1基因庫 1.1基因庫的概念 基因庫,就是基因的“倉庫”,它是指一個種群中全部個體所帶有的全部基因(包括全部等位基因)的總和。對基因庫這個概念的注意要點(diǎn)是: ①是一個完整獨(dú)立的種群; ②是種群中所有存活的個體; ③是全部基因,包括中性的基因、有利的基因與有害的基因。所以,若攜帶某種基因的個體全部死亡,那么這種基因?qū)⒃谠摲N群基因庫中消失。 1.2基因庫的應(yīng)用領(lǐng)域 基因庫這一概念屬于種群遺傳學(xué)范疇,它研究的對象不是細(xì)胞和個體,而是由一群可交配繁殖的個體組成的群體,該群體中的個體具有共同的基因庫。一個種群基因庫中的基因不會因?yàn)閭€體死亡而丟失,可以通過種群中雌雄個體的有性生殖進(jìn)行基因交流,從而將基因保留。種群基因庫常用基因頻率和基因型頻率來描述。在一個自然環(huán)境中,種群中某個基因的頻率和基因型的頻率總是在發(fā)生變化的,進(jìn)而影響種群基因庫的變化,實(shí)質(zhì)上就是這一種群的進(jìn)化。因此,研究種群基因庫的變化有助于了解生物進(jìn)化的機(jī)制。 2基因組 2.1基因組的概念 基因組的早期譯名為染色體組,指的是單倍體細(xì)胞中所包含的整套染色體。近年來,學(xué)術(shù)界用基因組這個名詞替代了染色體組。在遺傳學(xué)中對基因組的定義是:一個單倍體細(xì)胞核中、一個細(xì)胞器(動、植物細(xì)胞質(zhì)中的線粒體,植物細(xì)胞質(zhì)中的葉綠體)中或一個病毒毒粒中所含的全部DNA(或RNA)分子的總稱。基因組包括編碼序列和非編碼序列在內(nèi)的全部DNA分子,是某個特定物種細(xì)胞全部遺傳信息的集合。 2.2基因組的分類 根據(jù)DNA在不同生物中的分布,可將基因組分為真核生物基因組、原核生物基因組和病毒基因組。真核生物基因組又分為核基因組和細(xì)胞器基因組,前者是指單倍體的細(xì)胞核內(nèi)整套染色體所含的DNA分子:后者則區(qū)分為線粒體基因組和葉綠體基因組。原核生物基因組就是原核細(xì)胞內(nèi)的擬核和質(zhì)粒,一大一小兩個環(huán)狀DNA分子。從上可知,不同生物的基因組差別很大。例如,人類核基因組包括22條常染色體和X或Y兩條性染色體中的全部DNA分子:而霍亂弧菌的基因組只由一大一小兩個環(huán)狀DNA分子構(gòu)成。從整體上看,同種生物的不同個體的基因組是相同的,因此,可以說“一個物種只有一個基因組”,但由于不同個體可能擁有不同的等位基因,這就決定了個體之間的差異。 2.3基因組的應(yīng)用領(lǐng)域 基因組研究主要包括兩個方面: ①以全基因組進(jìn)行測序?yàn)槟繕?biāo)的結(jié)構(gòu)基因組學(xué),它的目的是建立生物體高分辨率遺傳、物理和轉(zhuǎn)錄圖譜。結(jié)構(gòu)基因組學(xué)是通過基因作圖,核苷酸序列分析以確定基因組成、基因定位的一門科學(xué),它代表基因組分析的早期階段。 ②功能基因組學(xué)相關(guān)的研究包括基因功能發(fā)現(xiàn)、基因表達(dá)分析及突變檢測。它以高通量、大規(guī)模實(shí)驗(yàn)方法及計算機(jī)統(tǒng)計分析為特征,對成千上萬的基因表達(dá)進(jìn)行分析和比較,力圖從基因組整體水平上對基因的活動規(guī)律進(jìn)行闡述。自從1990年正式啟動人類基因組計劃以來,基因組學(xué)的研究已發(fā)展成生命科學(xué)研究的前沿和熱點(diǎn)領(lǐng)域。 3基因文庫 3.1基因文庫的概念 指將某種生物的全部基因組的遺傳信息貯存在可以長期保存的穩(wěn)定的重組體中,以備需要時能夠隨時從中分離出所需要的目的基因,這種保存基因遺傳信息的材料,就稱為基因文庫又稱DNA文庫?;蛭膸煊赏庠碊NA片段、載體和宿主細(xì)胞組成。通常是將某生物不同基因用適當(dāng)?shù)墓ぞ呙讣羟泻笃唇拥降偷任⑸锶缂?xì)菌的質(zhì)粒、噬菌體等載體上,將這些載體導(dǎo)入到受體細(xì)菌或細(xì)胞中,使得各受體細(xì)胞中分別含有這種生物的不同基因:經(jīng)過繁殖擴(kuò)增,許多細(xì)胞一起包含了該生物全部基因組序列,建構(gòu)成該生物的基因文庫。例如,帶有人類所有基因克隆的大腸桿菌細(xì)胞構(gòu)成了人類基因文庫,可從這個文庫中篩選、鑒定和研究人類的各種基因。 3.2基因文庫的分類 基因文庫可分為基因組文庫和rDNA文庫。基因組文庫就是把某生物的整個基因組DNA切成適當(dāng)大小的片段(包括目的基因在內(nèi)),分別與載體DNA組合,導(dǎo)入微生物細(xì)胞,進(jìn)行克隆繁殖后收集在一起作為長期保存的遺傳物質(zhì)庫。cDNA文庫就是以生物細(xì)胞的mRNA為模板經(jīng)反轉(zhuǎn)錄形成穩(wěn)定的雙螺旋DNA(即cDNA),再將這些cDNA插入到載體DNA中,導(dǎo)入微生物細(xì)胞,所建立起來的克隆群。一個高質(zhì)量的cDNA文庫只代表了生物體某一器官或組織mRNA所含有的全部或絕大部分遺傳信息。cDNA文庫與基因組文庫相比,其突出特點(diǎn)在于cDNA來自反轉(zhuǎn)錄的mRNA,不含冗余序列,通過特異性探針篩選cDNA文庫,可以較快地分離到相關(guān)基因。而基因組文庫特別是真核生物的基因組文庫非常龐大,而且含有大量重復(fù)序列,無論采用何種分離方法都難以直接分離到靶基因片段。 3.3基因文庫的應(yīng)用領(lǐng)域 基因文庫屬于基因工程范疇,在很多情況下,目的基因的分離都離不開基因文庫,主要用于獲得未知序列的目的基因。目前兩種基因文庫在基因工程中都有廣泛的應(yīng)用,可根據(jù)研究目的選擇其中一種。在分離RNA病毒基因、研究功能蛋白序列、分離特定發(fā)育階段或特定組織特異性表達(dá)的基因時應(yīng)構(gòu)建rDNA文庫。在研究mRNA分子中不存在的序列及復(fù)雜基因組作圖時必須構(gòu)建基因組文庫。從基因文庫中分離出目的基因后,還必須對其進(jìn)行必要的檢測與分析。例如,進(jìn)行序列測定、體外轉(zhuǎn)錄及翻譯、功能互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)等。通過這些實(shí)驗(yàn)確定出基因的結(jié)構(gòu)及功能,到這時才能算分離到了目的基因。所以,基因的克隆、克隆基因的分離、分離基因的鑒定是利用基因文庫技術(shù)分離目的基因的主要內(nèi)容。 ——全剛.基因庫、基因組、基因文庫的概念辨析.生物學(xué)教學(xué).2017年第1期 |
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