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突變遠多于Delta,香港已檢出;Omicron突變株,是“超級毒株”嗎?

 文墨典 2021-11-27
新冠日報,只提供專業(yè)解讀。

關(guān)鍵詞:COVID-19;新冠病毒;突變株

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(圖源:WHO官網(wǎng))

2021年11月26日,世界衛(wèi)生組織(WHO)正式將新冠病毒突變株B.1.1.529升級為令人擔憂的突變株(Variant of Concern, VOC);系統(tǒng)命名定為Omicron。

VOC是目前病毒監(jiān)測系統(tǒng)中最高級別,也是最危險的突變株;上一個被納入VOC的是給人類造成巨大危害的Delta突變株。

根據(jù)已有資料,B.1.1.529突變株有更多突變,很可能產(chǎn)生了比Delta突變株更強的傳染性、毒性和免疫逃逸;從而成為人類新的噩夢。

該消息立即引起各大媒體巨大關(guān)注和歐美股市大幅下挫。

我們在后臺也收到了很多B.1.1.529突變株的詢問,所以特意請一直在美國從事病毒及新冠病毒研究的王宇歌博士做一系統(tǒng)解讀。

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B.1.1.529突變株,顧名思義這個突變株來自于B.1.1譜系,和Alpha(B.1.1.7)屬于同一譜系。

B.1.1.529突變株最早于2021年11月11日在非洲南部的博茲瓦納發(fā)現(xiàn),3天后即在南非的Gauteng省迅速蔓延。在Gauteng從11月12-20日采樣的77個患者樣品中,經(jīng)檢測全部為B.1.1.529突變株。

特別需要警惕的是,中國香港已經(jīng)檢測到了B.1.1.529突變株,系由從南非旅行者帶入,且傳染了同期的另外一位隔離者。

除此之外,以色列、比利時等也都檢出B.1.1.529突變株。

1,B.1.1.529突變株

極可能有更強的傳染性

Delta突變株最大的危害是傳染性極強,基礎(chǔ)傳染值達5-9.5。

但金融時報首席數(shù)據(jù)記者發(fā)現(xiàn),B.1.1.529比Delta突變株更容易傳播(如下圖所示)。

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(B.1.1.529的傳染性超過Delta突變株!圖源:ft.com)

B.1.1.529在南非Gauteng地區(qū)的傳染性也證實了這一點。在進入到11月份之后的短短兩周內(nèi),B.1.1.529突變株的檢測陽性比例就由1%上漲到30%!

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B.1.1.529在南非的迅速蔓延。圖源:nicd.ac.za)

南非的病例也開始呈指數(shù)增長,周二有868例,周三到了1275例,周四竟然達到了3500多例。

盡管這些病例尚未被鑒定為都是B.1.1.529突變株,但足夠引起高度警惕。

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(南非的病例數(shù)突然出現(xiàn)暴漲)


B.1.1.529突變株的傳染速度可能遠高于之前的任何突變株,著名的疾病建模科學家Weiland估計,B.1.1.529突變株的傳染性比原始毒株高500%;相對比,Delta突變株的傳染性可能比原始毒株高70%-200%。

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(圖源:推特@JPWeiland


2,B.1.1.529突變株的

傳染性為什么這么高?

B.1.1.529突變株突變株的Spike(S蛋白)有32個突變,是目前突變株中S蛋白突變最多的;相對比的是,Delta突變株在S蛋白上有9個突變。其與Delta和Alpha突變株有多處重合,因此該突變株可能有復(fù)制能力增強的特征。

它的Furin切割位點附近有H655Y + N679K + P681H突變,也可能增強病毒復(fù)制能力和感染力。

Jeffery Barrett博士列出了這些突變,其中紅色意味著不好,B.1.1.529有9個,其中P681R尤其令人擔憂。紫色意味著新的突變,且實驗室數(shù)據(jù)顯示有威脅。黃色意味著這些突變位置很重的,但科學家還不知道其生物學特征。藍色表示需要更多證據(jù)來驗證。綠色表示這些突變已被驗證過,不需要擔心。

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B.1.1.529的突變位點。圖源:推特@jcbarret


上面這張圖特別好,標記了每種突變的意義。

B.1.1.529突變株綜合了幾個VOC最關(guān)鍵的突變:
Alpha,Beta,GammaN501Y;AlphaP681。
它還有最讓人擔心,也是我講得最多的Beta免疫逃逸突變E484DeltaT478K。

3,B.1.1.529突變株
毒力和免疫逃逸會更強嗎?

從突變位點看,B.1.1.529突變株的RBD具有15個突變,是RBD突變最多的突變株,可能會影響抗體識別和疫苗接種。

B.1.1.529具有nsp6-del105-107,可能會影響固有免疫及T細胞免疫。除此以外,它的N蛋白具有R203K/G204R,可能會提高病毒毒力

4,B.1.1.529是否會成為下一個超級毒株,

目前下結(jié)論為時尚早

我們的主要結(jié)論:B.1.1.529突變株確實非常非常值得警惕,不過B.1.1.529是否會成為下一個“超級毒株”,目前下結(jié)論為時尚早。

首先簡要總結(jié)下B.1.1.529突變株有可能成為“超級毒株”的特點:

1. RBD具有15個突變,是RBD突變最多的突變株,會影響抗體識別和疫苗接種;

2. Furin切割位點附近有H655Y + N679K + P681H突變,可能增強病毒復(fù)制能力和感染力;

3. 具有nsp6-del105-107,可能會影響固有免疫及T細胞免疫;

4. N蛋白具有R203K/G204R,可能會提高病毒毒力。

而在南非也確實看到了B.1.1.529突變株正在攻城略地。

但對于突變株最重要的兩個流行病學特征,傳播能力免疫逃逸能力,目前還沒有B.1.1.529的相關(guān)數(shù)據(jù)

更重要的是,B.1.1.529突變株如Delta一樣,在NTD有大量突變;同時在RBD具有如此頻繁的突變,有15個之多。從我經(jīng)常講的病毒適應(yīng)性角度,RBD具有如此多的突變,會有很顯著的免疫逃逸;但并不能保證病毒與宿主細胞能夠結(jié)合得更有效,因此不能預(yù)測病毒傳播能力更強,這需要結(jié)構(gòu)生物學、病毒學和流行病學的數(shù)據(jù)來判斷。
因此,這個病毒不知道會不會像Beta一樣,僅引起局部傳播,但無法成為全球主導(dǎo)突變株。

還有一個,B.1.1.529突變目前主要在南非蔓延,而與其他國家相比,南非具有特殊性。
1)南非之前疫情控制尚好,也就是說,B.1.1.529突變并未直接面對Delta突變株的競爭。
2)南非疫苗完全接種疫苗的比例只有24%,遠低于全球42%的比例,屬于防疫薄弱地區(qū)。所以B.1.1.529突變株在其他地區(qū)是否會如南非一樣肆意蔓延還不好說。

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但是,南非出現(xiàn)B.1.1.529突變也再次給我們敲響警鐘,整個非洲完全接種疫苗的比例僅7%。這意味著COVID-19一旦在非洲爆發(fā),將以更迅猛的速度蔓延,且在這個過程中,很可能會產(chǎn)生新的“超級突變株”。

5,疫苗公司的應(yīng)對

對于B.1.1.529突變株,主要的疫苗公司紛紛展示了自己的應(yīng)對能力。

mRNA疫苗公司德國BioNTech表示,正在測試與輝瑞合作研發(fā)的COVID-19疫苗,將在兩周內(nèi)知道該疫苗是否對B.1.1.529突變株有效。并且,BioNTech和輝瑞能夠在6周內(nèi)完成新疫苗的設(shè)計,并在100天內(nèi)完成第一批疫苗的生產(chǎn)。

mRNA疫苗公司美國Moderna則在一份聲明中說,該公司一直在推動針對更新突變株的加強針,目前已有兩個候選多價加強針,包括針對B.1.1.529突變株突變株的mRNA-1273.529;并有能力在60天內(nèi)把新的候選疫苗推進到臨床試驗階段。

重組蛋白疫苗公司美國Novavax則宣布,已經(jīng)開始研究B.1.1.529突變將在后面數(shù)周內(nèi)完成疫苗測試和測試疫苗的生產(chǎn)。

DNA疫苗公司Inovio則說,將評估其現(xiàn)有疫苗對B.1.1.529突變株的有效性,2周會完成測試。

小結(jié),
1,B.1.1.529突變株確實具有“超級毒株”的潛質(zhì),需要特別重視;但目前不宜過度解讀這一突變株的實際危害,更不必恐慌。
2,盡快加速全球薄弱地區(qū)的疫苗接種,才是預(yù)防再次出現(xiàn)“超級毒株”的關(guān)鍵。
3,對于我們個人來說,除了盡快完成疫苗接種及加強接種之外,減少疫區(qū)旅行、戴好口罩、注意洗手,仍然是關(guān)鍵而有效的防疫措施。

參考文獻:

https://yourlocalepidemiologist./p/new-concerning-variant-b11529

https://www./articles/d41586-021-03552-w


本期編輯Henry,微信號healsan。
Hanson臨床科研團隊,由6位在美國的醫(yī)生及醫(yī)學科學家組成;目前在美國主要從事新藥研發(fā)和臨床科研。
點擊??,關(guān)注醫(yī)學科研進展

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