努爾哈赤于明萬(wàn)歷44年（1616年）建立后金政權(quán)，都城地址幾度變遷。

明天啟5年（1625年）努爾哈赤將后金都城從遼陽(yáng)遷往沈陽(yáng)，當(dāng)時(shí)，也稱沈陽(yáng)為“沈京”。

明崇禎7年（1634年），清太宗皇太極頒旨，改沈陽(yáng)名稱為“天眷盛京”，簡(jiǎn)稱“盛京”。

明崇禎9年（1636年）皇太極改后金國(guó)號(hào)為清。

明崇禎17年（1644年）清朝入主中原，遷都北京，盛京成了陪都。

陪都這種獨(dú)特的城市身份，決定了盛京城有北京一樣的都城特征，設(shè)戶、禮、兵、刑、工五部，但是各部不設(shè)主官——尚書(shū)，只設(shè)二把手——侍郎，設(shè)“內(nèi)大臣”為陪都最高官職，做為盛京總管，留守盛京，并管理東北地區(qū)的軍政事務(wù)，因?yàn)槟菚r(shí)東北的漢人很少，由陪都職能部門(mén)完全可以勝任；而滿人歷來(lái)是由八旗制度這個(gè)亦軍亦民的體制來(lái)管理的。

清廷從1644年入主中原始，直至1907年止，在東北地區(qū)，不實(shí)行關(guān)內(nèi)的行省制（最高官員為總督、巡撫），而是軍府制，即東北（各?。┑淖罡唛L(zhǎng)官主要職責(zé)是負(fù)責(zé)地方的鎮(zhèn)守防衛(wèi)，行政事務(wù)是兼職。

清順治3年（1646年），盛京陪都的內(nèi)大臣及五部機(jī)構(gòu)全部撤銷。東北地區(qū)的最高官職改為盛京昂邦章京（滿族名稱，意為將軍。）。盛京昂邦章京掌管東北地區(qū)一切軍政事務(wù)。

清順治10年（1653年），在吉林寧古塔將當(dāng)?shù)伛v防長(zhǎng)官改為“寧古塔昂邦章京”，從這時(shí)起，東北地區(qū)有了兩個(gè)最高長(zhǎng)官；今遼寧省地區(qū)的軍政事務(wù)歸盛京昂邦章京管理；今吉林和黑龍江等地區(qū)統(tǒng)歸寧古塔昂邦章京管轄，那時(shí)候吉林地區(qū)和黑龍江地區(qū)地廣人稀，兩地區(qū)的人口加起來(lái)也沒(méi)有遼寧地區(qū)的人口多，所以寧古塔昂邦章京雖然管轄的地區(qū)面積大，實(shí)際事務(wù)要少，其重要性沒(méi)有盛京昂邦章京大。

由于昂邦章京是武職官員，行政事務(wù)不甚擅長(zhǎng)，而且精力有限，后來(lái)，東北地區(qū)經(jīng)過(guò)關(guān)內(nèi)不斷向關(guān)外移民，人口越來(lái)越多，老百姓的日常事務(wù)，昂邦章京衙門(mén)就管不過(guò)來(lái)了。

于是，清順治14年（1657年)，在盛京城里，清廷在昂邦章京衙署下面，又設(shè)一奉天府，主官名稱為奉天府尹。“奉天”寓意“奉天承運(yùn)”，這也是遼寧及沈陽(yáng)又名奉天的由來(lái)。奉天府管理奉天（遼寧）的行政事務(wù)。

清康熙元年（1662年），盛京“昂邦章京”官署衙門(mén)遷往遼東，因此，改盛京“昂邦章京”這一滿族官職名稱為漢族名稱“鎮(zhèn)守遼東等處將軍”，簡(jiǎn)稱“遼東將軍”。

同一年，“寧古塔昂邦章京”改稱為“鎮(zhèn)守寧古塔等處將軍”，簡(jiǎn)稱“寧古塔將軍”。

清康熙3年（1664年），清廷在廣寧（今遼寧北鎮(zhèn)市）設(shè)立廣寧府，后來(lái)廣寧府衙移駐到今遼寧錦縣那個(gè)地方，所以改廣寧府為錦州府，錦州府歸奉天府節(jié)制。

晚清時(shí)又陸續(xù)設(shè)立新民府（廳）、昌圖府（廳）、洮南府、海龍府（廳）、鳳凰直隸廳、興京直隸廳，后設(shè)立的這六個(gè)府（廳）的轄地有許多現(xiàn)在是吉林省的轄地；還設(shè)立了遼陽(yáng)、復(fù)州、金州、寧遠(yuǎn)、義州、遼源、岫巖七個(gè)散州，營(yíng)口一個(gè)散廳。

同年（1664年），清廷在奉天府下設(shè)承德縣，管理盛京城外京畿地區(qū)老百姓事務(wù)。以后又陸續(xù)在全盛京地區(qū)設(shè)立許多縣。

到1907年?yáng)|北地區(qū)改制為止，盛京（遼寧）地區(qū)共先后設(shè)立承德縣、撫順縣、開(kāi)原縣、鐵嶺縣、海城縣、蓋平縣、遼中縣、本溪縣、錦縣、興城縣、廣寧縣、綏中縣、鎮(zhèn)安縣、彰武縣、通化縣、懷仁縣、輯安縣、臨江縣、安東縣、寬甸縣、安圖縣、撫松縣、東平縣、西豐縣、西安縣、柳河縣、奉化縣、懷德縣、康平縣、靖安縣、開(kāi)通縣、安廣縣、醴泉縣、鎮(zhèn)東縣共34縣，其中有些縣現(xiàn)在是屬于吉林省轄區(qū)。

清康熙4年（1665年），“鎮(zhèn)守遼東等處將軍”又改稱為“鎮(zhèn)守奉天等處將軍”，簡(jiǎn)稱“奉天將軍”。

清康熙15年（1676年），“寧古塔將軍”奉旨移駐吉林烏拉（又稱“船廠”，今吉林市），所以，后來(lái)人們也稱寧古塔將軍為吉林將軍、船廠將軍。

清康熙22年（1683年），清廷在黑龍江省地區(qū)初設(shè)“黑龍江將軍”，從此時(shí)起，吉林省地區(qū)和黑龍江省地區(qū)分治；“寧古塔將軍”不再對(duì)黑龍江地區(qū)負(fù)責(zé)；東北地區(qū)就開(kāi)始有三個(gè)最高主官了，東北三省的雛形形成了。

清乾隆12年（1747年），“鎮(zhèn)守奉天等處將軍”官署衙門(mén)又遷回盛京，于是，這個(gè)官職又改稱“盛京將軍”。

清乾隆22年（1757年），寧古塔將軍正式更名為“鎮(zhèn)守吉林烏拉等處將軍”，簡(jiǎn)稱“吉林將軍”。

清光緒33年（1907年）東北地區(qū)實(shí)行行省制，撤除“盛京將軍”，改設(shè)東三省總督，統(tǒng)管東三省軍政。并設(shè)奉天巡撫。

同一年，吉林將軍和黑龍江將軍也均裁撤。改吉林將軍、黑龍江將軍為吉林巡撫、黑龍江巡撫。

清宣統(tǒng)2年（1910年）奉天巡撫一職撤銷，由東三省總督兼奉天巡撫。