議提取400ul以下,千萬避免吸到中間的乳白色組織層,否則最后測(cè)量RNA時(shí),OD260/280非常低,會(huì)有蛋白混入。 8、異丙醇加入的目的是為了使RNA沉淀,此時(shí)RNA已經(jīng)提出來了,應(yīng)輕輕混勻,避免RNA損傷。離心后肉眼可見EP管底部白色羽毛狀沉淀即為RNA沉淀,后面洗滌等操作均應(yīng)該注意,切勿將白色沉淀給倒掉,否則你就白提了。 9、75%乙醇加入的目的是為了洗滌和沉淀作用,也應(yīng)該輕柔。 10、最后晾干乙醇時(shí)應(yīng)盡量充分晾干,先用槍頭盡量把75%乙醇吸干,再晾5min,否則沒有晾干乙醇,加入DEPC水時(shí)可能導(dǎo)致RNA白色沉淀不溶解。 11、加入DEPC水溶解RNA時(shí),可根據(jù)自己需要的濃度來調(diào)整加入DEPC水的量。 12、純的RNA的OD260/280為2.0,比值在1.8~2.0為較好結(jié)果,<1.8提示有蛋白蛋白參雜,>2.0說明RNA有降解。 13、RNA提取后可以跑瓊脂糖膠來判斷降解情況,純的無降解的RNA跑完瓊脂糖膠后應(yīng)該有3條帶,26S,18S, 5S。其中5S很淡,不容易看見。如果條帶很淡,且有拖尾現(xiàn)象,提示有RNA降解。 |
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