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鋅指核酸酶技術(shù)龍頭公司Sangamo:細(xì)胞治療和基因治療“全面開花”,巨頭爭(zhēng)搶資金不斷

 醫(yī)藥魔方 2021-04-06
基因編輯技術(shù)有三大類別,分別是鋅指核酸酶(ZFN)、轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶(TALEN)以及獲得了2020年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的CRISPR/Cas9系統(tǒng)。

ZFN發(fā)現(xiàn)于20世紀(jì)90年代末,是第一種問(wèn)世的基因編輯工具。然而,相比問(wèn)世不到10年就已經(jīng)吸引全球大量公司布局,且有多個(gè)項(xiàng)目以及走進(jìn)臨床的CRISPR/Cas9技術(shù),20多年過(guò)去了,ZFN技術(shù)的研發(fā)仍由一家公司主導(dǎo)。

這家公司就是位于美國(guó)里士滿的Sangamo Therapeutics。

Sangamo成立于1995年,根據(jù)其官網(wǎng)公布的過(guò)往財(cái)報(bào)數(shù)據(jù),這家公司自成立以來(lái),幾乎全部都是赤字。它沒(méi)有一款產(chǎn)品上市,其實(shí)這種情況也很正常,大部分藥企都是在產(chǎn)品上市后才實(shí)現(xiàn)盈利的,但是Sangamo保持這樣的虧損狀態(tài)已經(jīng)20多年了,而且它的市值還在不斷提升。

Sangamo市值變化(來(lái)源:macrotrends)


在新技術(shù)、新療法日新月異,研發(fā)賽道戰(zhàn)火四起的今天,ZFN技術(shù)透露著一股孤獨(dú)感,甚至有些陌生。Sangamo又是如何做到二十多年來(lái)一枝獨(dú)秀,孤軍奮戰(zhàn)卻一直屹立不倒的?它開發(fā)的技術(shù)究竟有什么特殊魅力?


ZFN的發(fā)現(xiàn)

鋅指蛋白是一種轉(zhuǎn)錄因子,于1984年在Aaron Klug實(shí)驗(yàn)室的非洲爪蟾轉(zhuǎn)錄研究中被發(fā)現(xiàn),后經(jīng)人工改造并與核酸內(nèi)切酶進(jìn)行連接組成了ZFN。

ZFN是一個(gè)帶定位系統(tǒng)的基因剪刀,鋅指蛋白用于識(shí)別和結(jié)合特定的基因序列,F(xiàn)okI核酸內(nèi)切酶可以通過(guò)二聚體化特異性地切割目的基因,并且可以切割真核基因組的任意識(shí)別序列。

FokI核酸內(nèi)切酶與識(shí)別特定序列的鋅指模塊結(jié)合形成ZFN。右側(cè)ZFN與左側(cè)ZFN分別結(jié)合9-18bp長(zhǎng)度的靶序列成二聚體,兩端靶序列中間的DNA序列由FokI核酸內(nèi)切酶的剪切結(jié)構(gòu)域剪切(來(lái)源:參考資料[4])



Sangamo的“壟斷

在ZFN技術(shù)問(wèn)世后,雖然多家研究機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們對(duì)這一技術(shù)進(jìn)行了優(yōu)化,但20多年以來(lái),圍繞該技術(shù)進(jìn)行臨床轉(zhuǎn)化開發(fā)的公司只有Sangamo一家。

這源于時(shí)任Sangamo CEO的Edward Lanphier的“遠(yuǎn)見“。從1995年以75萬(wàn)美元?jiǎng)?chuàng)立Sangamo開始,他就決定將公司打造成一個(gè)外人無(wú)法從中分一杯羹”的技術(shù)孤島。

Edward Lanphier(來(lái)源:參考資料[5])


在他的努力下,從ZFN設(shè)計(jì)、優(yōu)化到臨床應(yīng)用的整套技術(shù)體系的專利皆被Sangamo一一收入囊中。ZFN技術(shù)開發(fā)被Sangamo獨(dú)家鎖定,再也沒(méi)有其它機(jī)構(gòu)從事ZFN的研發(fā)。

表1 部分授權(quán)/轉(zhuǎn)讓給Sangamo的專利

數(shù)據(jù)來(lái)源:參考資料[6]


從另一個(gè)角度來(lái)說(shuō),Sangamo可以被視為是醫(yī)藥行業(yè)專利保護(hù)的“最佳典范“,在Jennifer Doudna、Emmanuelle Charpentier和張鋒還在為CRISPR/Cas9的專利爭(zhēng)得“焦頭爛額”的時(shí)候,Sangamo在自己的專利堡壘中獨(dú)自做著研究。但必須承認(rèn)的一點(diǎn)是,少了學(xué)術(shù)界源源不斷的智慧,這種“獨(dú)斷專行”式的自我求索延緩了整個(gè)ZFN領(lǐng)域的技術(shù)進(jìn)步。

而CRISPR/Cas9技術(shù)從首次應(yīng)用至今不到10年時(shí)間,已是風(fēng)光無(wú)限,在獲得了各項(xiàng)大獎(jiǎng)的同時(shí),有著大量的研究人員前仆后繼地去完善和改進(jìn)這一技術(shù),并推動(dòng)其走向應(yīng)用。依托或應(yīng)用這一技術(shù)已有40余家生物技術(shù)公司創(chuàng)立。

表2 部分CRISPR技術(shù)公司

信息來(lái)源:各公司官網(wǎng)



資金從哪來(lái)?

根據(jù)Sangamo發(fā)布的往年的財(cái)報(bào),公司從來(lái)沒(méi)有真正盈利過(guò),它沒(méi)有任何產(chǎn)品上市,公司的生存和研發(fā)的推動(dòng)需要大量的資金,但Sangamo這些年似乎并未為此發(fā)愁。

早在2012年,Sangamo就完成了在納斯達(dá)克的上市。除了股票帶來(lái)的收入,公司資金支出的很大一部分還來(lái)源于與制藥巨頭合作所獲得的各類款項(xiàng)。
 

Sangamo在納斯達(dá)克敲鐘(來(lái)源:參考資料[7])


發(fā)展至今,Sangamo主要開發(fā)了4個(gè)方面的應(yīng)用,有依托AAV遞送基因的基因療法以及ZFN技術(shù)支撐的細(xì)胞修飾、基因組編輯和基因表達(dá)調(diào)節(jié)。

來(lái)源:Sangamo官網(wǎng)


輝瑞、賽諾菲、渤健等大型制藥公司早就看上了這一寶地,與Sangamo建立了合作關(guān)系。 

表3 與Sangamo建立合作關(guān)系的藥企

信息來(lái)源:Sangamo官網(wǎng)


Sangamo的管線中目前包含多款項(xiàng)目,適應(yīng)證覆蓋腫瘤、神經(jīng)疾病、腸道疾病、單基因遺傳病等領(lǐng)域。據(jù)NextPharma數(shù)據(jù)庫(kù)顯示,有10款項(xiàng)目已經(jīng)進(jìn)入臨床開發(fā)階段。

其中,進(jìn)展最快的1款是與輝瑞合作開發(fā)的用于治療A型血友病患者的SB-525,已進(jìn)入臨床III期。有趣的是,這一項(xiàng)目并沒(méi)有使用Sangamo引以為傲的ZFN技術(shù),而是利用重組腺相關(guān)病毒載體(rAAV)將編碼人凝血因子VIII的轉(zhuǎn)基因和肝臟特異性啟動(dòng)子遞送到患者的肝細(xì)胞核。


表4 Sangamo在研療法

來(lái)源:NextPharma數(shù)據(jù)庫(kù)



魅力何在?

Sangamo已將ZFN應(yīng)用到了眾多疾病領(lǐng)域。舉例來(lái)說(shuō),早在2009年,Sangamo的一項(xiàng)利用ZFN技術(shù)體外編輯患者T細(xì)胞回輸治療艾滋病的療法(SB-728-T)就已進(jìn)入臨床,目前處于臨床II期階段。

根據(jù)3月7日預(yù)印版平臺(tái)bioRxiv的1篇研究論文(未經(jīng)同行評(píng)審),在兩項(xiàng)獨(dú)立的臨床研究中(NCT01044654,NCT01543152),長(zhǎng)期感染HIV的患者在接受ZFN敲除CCR5基因的自體CD4+T細(xì)胞的單次輸注后,體內(nèi)CD4 + T細(xì)胞計(jì)數(shù)持續(xù)增加,T細(xì)胞穩(wěn)態(tài)提高,而且減少了HIV貯存庫(kù)的估計(jì)大小。

CCR5是HIV病毒進(jìn)入人體細(xì)胞的受體,著名的“柏林病人”就是在患急性髓細(xì)胞白血病后接受了攜帶有CCR5基因缺失突變的骨髓移植,從而治愈了自身的艾滋病。

因此,科學(xué)家們渴望利用基因編輯工具復(fù)制“柏林病人“的成功,通過(guò)改造T細(xì)胞來(lái)治療乃至治愈艾滋病。包括Sangamo的這項(xiàng)研究在內(nèi),目前全球還有其它2項(xiàng)以CCR5為靶點(diǎn)的基因編輯療法進(jìn)入臨床。

表5 CCR5基因編輯療法

來(lái)源:NextPharma數(shù)據(jù)庫(kù)


其中的SB-728-T 和AGT103-T使用的是經(jīng)遺傳修飾的患者自體淋巴細(xì)胞,與造血干細(xì)胞移植相比,這種療法的侵襲性更低。

除了基因水平,Sangamo還利用鋅指蛋白系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控。

在3月19日Science Advances發(fā)表的1篇文章中,Sangamo等機(jī)構(gòu)利用鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子(ZFP-TF)系統(tǒng)在轉(zhuǎn)錄水平上成功降低了小鼠tau基因的表達(dá),而且沒(méi)有發(fā)現(xiàn)脫靶效應(yīng)、顯著的組織病理學(xué)改變或分子改變。

ZFP-TF靶向特定的DNA序列,與TF融合可抑制靶基因轉(zhuǎn)錄(來(lái)源:參考資料[9])



向何方?

Edward Lanphier于2015年卸任CEO一職,并于2017年退休,離開了他一手創(chuàng)辦發(fā)展的公司,早期附帶專利加入Sangamo的科學(xué)家們也已悉數(shù)退居幕后。

如今的Sangamo不是一家純粹的基因編輯公司,它也在不斷地拓展新方向。無(wú)論是與賽諾菲合作的CAR-T細(xì)胞療法還是最有可能走向上市的AAV基因療法,都說(shuō)明了Sangamo這家老牌基因療法公司在持續(xù)擁抱新趨勢(shì),或許有朝一日,CRISPR技術(shù)也會(huì)出現(xiàn)在Sangamo的管線中。

Sangamo現(xiàn)任CEO Sandy Macrae博士曾在2017年的一次采訪中表示,決定基因編輯發(fā)展的關(guān)鍵因素是藥物遞送方式的創(chuàng)新。Sangamo當(dāng)前多款療法使用的遞送工具多為AAV載體,它也在開發(fā)自己的遞送平臺(tái)。


結(jié)

無(wú)論是ZFN、CRISPR/Cas9抑或各類堿基編輯工具,它們都代表了基因編輯領(lǐng)域的騰飛,為逆轉(zhuǎn)DNA突變所致的疾病帶來(lái)了巨大的希望。Sangamo只是技術(shù)發(fā)展中一個(gè)十分獨(dú)特的代表。鑒于目前尚無(wú)基因編輯療法上市,這幾項(xiàng)技術(shù)的個(gè)中優(yōu)劣還需要結(jié)合后續(xù)臨床上的更多數(shù)據(jù)去準(zhǔn)確評(píng)價(jià)。而不管哪一種技術(shù)未來(lái)率先為患者所用,都將是人類疾病治療史上的重大進(jìn)步。

參考資料:
[1] Jayu J., Yi-Ching W. Zinc finger proteins in cancer progression. Journal of Biomedical Science (2016)
[2] 上帝的手術(shù)刀:基因編輯簡(jiǎn)史(來(lái)源:王立銘)
[3] X. Bao, S.P. Palecek. Genetic Engineering in Stem Cell Biomanufacturing. Stem Cell Manufacturing (2016)
[4] Miller, J., Holmes, M., Wang, J. et al. An improved zinc-finger nuclease architecture for highly specific genome editing. Nature Biotechnology (2007)
[5] Kevin Davies, Edward Lanphier. Sanguine About Sangamo: An Interview with Edward Lanphier. The CRISPR Journal (2019)
[6] Scott, C. The zinc finger nuclease monopoly. Nature Biotechnology (2005)
[7] Takeda, GSK veteran takes the helm at Sangamo as Lanphier retires(來(lái)源:fiercebiotech)
[8] Infusion of CCR5 Gene-Edited T Cells Allows Immune Reconstitution, HIV Reservoir Decay, and Long-Term Virological Control(來(lái)源:bioRxiv)
[9] Susanne W., Sarah L. D., Bryan Z. et al. Persistent repression of tau in the brain using engineered zinc finger protein transcription factors. Science Advances (2021)
[10] Sangamo公司CEO:基因療法領(lǐng)域真正的騰飛在于給藥方式的創(chuàng)新(來(lái)源:藥明康德)

熱門療法/技術(shù)/靶點(diǎn)

蛋白降解劑 | 基因治療 | NK細(xì)胞療法

CAR-T療法RNA療法 |多特異性抗體
溶瘤病毒  | 抗體偶聯(lián)藥物 | iPSC療法

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