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比爾·蓋茨說:下一個世界首富來自基因領(lǐng)域!

 Bestgu4ha5ibqn 2016-08-06

比爾·蓋茨曾經(jīng)預(yù)言:超過我的下一個世界首富必定出自基因領(lǐng)域。生物產(chǎn)業(yè)究竟擁有怎樣的魔力,讓連續(xù)13年蟬聯(lián)全球首富的蓋茨也為之傾倒?


眾所周知,目前人類許多疾病源于基因缺陷,且罕有甚至沒有相關(guān)藥物治療。而所謂基因編輯技術(shù),是指對DNA核苷酸序列進行刪除和插入等操作,使人們可以依照自己的意愿改寫基因。舉例來說,基因編輯可以通過改變?nèi)祟惻咛サ幕?,修?fù)其中的致病部分,并且這一“優(yōu)質(zhì)基因”可以得到遺傳。


值得注意的是,基因編輯在基因治療、基礎(chǔ)研究、藥物制備、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、環(huán)境保護、頻危動物救助等方面均有著非常廣泛的應(yīng)用。目前,基因編輯技術(shù)的商業(yè)化應(yīng)用主要包括科研、制藥和動植物產(chǎn)品生產(chǎn)等幾大領(lǐng)域,發(fā)展前景相當廣闊。



目前基因編輯的技術(shù)主要有:


ZFN


第一個使用定制DNA核酸內(nèi)切酶的基因組編輯策略就是鋅指核酸酶(zinc-finger nucleases,簡稱ZFN)。


鋅指蛋白是轉(zhuǎn)錄因子;每個指模塊識別3-4個堿基的序列,將這些模塊混合搭配,研究人員或多或少能靶定他們希望的任何序列。Sigma-Aldrich公司將ZFN技術(shù)商業(yè)化,推出CompoZr ZFN試劑平臺。


ZFN是異源二聚體,其中每個亞基含有一個鋅指結(jié)構(gòu)域和一個FokI核酸內(nèi)切酶結(jié)構(gòu)域。FokI結(jié)構(gòu)域必須二聚化才有活性,確保必須存在兩個相鄰的DNA結(jié)合事件才能實現(xiàn)雙鏈斷裂,從而增加了目標特異性。


切割事件使得大部分基因組編輯技術(shù)得以實現(xiàn)。在雙鏈斷裂后,細胞試圖修復(fù)它。最簡單的方法是非同源末端接合(NHEJ),其中細胞基本上磨平斷裂DNA的兩端,再將其彼此拉近,這往往產(chǎn)生移碼。另一種方法是同源定向修復(fù)(HDR)。細胞試圖利用另一條染色體上對應(yīng)的DNA序列作為模板來修復(fù)斷裂。通過提供自己的模板,用戶可促使系統(tǒng)在不經(jīng)意間插入所需的序列。



TALEN


盡管鋅指核酸酶還不錯,但它們制作起來比較貴,也比較繁瑣,故研究人員一般都是從Sigma訂購。之后,一種相似但更為靈活的系統(tǒng)出現(xiàn)了。


轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶(TALEN)是二聚的轉(zhuǎn)錄因子/核酸酶,由33至35個氨基酸模塊構(gòu)成,其中每個靶定單個核苷酸。通過組裝這些模塊,研究人員可靶定他們想要的任何序列。


梅約醫(yī)學中心的Stephen Ekker將以50年代的晶體管和真空管來比喻TALEN和ZFN: 


“通過真空管,你可以在原理上設(shè)計,但它非常困難;而晶體管讓事情變得更容易。同樣地,ZFN提供了基因組編輯技術(shù)的理論基礎(chǔ),但TALEN做了ZFN的大部分工作,且更便宜、更快、更好?!?/p>



CRISPR


基因組編輯上的新生力量是所謂的CRISPR/Cas系統(tǒng)。


CRISPR/Cas9到底是一項什么技術(shù),為何能夠獲得如此這般青睞,又何以在短短兩三年時間內(nèi),發(fā)展成為生物學領(lǐng)域最炙手可熱的研究工具之一,并有近700篇相關(guān)論文發(fā)表?它將來又會如何影響到我們的生活?


科學家Jennifer Doudna 和Emmanuelle Charpentier因發(fā)現(xiàn)CRISPR-Cas9系統(tǒng)獲得了2015年“生命科學突破獎”,該獎項被喻為“豪華版諾貝爾獎”。CRISPR/Cas9是繼“鋅指核酸內(nèi)切酶(ZFN)”、“類轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物核酸酶(TALEN)”之后出現(xiàn)的第三代“基因組定點編輯技術(shù)”。


與前兩代技術(shù)相比,其成本低、制作簡便、快捷高效的優(yōu)點,讓它迅速風靡于世界各地的實驗室,成為科研、醫(yī)療等領(lǐng)域的有效工具。



今年5月,加州大學伯克利分校的科學家們開發(fā)出了一種更快、更有效的方法采用CRISPR-Cas9來改造小鼠基因,由于這一新的基因編輯工具易于使用,簡化了一個越來越受到歡迎的研究程序。

在最新的研究中,加州大學伯克利分校的研究人員發(fā)現(xiàn),一種叫做電穿孔(electroporation)的簡單實驗室技術(shù)可以更好地起作用,使得她們能夠以近100%的成功率將CRISPR-Cas9基因編輯分子插入到胚胎中。


在一項預(yù)實驗中利用CRISPR-EZ,研究小組成功破壞了88%小鼠中兩個拷貝的靶基因。由于顯著提高了胚胎存活力,相比于CRISPR顯微注射,這一程序構(gòu)建出了更大數(shù)量的基因編輯小鼠。領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是加州大學伯克利分校分子與細胞生物學副教授何琳說,CRISPR-EZ是一種簡單且節(jié)約成本的方法,同時可對多個胚胎實施操作,只需要幾毫秒的時間。


NgAgo-gDNA


來自河北科技大學的韓春雨副教授,他的團隊發(fā)明了一種適合在人類細胞中進行基因組編輯的新技術(shù):NgAgo-gDNA(Natronobacterium gregoryi Argonaute-gDNA)。


這是以DNA為介導(dǎo)、適合在人體細胞中進行基因組編輯的核酸內(nèi)切酶NgAgo,利用NgAgo核酸內(nèi)切酶實現(xiàn)以DNA引導(dǎo)的基因組編輯功能。




與最時興的CRISPR-Cas9技術(shù)相比,NgAgo-gDNA技術(shù)有哪些優(yōu)勢呢?


1、NgAgo的向?qū)Ш怂崾荄NA而非RNA,因此避免了RNA易于形成復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu)而帶來的失效或者脫靶效應(yīng);


2、NgAgo核算內(nèi)切酶需結(jié)合有24個堿基的引導(dǎo)DNA(gDNA),而Cas9則需要19個堿基的gRNA,理論上NgAgo精確性要比Cas9提高1024倍;


3、NgAgo–gDNA系統(tǒng)對向?qū)蛄校╣DNA)-靶序列錯配的容忍度很低。gDNA上任何一個堿基的變換都會降低核酸內(nèi)切酶NgAgo的切割效率,因此NgAgo系統(tǒng)比Cas9系統(tǒng)效率更高;


4、NgAgo的向?qū)NA(gDNA)需要5’端磷酸化的單鏈DNA (5p-ssDNA),這種形式的DNA在哺乳動物細胞中幾乎不存在,這保證了NgAgo不會被內(nèi)源的DNA序列錯誤地帶到不該去的地方;


5、由于5p-ssDNA是外源轉(zhuǎn)化進細胞的,其時間和濃度可以非常精確地控制。而Cas9系統(tǒng)的gRNA是內(nèi)源表達的質(zhì)粒,所以難以精確地控制;


6、Argonautes在進化過程中是保守的,存在于幾乎所有生物體中,而Cas9只存在于原核生物中;


7、Argonaute不要求靶序列上存在特異的序列,而Cas9只可以切割下游含有特異序列(PAM序列)的靶序列;


8、當核酸酶Argonaute與向?qū)蛄校╣DNA)結(jié)合時,它們可以影響彼此的生化特性,并作為一個整體起作用。


 NgAgo的脫靶率更低,短介導(dǎo)DNA的準確性和識別長度均有了重大突破,實現(xiàn)了對基因組的任意位置進行切割,將基因編輯的可能性推入了更廣泛的境地。


小結(jié):


基因編輯技術(shù)其實面臨很大的政策與醫(yī)學倫理爭議,尤其是對人類胚胎DNA編輯,一經(jīng)亮相就登上各大頭條并引起廣泛關(guān)注。鑒于科學的迅猛發(fā)展,基因編輯很可能在2016年繼續(xù)占據(jù)科學政策主流問題的地位。


備注:本文為麥侖科技原創(chuàng),部分資料出自生物通,轉(zhuǎn)載請注明來源。


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