雷妮·雷霍·佩拉幾十年來一直在研究胚胎發(fā)育時間對健康和疾病的影響。今年7月干細胞生物學家雷妮·雷霍·佩拉在發(fā)育生物學學會年度會議上向數(shù)百名科學家發(fā)表主旨演講時問道:你知道還有什么比精子和卵子結(jié)合形成人類更吸引人嗎?經(jīng)過數(shù)十年研究,負責生殖細胞的基因和其他信息,產(chǎn)生生殖細胞精心策劃的分子平衡作用,預測胚胎健康的因素——她對生命科學的敬畏只增不減,它讓我想起了大爆炸,這么多條件都必須正確,每一個問題都有答案,但退一步問,這些是怎么發(fā)生的?這有點令人驚訝,我們真的不太清楚。
博科園-科學科普:在她努力闡明更大圖景的過程中,出現(xiàn)了一個共同主題:一些看似簡單的事情,比如胚胎在發(fā)育的最初階段,可能會對健康和疾病產(chǎn)生巨大影響,甚至在孩子出生幾十年后也是如此。最近利用這種洞察力來擴大工作范圍,例如胚胎細胞可能會對神經(jīng)系統(tǒng)疾病如帕金森癥的病因研究做出貢獻。但是今天,佩拉將更多時間投身于一個完全不同的挑戰(zhàn),能把科學帶給大眾嗎?為了做到這一點,她表示我們需要講故事——科學家們自己與工作的故事,那些讓他們變得脆弱、更容易被認同的故事。佩拉說自己的科學之路她從來無法預料,她在威斯康星州小鎮(zhèn)上的一個貧窮家庭中長大,是家里六個孩子中最小的一個,也是家里第一個完成四年學業(yè)的孩子。
干細胞生物學家雷妮·雷霍·佩拉在蒙大拿州州立大學工作,也是研究和經(jīng)濟發(fā)展的副校長,職業(yè)生涯既致力于揭示早期胚胎發(fā)育時間與后來健康之間的密切聯(lián)系,也致力于鼓勵科學家分享他們自己的故事。 圖片:Kristine Paulsen for Quanta Magazine
她的母親扛起家里的重擔,獨自一人養(yǎng)活她和兄弟姐妹,而她的父親在她童年里都在與酗酒和無家可歸作斗爭,父母在佩拉20多歲時去世。她幾乎是無意識地走上了科學的道路,但她后來成為了胚胎干細胞和生育方面的專家,并擔任了斯坦福大學人類胚胎干細胞研究和教育中心的主任。但在2013年,她決定放棄一切,成為蒙大拿州立大學研究和經(jīng)濟發(fā)展副校長,她覺得自己可以在那里對科學教育產(chǎn)生更大的影響?!禥uanta Magazine》最近采訪了佩拉,談到她對時間、細胞命運和健康之間聯(lián)系的探索;逆轉(zhuǎn)錄病毒DNA在早期發(fā)育中所起的驚人作用,她對科學教育的未來充滿希望,為了簡便起見,采訪內(nèi)容被壓縮和編輯過。
1、你在威斯康星州的鐵河小鎮(zhèn)長大,是什么最終讓你走上了科學的道路?
鐵河鎮(zhèn)位于蘇必利爾湖南岸約20英里處,人口約1000人,在我小時候人口或許更少。和美國許多小城鎮(zhèn)一樣,孩子們會走進小學和高中,但在上大學或從事職業(yè)方面,他們沒有太多抱負。我的母親非常疼愛我們,她想盡她最大努力讓我們六個兄弟姐妹過的開心,因此她非常忙碌,也就沒有人跟我談過大學生活。
高中畢業(yè)后,我在福特汽車經(jīng)銷商那里找到了一份簿記員的工作。工作幾個月后,我第一次開始思考我想做什么;而后我獲得金融援助,被威斯康辛州大學的商科專業(yè)招收。在大一和大二的時候,我經(jīng)常想要放棄,因為我并沒有真正意識到這一切將走向何方。然后當我選擇了人類遺傳學課程后,我深深愛上了它,在那之后我開始認真起來。
2、是什么促使你把工作重點放在胚胎發(fā)育和繁殖上?
我個人對這些問題非常感興趣是因為我和姐姐很早就患了卵巢癌,所以我沒有孩子。因此我想了解細胞的命運,來回答這樣的問題:是什么讓卵子和精子能夠讓它們將信息從一代傳遞到下一代,這些模式如何建立?在受精后,為什么下一次細胞分裂通常需要11個小時?難以置信的是,我們對卵子和精子到底是什么知之甚少。我仍然很驚訝精子和卵子結(jié)合在一起可以創(chuàng)造出一個人,這太瘋狂了,不是嗎?
3、我們又知道多少呢?
我們?nèi)蕴幱谝粋€描述性階段,甚至獲取受精和胚胎發(fā)育的視頻圖像都好像來源于近代史。分子事件也是如此,但一直在增加描述類別——比如對遺傳后生標記的研究?,F(xiàn)在通過單細胞分析,可以真正開始探索這些類別。實驗剛剛開始了解哪些基因程序是開是關(guān),以及這些程序在做什么。例如事實證明,人類和小鼠胚胎中一些基本的表觀遺傳程序(如組蛋白修飾和轉(zhuǎn)錄激活)驚人地不同,這使我認為表觀遺傳因素正在決定物種特異性過程。
4、那么,你的工作告訴你人類繁殖的獨特性是什么?
時間是獨一無二的,我們的研究表明,胚胎發(fā)育時間非常精確,是人類特有的,這非常合理,因為它必須與子宮發(fā)育時間相匹配。我們已經(jīng)詳細分析了第一個細胞分裂,第二個細胞分裂,第三個細胞分裂,對胚胎健康意味著什么。這些定時參數(shù)與染色體數(shù)目之間的關(guān)系——太快或太慢與染色體數(shù)目錯誤的胚胎與之明顯相關(guān)。
5、這些定時參數(shù)到底是什么,它們?yōu)槭裁慈绱酥匾?/span>
結(jié)合成像和基因表達測量來觀察胚胎時鐘如何工作,就在卵子和精子融合之后,幾乎沒有轉(zhuǎn)錄(因為胚胎從卵子中提取母RNA來制造基本蛋白質(zhì))。第三天,胚胎基因組打開了,這時轉(zhuǎn)錄的主要波動出現(xiàn)了。也非常想知道是什么程序驅(qū)動了最初三天的準備。根據(jù)我們的研究,它是精確定時的細胞分裂,與表觀遺傳因子協(xié)調(diào),從母體基因表達到胚胎基因表達的轉(zhuǎn)換。時間參數(shù)與前三個細胞分裂有關(guān),在胚胎基因開始表達之前,這對胚胎的生存至關(guān)重要。
佩拉指出了一系列人類胚胎早期細胞分裂的延時視頻,她的研究表明,這些早期細胞的命運部分取決于它們整合進DNA的逆轉(zhuǎn)錄病毒基因的表達。圖片:Kristine Paulsen for Quanta Magazine
首先胚胎中的第一個細胞形成腰部或卵裂溝大約需要30分鐘,發(fā)現(xiàn)這在一定程度上可以作為染色體數(shù)目的度量標準。當時機不對的時候,胚胎出三對染色體的可能性就很大,而不是兩對。它可能開始分裂,在其他染色體周圍形成卵裂溝,或者根本無法分裂。下一個細胞分裂,從2個細胞分裂到3個細胞,需要11個小時,正負4個小時。第二階段的時間確實反映了卵子的成熟程度。最后第四個單元格應(yīng)該在第三個單元格之后不久出現(xiàn)。這反映了前兩個細胞營養(yǎng)如何平均分配:如果其中一個細胞獲得了所有營養(yǎng),它將分裂得更快,而另一個細胞則會落后。
6、但發(fā)育時間不僅對胚胎即時存活很重要,對健康和疾病也很重要,對吧?
是的,這是我們最大的假設(shè)之一,因為時間在決定細胞命運中扮演著重要角色。這個想法始于一個特定時間軸,如果一個細胞不能按時到達某個階段,它的細胞命運就會改變,通常會被組織拋棄,然后走向死亡。例如2016年發(fā)表在《自然遺傳學》上的一篇論文中,我們發(fā)現(xiàn)了近150種新基因,其中許多是逆轉(zhuǎn)錄病毒,它們在人類干細胞中很早就表達出來了。然后,當關(guān)閉一些逆轉(zhuǎn)錄病毒基因時發(fā)現(xiàn)它改變了細胞命運。
胚胎干細胞最終會生成胎兒,而不是胚胎干細胞,細胞只能生成滋養(yǎng)外胚層,滋養(yǎng)外胚層會生成將胚胎附著到子宮上的組織。滋養(yǎng)外胚層由“壞”細胞組成,而這些細胞不會成為胎兒的一部分。這就意味著,胚胎發(fā)育的時間可以決定哪些細胞會成為胚胎的一部分。哪些細胞是胚胎外組織的一部分取決于我們從逆轉(zhuǎn)錄病毒整合中繼承的人類特有的序列。
7、DNA病毒在早期發(fā)育過程中竟然扮演如此重要的角色
在進化過程中,病毒一直存在于我們體內(nèi),并且不斷改變著我們。我們與斯坦福大學喬安娜·維索卡在《自然》上發(fā)表了另一篇論文指出,這些病毒序列還有第二效應(yīng):它們不僅會導致細胞死亡,還會幫助胚胎擺脫病毒感染。在這兩種情況下,似乎我們在開發(fā)早期就有了一個基于病毒的清理系統(tǒng)。
8、你也在研究確定細胞是否會變成生殖細胞的因素,那里扮演著什么角色呢?
今年4月份發(fā)表在《自然細胞生物學》上的一篇論文中,我們發(fā)現(xiàn)了三種相互作用的蛋白質(zhì),它們幫助形成原始生殖細胞并維持原始生殖細胞的命運。OCT4蛋白是胚胎發(fā)育和細胞命運的主要調(diào)控因子之一。但是如果兩個細胞都表達OCT4,你如何判斷胚胎細胞是否會形成原始生殖細胞?我們認為OCT4可以與不同的合作伙伴以特定的方式進行活動,從而產(chǎn)生胚胎。這就是細胞的決定,你可以把它想象成一個支點:干細胞位于中間,如果OCT4和其他蛋白質(zhì)發(fā)生協(xié)同作用,這個支點就會向生殖線傾斜。
如果其中一種蛋白質(zhì)含量不正確,這些細胞反而會變成外胚層,胚胎組織通常會產(chǎn)生神經(jīng)元,這個平衡非常微妙。我們現(xiàn)在開始分析每一種蛋白質(zhì)在胚胎和生殖細胞發(fā)育中的實際功能,以及其他轉(zhuǎn)錄因子如何參與其中?;氐侥愕膯栴}疾病和發(fā)育如何相關(guān):在發(fā)育過程中,必須有一個錯誤率決定這些細胞命運,得到的原始生殖細胞數(shù)量或多個神經(jīng)元取決于這個軸的工作,比如說第十周的胎兒,我們真不知道錯誤率會引發(fā)什么后果。
9、可以舉個例子嗎?
一般來說,如果A型細胞必須在B型細胞形成之前形成,但A型細胞數(shù)量太少,那么這就會對B型細胞的形成和數(shù)量產(chǎn)生連鎖反應(yīng)。例如在神經(jīng)元發(fā)育之前,必須先有一層基底細胞。在帕金森氏癥疾病中,病人產(chǎn)生多巴胺的神經(jīng)元減少了大約7.5萬個。你可以想象這種損失的發(fā)生有兩個原因:或許是因為一開始他們的神經(jīng)元就比常人少,又或者他們以更快的速度失去了特定種類的神經(jīng)元。日常人們接觸一些殺蟲劑和化學物質(zhì)會導致后者的發(fā)生,但我們?nèi)匀徊恢琅两鹕习Y是否與多巴胺分泌較少的神經(jīng)元自然遺傳有關(guān)。
這是我研究了一段時間的一個假設(shè):基因構(gòu)成不僅通過環(huán)境線索與疾病聯(lián)系在一起,還因為在出生時就被賦予了一定的細胞數(shù)量,早期發(fā)育可以影響許多年后發(fā)生的事情。例如更年期也有類似現(xiàn)象,在某些情況下,女性出生時的卵母細胞較少,并且會經(jīng)歷卵巢早衰。神經(jīng)學方面也有其他例子,特別是老鼠身上。但是在人類疾病中起作用的部分還沒有被深入研究,這就是為什么我們現(xiàn)在要研究帕金森癥是否會發(fā)生這種情況。
10、2013年你放棄了斯坦福大學董事職位,前往蒙大拿州工作,部分原因是你希望在科學教育領(lǐng)域發(fā)揮更大的影響力,這是為什么呢?
我認為大多數(shù)美國人對科學或科學研究并不是很感興趣。然而,在斯坦福大學的學生中,情況并非如此。作為美國科學家,我們面臨的問題是沒有讓學生相信科學。在像蒙大拿州立大學這樣的大型公立大學里,我們試圖說服學生,以及學生的家長,因為他們不一定接觸到科學的重要性。
當我還是個小女孩的時候,我和媽媽坐在一起,等著看人們登上月球。我們花了整整一周的時間做食物,準備坐下來觀看降落。在科學實驗室里每天都有同樣偉大的事情發(fā)生,但卻沒有人在意。也許在社會里,我們已經(jīng)對科學變得麻木了。實際上,這是如此令人興奮。作為一個國家,如果我們投資于科學、知識和認知,我們將會收獲很多。不過我并不責怪公眾不理解科學,甚至立法者有時也不愿投資。
11、科學教育缺少了什么?我們?nèi)绾谓鉀Q這個問題?
我認為科學家本身就是故事的一個重要組成部分,他們是誰可以幫助以一種有效的方式描繪科學。公眾會像我一樣對我學習的監(jiān)管網(wǎng)絡(luò)感到興奮嗎?或許了解的人會。但我認為讓那些并不了解科技的人感興趣就是我的故事與工作:我是六個孩子中最小的一個,我的母親甚至沒有高中畢業(yè)。我最終坐在了斯坦福大學的領(lǐng)導席位上,主導著我認為偉大的生活。我并不特別,我只是想依靠科學謀生。我的故事并沒有表明科學,無論多么基礎(chǔ),都是關(guān)于你,關(guān)于你的家庭,關(guān)于我,關(guān)于我們的旅程。我在這樣一個地方長大,你整個冬天都坐在那里講故事,然后在夏天散去;結(jié)果第二年冬天又回來講同樣的故事,也許還會多講一些。
博科園-科學科普|參考期刊文獻:《Natural genetics》《Nature》
文:Jordana Cepelewicz/Quanta magazine/Quanta Newsletter
DOI:10.1038/ng.3449
DOI:doi.org/10.1038/s41556-018-0094-3
DOI:10.1038/nature14308
博科園-傳遞宇宙科學之美