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SPSS操作:多個(gè)相關(guān)樣本的非參數(shù)檢驗(yàn)(Cochran''''s Q檢驗(yàn))

 醫(yī)學(xué)院的石頭 2018-04-04

一、問題與數(shù)據(jù)

某康復(fù)科醫(yī)生擬評價(jià)康復(fù)訓(xùn)練對卒中后患者體能恢復(fù)的效果?;颊叻謩e在開始康復(fù)、康復(fù)3個(gè)月和康復(fù)6個(gè)月時(shí)進(jìn)行體能測試。為了保證一致性,三次體能測試內(nèi)容是一樣的,體能測試的結(jié)果為“通過”和“不通過”。該醫(yī)生想知道卒中后患者體能測試的結(jié)果為“通過”的比例是否一直上升


該研究隨機(jī)選取了63例進(jìn)行康復(fù)訓(xùn)練的卒中后患者,并收集了所有研究對象的開始康復(fù)時(shí)的體能測試結(jié)果 (initial_fitness_test),康復(fù)3個(gè)月時(shí)的體能測試結(jié)果 (month3_fitness_test)和康復(fù)6個(gè)月時(shí)的體能測試結(jié)果 (final_fitness_test)。結(jié)果均為“通過(Passed)”和“不通過(Failed)”的形式(分別賦值為1和2)。部分?jǐn)?shù)據(jù)如下圖。


其中,Individual scores for each paticipant列出了每一個(gè)研究對象的情況,而Total count data (frequencies)則是對相同情況研究對象的數(shù)據(jù)進(jìn)行了匯總。

二、對問題的分析

檢驗(yàn)三組或多組相關(guān)樣本中,分類變量是否存在差異,可以使用Cochran's Q 檢驗(yàn),但需要考慮以下4個(gè)假設(shè)。


假設(shè)1結(jié)局變量為二分類,且兩類之間互斥?;コ馐侵敢粋€(gè)研究對象只能在一個(gè)分組中,不可能同時(shí)出現(xiàn)在兩個(gè)組中。例如 “安全”和“不安全”,“及格”和“不及格”等。(當(dāng)變量為連續(xù)變量或有序分類變量時(shí),可參考醫(yī)咖會(huì)之前推送過的Friedman檢驗(yàn)


假設(shè)2:分組變量包含3個(gè)及以上分類,且各組之間相關(guān)。(當(dāng)分組變量只有2個(gè)分類時(shí),可使用McNemar’s檢驗(yàn)


假設(shè)3:樣本是來自于研究人群的隨機(jī)樣本。然而實(shí)際中,樣本并非都是隨機(jī)樣本。


假設(shè)4:樣本量足夠。當(dāng)樣本量n≥4且nk≥24(k為分組變量數(shù))時(shí),可以采用Cochran's Q檢驗(yàn);否則采用“精確” Cochran's Q檢驗(yàn)。


本研究中,結(jié)局變量有兩個(gè)分組且互斥(“通過”和“不通過”),符合假設(shè)1;分組變量包含3個(gè)分類(開始康復(fù)、康復(fù)3個(gè)月和康復(fù)6個(gè)月時(shí)),各組之間相關(guān),符合假設(shè)2;研究對象是隨機(jī)選取,符合假設(shè)3。


那么應(yīng)該如何檢驗(yàn)假設(shè)4,并進(jìn)行比較呢?

三、SPSS操作

3.1 檢驗(yàn)假設(shè)4:樣本量足夠


1. 轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)格式


如果原始數(shù)據(jù)格式是Total count data (frequencies),則可以跳過此步。如果原始數(shù)據(jù)格式是Individual scores for each paticipant,則需要將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成Total count data (frequencies)格式。


在主界面點(diǎn)擊Data→Aggregate,出現(xiàn)Aggregate Data對話框。將變量initial_fitness_test、month3_fitness_test和final_fitness_test選入Break Variable(s)框中。


點(diǎn)擊下方Number of cases框,并在Name框中填入“freq”。在Save下方勾選Create a new dataset containing only the aggregated variables,并在Dataset name框中填入新數(shù)據(jù)集的名字(例如“cochran_q_freq”)。

 


點(diǎn)擊OK,產(chǎn)生新數(shù)據(jù)集。在新數(shù)據(jù)集中,可以看到新變量“freq”,代表每一種自變量組合的頻數(shù)。

 


2. 數(shù)據(jù)加權(quán)


使用Total count data (frequencies)格式數(shù)據(jù),并在主界面點(diǎn)擊Data→Weight Cases,彈出Weight Cases對話框后,點(diǎn)擊Weight cases by,激活Frequency Variable窗口。將freq變量放入Frequency Variable欄,點(diǎn)擊OK。


 

3. 計(jì)算樣本量


本研究的總樣本數(shù)N=63,但計(jì)算Cochran's Q 檢驗(yàn)的樣本量時(shí),需要減去三次測試結(jié)果都一致的樣本數(shù)。如下突出顯示所示,全部為“Failed”有20例,全部為“Passed”有7例,所以三次測試結(jié)果都一致的樣本數(shù)為20+7=27,Cochran's Q 檢驗(yàn)的樣本量n=63-27=36。



其次,需要確定nk的大小。由于本研究共有三個(gè)分組,所以k=3,nk=36*3=108。


綜上,n≥4且nk≥24,符合假設(shè)4


3.2 計(jì)算比例


在主界面點(diǎn)擊Descriptive Statistics→Frequencies,在Frequencies對話框中,將變量initial_fitness_test、month3_fitness_test和final_fitness_test選入Variable(s):框中,點(diǎn)擊OK。

 


3.3 符合假設(shè)4的Cochran's Q檢驗(yàn)


在主界面點(diǎn)擊Analyze→Nonparametric Tests→Related Samples,出現(xiàn)Nonparametric Tests: Two or More Related Samples對話框。確認(rèn)在What is your objective?區(qū)域勾選了Automatically compare observed data to hypothesized。

 


點(diǎn)擊Fields,將變量initial_fitness_test、month3_fitness_test和final_fitness_test選入Test Fields框中。

 


點(diǎn)擊Settings→Customize tests,勾選Cochran's Q (k samples)。

 


點(diǎn)擊Define Success,在Cochran's Q: Define Success對話框中,點(diǎn)擊Combine values into success category,在Success框中填入1(這里是“成功”對應(yīng)的編碼,本例中即為通過體能測試,“Passed”對應(yīng)的是1,所以這里填“1”)。

 


點(diǎn)擊OK→Run,輸出結(jié)果。


3.4 不符合假設(shè)4的“精確”Cochran's Q檢驗(yàn)


當(dāng)不符合假設(shè)4時(shí),需要使用“精確”Cochran's Q檢驗(yàn)。在主界面點(diǎn)擊Analyze→Nonparametric Tests→Legacy Dialogs→K Related Samples,出現(xiàn)Tests for Several Related Samples對話框。


將變量initial_fitness_test、month3_fitness_test和final_fitness_test選入Test Variables框中。在Test Type 下方去掉Friedman,然后勾選Cochran's Q。(如果數(shù)據(jù)符合假設(shè)4,則此時(shí)點(diǎn)擊OK,結(jié)果與3.3部分的操作結(jié)果一致)

 


點(diǎn)擊Exact,在Exact Tests對話框中,點(diǎn)擊Exact,點(diǎn)擊Continue→OK。


 

3.5 “精確”Cochran's Q檢驗(yàn)后的兩兩比較


對于符合假設(shè)4的Cochran's Q檢驗(yàn)(3.3部分),事后的兩兩比較將在結(jié)果解釋部分展示(4.2部分)。


對于不符合假設(shè)4的“精確”Cochran's Q檢驗(yàn)(3.4部分)事后的兩兩比較,可采用經(jīng)Bonferroni法校正的多重McNemar檢驗(yàn)。


在主界面點(diǎn)擊Analyze→Nonparametric Tests→Legacy Dialogs→2 Related Samples。在Two-Related-Samples Tests對話框中,依次選擇兩兩比較的變量,分別將變量initial_fitness_test和month3_fitness_test、變量initial_fitness_test和final_fitness_test、變量month3_fitness_test和final_fitness_test選入右側(cè)Test Pairs中。 去掉Test Type下方的Wilcoxon,勾選McNemar。

 


點(diǎn)擊Exact,在Exact Tests對話框中,點(diǎn)擊Exact,點(diǎn)擊Continue→OK。


四、結(jié)果解釋

4.1 統(tǒng)計(jì)描述


3.2部分的操作后,得到的頻數(shù)結(jié)果見下圖。康復(fù)開始、康復(fù)3個(gè)月和康復(fù)6個(gè)月時(shí)培的體能測試的通過率分別為22.2%、44.4% 和 60.3%。



4.2 符合假設(shè)4的Cochran's Q檢驗(yàn)及事后兩兩比較


3.3部分的操作后,得到Cochran's Q檢驗(yàn)的結(jié)果如下圖。



上圖中,第一列(Null Hypothesis)是本研究的零假設(shè)。第二列(Test)顯示本研究的假設(shè)檢驗(yàn)方法,即Cochran's Q檢驗(yàn)。第三列(Sig.)是假設(shè)檢驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,即P值。第四列(Decision)是根據(jù)假設(shè)檢驗(yàn)做出的判斷,即判斷是否拒絕零假設(shè)。


本研究Cochran's Q檢驗(yàn)的P<>


雙擊該表,SPSS會(huì)自動(dòng)彈出Model Viewer界面,幫助我們進(jìn)一步了解Hypothesis Test Summary表的結(jié)果。

 


Cochran's Q檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量服從自由度為k-1的 χ2分布。本研究的統(tǒng)計(jì)量為24.222,此時(shí)統(tǒng)計(jì)量可記為 χ= 24.222, P<>


在該視圖下方的View的下拉選項(xiàng)框中,選擇“Pairwise Comparisons”,可以得到兩兩比較的結(jié)果。兩兩比較的方法為Dunn’s檢驗(yàn)(經(jīng)Bonferroni法校正)。


在Pairwise Comparisons圖中(此處略),連接線代表兩兩比較的結(jié)果,黑色連接線代表兩組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,橘黃色連接線代表兩組差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。


下方的表格(如下圖)給出了更多的信息:比較的組別、統(tǒng)計(jì)量、標(biāo)準(zhǔn)誤、標(biāo)準(zhǔn)化的統(tǒng)計(jì)量(=統(tǒng)計(jì)量/標(biāo)準(zhǔn)誤)、P值和調(diào)整后的P值。


 

由于是事后的兩兩比較(Post hoc test),因此需要調(diào)整顯著性水平(調(diào)整α水平),作為判斷兩兩比較的顯著性水平。依據(jù)Bonferroni法,調(diào)整α水平=原α水平÷比較次數(shù)。本研究共比較了3次,調(diào)整α水平=0.05÷3=0.0167。因此,最終得到的P值(上圖中Sig.一列),需要和0.0167比較,小于0.0167則認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。


另外,SPSS也提供了調(diào)整后P值(上圖中Adj. Sig.一列),其思想還是采用Bonferroni法調(diào)整α水平。該列是將原始P值乘以比較次數(shù)得到,因此可以直接和0.05比較,小于0.05則認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。


以上結(jié)果可以描述為:康復(fù)開始和康復(fù)3個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(調(diào)整后P=0.013),康復(fù)開始和康復(fù)6個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(調(diào)整后P<>


4.3 不符合假設(shè)4的“精確”Cochran's Q檢驗(yàn)


3.4部分的操作中,既可以得到Cochran's Q檢驗(yàn)的結(jié)果,也可以得到“精確”Cochran's Q檢驗(yàn)的結(jié)果(取決于是否選擇Exact選項(xiàng))。


結(jié)果如下圖。在Test Statistics表格中,左側(cè)是Cochran's Q檢驗(yàn)結(jié)果,右側(cè)是“精確”Cochran's Q檢驗(yàn)結(jié)果。



如果數(shù)據(jù)符合假設(shè)4,則Cochran's Q檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量服從自由度為k-1的 χ2分布。左側(cè)表格中的P值為“Asymp. Sig.”所對應(yīng)的“0.000”,即P<>χ= 24.222,P<>


如果數(shù)據(jù)不符合假設(shè)4,則右側(cè)表格中的P值為“Exact. Sig.”所對應(yīng)的“0.000”,即P<0.001。本研究的統(tǒng)計(jì)量為24.222,此時(shí)統(tǒng)計(jì)量可記為cochran's q="24.222,"><>


4.4 “精確”Cochran's Q檢驗(yàn)后的兩兩比較


當(dāng)不滿足假設(shè)4時(shí),3.5部分的操作可得到經(jīng)Bonferroni法校正的多重McNemar檢驗(yàn)的結(jié)果。



由于是事后的兩兩比較(Post hoc test),因此需要調(diào)整顯著性水平(調(diào)整α水平),作為判斷兩兩比較的顯著性水平。依據(jù)Bonferroni法,調(diào)整α水平=原α水平÷比較次數(shù)。本研究共比較了3次,調(diào)整α水平=0.05÷3=0.0167。因此,最終得到的P值(上圖中Exact Sig. (2-tailed)一行),需要和0.0167比較,小于0.0167則認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。


以上結(jié)果可以描述為:康復(fù)開始和康復(fù)3個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.007),康復(fù)開始和康復(fù)6個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<>

五、撰寫結(jié)論

1. 符合假設(shè)4時(shí)(即樣本量足夠)


開始康復(fù)、康復(fù)3個(gè)月和康復(fù)6個(gè)月時(shí),卒中后患者體能測試的通過率分別為22.2%、44.4%和60.3%。運(yùn)用Cochran's Q 檢驗(yàn)對三個(gè)時(shí)間點(diǎn)體能測試通過率進(jìn)行檢驗(yàn),三個(gè)時(shí)間點(diǎn)通過率的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,χ= 24.222, P<>


采用Dunn’s檢驗(yàn)(經(jīng)Bonferroni法校正)進(jìn)行事后的兩兩比較,康復(fù)開始和康復(fù)3個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(調(diào)整后P=0.013),康復(fù)開始和康復(fù)6個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(調(diào)整后P<>


2. 不符合假設(shè)4時(shí)


開始康復(fù)、康復(fù)3個(gè)月和康復(fù)6個(gè)月時(shí),卒中后患者體能測試的通過率分別為22.2%、44.4%和60.3%。運(yùn)用Cochran's Q 檢驗(yàn)對三個(gè)時(shí)間點(diǎn)體能測試通過率進(jìn)行檢驗(yàn),三個(gè)時(shí)間點(diǎn)通過率的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義, Cochran's Q = 24.222, P<>


運(yùn)用“精確”McNemar’s檢驗(yàn)進(jìn)行事后的兩兩比較(經(jīng)Bonferroni法校正的α=0.0167)。康復(fù)開始和康復(fù)3個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.007),康復(fù)開始和康復(fù)6個(gè)月時(shí)研究對象體能測試結(jié)果的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<>


(如果想使用文中數(shù)據(jù)進(jìn)行練習(xí),請使用電腦打開以下網(wǎng)址:

http://www./method_article_detail/219/

點(diǎn)擊左側(cè)“數(shù)據(jù)下載”免費(fèi)下載原始數(shù)據(jù))


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