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血液淋巴系統(tǒng)腫瘤融合基因匯總

 e藥安全 2020-12-20

Myelodysplastic(MDS

Myelodysplastic(MDS):MLL-MAML2,MLL-SEPT9PAN3-PSMA2,BCR-JAK2NUP98-HOXD13,NUP98-PSIP1NUP98-NSD,NUP98-HOXA9NUP98-TOP1,NUP98-HOXMN1-ETV6,TEL-SYKNPM-MLF1,ETV6-TEL.

Acute lymphoblastic leukemia(ALL)

Acute lymphocytic leukemia(ALL):BCR-ABL1E2A-PBX1,EBF1?PDGFRBMLL-AF10,MLL-AF1p,MLL-AF1qMLL-AF4,MLL-AF6,MLL-AF9,MLL-ENL,MLL-PTD,SET-CANSIL-TAL1,TEL-ABL1,TEL-AML1,TEL-PDGFRB,TEL-JAK2,TLS-ERG,BCR?JAK2,PAX5?ETV6PAX5?JAK2,PAX5-KIDINS220,TCF3?ZNF384,EP300?ZNF384,TAF15-ZNF384,TCF3?PBX1,CREBBP?ZNF384,ETV6?RUNX1C11orf95-MAML2,MEF2D?BCL9,MEF2D?HNRNPUL1MEF2D?HNRNPH1,KMT2A?AFF1MEF2D-SS18,AIF1L-ETV6,ABL1-AIF1LETV6-ABL1,SFPQ-ABL1,SNX2-ABL1,E2A-HLFCALM-AF10,ZBTB20-JAK2,EML1-ABL.

Chronic lymphoblastic leukemia(CLL)

Chronic lymphoblastic leukaemia(CLL):CXCR4-MAML2,RUNX1-PDCD6,YPEL5-PPP1CB.

Acute myeloid leukemia(AML)

Acute myeloid leukemia(AML):AML1-ETOBCR-ABL1,CBFB-MYH11,DEK-CAN,MLL-AF10MLL-AF17,MLL-AF1q,MLL-AF6,MLL-AF9,MLL-ELLMLL-PTD,NPM1-MLF1NPM1-RARα,NUP98-HOXD13,PLZF-RARα,PML-RARα,SET-CAN,TLS-ERGRUNX1?RUNX1T1,MLL-MAML2RARα-BCOR,KMT2A?ELLETV6-HIC1,NUP98-TOP1NUP98-HOXA9.

Chronic myeloid leukaemia(CML)

Chronic myeloid leukaemia(CML):BCR-ABL1,ETV6-ABL1,TEL-PDGFβRNUP98-HOXA9,NUP98-LEDGF.

Lymphoma

Diffuse large B-cell lymphoma:PDE4A-DNMT1MYC-LOC729991-MEF2B,BCL2L11-CD274,PDCD1LG2-CD274,BCL6-EIF4A2,MYC-TMEM121,APC-NCRNA00202GLRA1-APC,DTWD2-APCPRELID2-APC,ZBTB7A-TCF3,MYD88-VILL,CREBBP-DNASE1DHRSX-CRLF2,IGH-IRF4Follicular lymphoma:BCL6-EIF4A2PAX5-FANCA,ITK-SYK,CTLA4-CD28,BCL2-IGH;Mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma:API2-MAML1,IGH-MALT1,IGH-BCL10,IGH-FOXP1,IGH-BCL10IGH-MAML1;Mantle cell lymphoma:CCND1-IGHBurkitt  lymphoma:MYC-IGH,IGK-MYC,IGL-MYCPeripheral T-cell lymphoma:LPIN1-CD274;Angioimmunoblastic T-cell lymphoma:PUS10-RELAnaplastic large cell lymphoma:NPM-ALK,TPM3-ALKTPM4-ALK,TFG-ALK,ATIC-ALK,CLTC-ALK,MSN-ALK,DUSP22-IRF4.

融合基因變異型淋巴造血系統(tǒng)腫瘤二代測序技術(shù)介紹

分子檢測對合基因變異型淋巴造血系統(tǒng)腫瘤的病理診斷具有重要作用,由于病理結(jié)果直接影響后續(xù)治療方案的選擇。很多臨床臨床試驗(yàn)也要求患者入組前進(jìn)行基因檢測確認(rèn),盡管合基因變異型淋巴造血系統(tǒng)腫瘤的診斷長期以來一直依賴于分子遺傳學(xué)改變,但是融合的檢測技術(shù)的選擇不當(dāng)可能會造成診斷陷阱。傳統(tǒng)FISH檢測對于融合伙伴無法確認(rèn),國際上AMP技術(shù)在淋巴造血系統(tǒng)腫瘤融合方面積累了很多經(jīng)驗(yàn),它的新一代測序技術(shù)PANO-Seq全景測序技術(shù)的全面應(yīng)用為合基因變異型淋巴造血系統(tǒng)腫瘤的檢測更詳細(xì)的診斷信息。

走進(jìn)中國科學(xué)院大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院(浙江省腫瘤醫(yī)院)I期臨床試驗(yàn)病房

2013年,鄭宗立博士在哈佛醫(yī)學(xué)院麻省總醫(yī)院工作期間發(fā)明了腫瘤基因檢測技術(shù)--AMP(錨定多重PCR法)技術(shù),其兼具雜交捕獲法檢測全面精度高和超多重PCR操作簡便靈敏度高的優(yōu)勢,迅速在美國的頂級醫(yī)院麻省總醫(yī)院(綜合排名多年全美第一)得以推廣,成為該醫(yī)院主要的腫瘤分子檢測手段。該發(fā)明于2016年11月獲得美國專利局專利,當(dāng)時率先采用的一些關(guān)鍵技術(shù)(如單分子標(biāo)記除重、多區(qū)域標(biāo)簽等)直至今日仍只有少數(shù)廠家能成熟掌握。

2017年紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心是美國第一個獲批IVD的468基因 DNA NGS產(chǎn)品,而RNA 檢測舍棄自行開發(fā)的MSK-IMPACT(基于雜交法),選擇了 AMP技術(shù)。

2017年,鄭宗立博士帶領(lǐng)的海外歸國團(tuán)隊創(chuàng)立恒特基因公司并開發(fā)了PANO-Seq全景測序是新一代的原創(chuàng)腫瘤測序技術(shù)平臺,性能全面優(yōu)于AMP。

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