自然界中原本就存在抗菌藥成分和耐藥菌。目前，環(huán)境中抗菌藥增加導(dǎo)致耐藥菌產(chǎn)生的情況是存在的，但是尚無法建立起細菌耐藥性與環(huán)境中低水平抗菌藥之間的相應(yīng)關(guān)系。人們擔(dān)心的“是一種風(fēng)險，而不是損害事實”。

細菌耐藥性監(jiān)測是國際上應(yīng)對耐藥性問題的一個普遍做法。耐藥性監(jiān)測的重點領(lǐng)域是醫(yī)療機構(gòu)、養(yǎng)殖業(yè)和食品。我國國家食品藥品監(jiān)督管理總局、衛(wèi)生與計劃生育委員會、農(nóng)業(yè)部分別在2005年和2008年，已經(jīng)建立了國家細菌耐藥監(jiān)測網(wǎng)和國家動物源性細菌耐藥性監(jiān)測，為風(fēng)險監(jiān)測和風(fēng)險評估提供依據(jù)。

細菌耐藥性是一種自然進化現(xiàn)象。自然界中細菌檢測到耐藥基因的情形比較常見，甚至沒有接觸到抗菌藥的細菌也會發(fā)現(xiàn)耐藥基因。具有耐藥基因的細菌是否對人類以及動物健康造成危害或者帶來治療上的困難，需要進行科學(xué)的風(fēng)險評估。

抗菌藥的耐藥性問題在審批過程中涉及到以下內(nèi)容：

（1）微生物敏感性試驗資料及文獻資料：是指申請的獸藥為抗感染藥物或抗球蟲藥物時，必須提供抗微生物或抗寄生蟲藥物對歷史和現(xiàn)行臨床分離的細菌和寄生蟲的敏感性比較研究。

（2）用于動物微生物或寄生蟲感染的藥物還應(yīng)提供殘留物對人腸道菌群叢的潛在作用，評價對食品加工業(yè)的影響。

抗菌藥的審批原則包括：抗菌藥應(yīng)做到人獸有別，即用于食品動物的抗菌藥應(yīng)為獸醫(yī)專用藥；人用抗菌藥不可用于食品動物，只能用于寵物。

2008年起，每年農(nóng)業(yè)部頒布實施《動物源細菌耐藥性監(jiān)測計劃》。農(nóng)業(yè)部負責(zé)全國動物源細菌耐藥性監(jiān)測的工作組織實施。各相關(guān)省、市獸醫(yī)行政管理部門按照《動物源細菌耐藥性監(jiān)測計劃》負責(zé)本轄區(qū)動物源細菌耐藥性監(jiān)測的組織實施工作。

中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所負責(zé)全國動物源細菌耐藥性技術(shù)指導(dǎo)、數(shù)據(jù)庫建設(shè)等相關(guān)工作。中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所、遼寧省獸藥飼料畜產(chǎn)品質(zhì)量安全檢測中心、上海市獸藥飼料檢測所、四川省獸藥監(jiān)察所、廣東省獸藥飼料質(zhì)量檢驗所、河南省獸藥監(jiān)察所、中國動物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心和中國動物疫病預(yù)防控制中心等8家檢測機構(gòu)為監(jiān)測任務(wù)承擔(dān)單位。

承擔(dān)單位按照《動物源細菌耐藥性檢測采樣、檢測技術(shù)要點》的要求進行采樣、細菌分離和鑒定、耐藥性檢測和結(jié)果上報。樣品應(yīng)從畜禽養(yǎng)殖場、屠宰廠、孵化場抽取，同時進行養(yǎng)殖場用藥情況和飼料來源調(diào)查，并填寫記錄。大腸桿菌、腸球菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌和空腸彎曲桿菌的分離和鑒定，按照《動物源細菌分離和鑒定方法》或參照相關(guān)國際標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行。采樣信息和耐藥性檢測數(shù)據(jù)被錄入動物源細菌耐藥性監(jiān)測數(shù)據(jù)庫，進行統(tǒng)計分析。