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計(jì)算重合元素—— 韋恩圖走起

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-04-02

     在茫茫的科研生涯里,總是有很多時(shí)候需要找重合的元素,你是不是還在頭痛導(dǎo)師給你了好幾個(gè)數(shù)百個(gè)基因/元素的表格,讓你把重合的元素找出來? 你是不是也在糾結(jié)自己得到的結(jié)果,與文獻(xiàn)中報(bào)道的結(jié)果到底有多少重復(fù)?一個(gè)一個(gè)的看,眼都看花了還容易出錯(cuò),問題是時(shí)間啊,大把大把的時(shí)間都用來數(shù)數(shù)了,我都懷疑自己讀了一個(gè)假博士T_T~~~用excel的match函數(shù)? 斯以為還是耗時(shí)又麻煩,如果碰到基因數(shù)目太多的時(shí)候,會(huì)卡死電腦ORZ~~~

       今天跟大家安利兩個(gè)網(wǎng)站,Venny 和BEG Calculate and draw custom Venn diagrams 幫你輕松搞定如上困境。

Venny

     Venny(http://bioinfogp.cnb./tools/venny/ )是由Juan Carlos Oliveros發(fā)布的一個(gè)在線的Venn圖制作工具,支持4個(gè)以內(nèi)的列表的比較,可以快速的給出圖片結(jié)果,只需要將你要比較的list復(fù)制-粘貼到對(duì)應(yīng)的方框里面,修改list名稱,還可以查看overlap的元素。另外,Venny支持三種不同的表現(xiàn)形式,喜歡彩色或者黑白任你選擇。示例如下:

圖1 網(wǎng)站頁面

圖2 分析實(shí)例

      而如果你要比較的list比較多,大于4個(gè),Venny可能就無能無力了,這時(shí)候BEG Calculate and draw custom Venn diagrams的優(yōu)勢(shì)就顯出來了。

BEG Calculate & draw custom Venn diagrams

(http://bioinformatics.psb./webtools/Venn/)

圖3 網(wǎng)站首頁

       該網(wǎng)站最多給出5組比較的結(jié)果,但是可以通過Add Another List增加list數(shù)目,就可以比較數(shù)十種list的overlap,表格的結(jié)果。結(jié)果示例如下

怎么樣,你學(xué)會(huì)了嗎?

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