過去十年中，NGS技術(shù)的快速發(fā)展促使DNA測序變得越來越快捷，價格越來越低廉。NGS技術(shù)如今已經(jīng)迅速被廣泛用于常規(guī)臨床實踐中，包括實體瘤、惡性血液病、遺傳病和傳染病的分析以及無創(chuàng)產(chǎn)前診斷（NIPT）、胚胎植入前遺傳學(xué)診斷（PGD）和植入前遺傳學(xué)篩查（PGS）。

考慮到NGS技術(shù)在臨床中越來越廣泛的應(yīng)用，中國國家食品藥品監(jiān)督管理總局（CFDA）和國家衛(wèi)生和計劃生育委員會（NHFPC）于2014年停止了臨床NGS試驗[1]，并發(fā)布了一系列針對NGS的監(jiān)管要求。

CFDA要求NGS商業(yè)診斷系統(tǒng)的所有組件都需要經(jīng)過許可才能用于臨床，包括試劑、儀器和打包賣給實驗室的軟件。CFDA首個批準(zhǔn)的診斷產(chǎn)品是華大基因生產(chǎn)的測序儀BGISEQ-1000 和BGISEQ-100，以及用于胎兒染色體異常（21三體、18三體、13三體）的診斷試劑盒，這些產(chǎn)品中使用了半導(dǎo)體測序和連接探針-錨定測序（joint probe-anchor sequencing）[2]。NIPT成為了中國應(yīng)用最廣泛的NGS檢測之一，隨后多個臨床驗證研究證實了NIPT的高靈敏性、特異性和陰性預(yù)測值。到目前為止，CFDA已經(jīng)批準(zhǔn)了5種NGS儀器：華大基因的BGISEQ-100（基于Life Technologie公司的Ion Torrent測序儀）、BGISEQ-1000（基于Complete Genomics的測序技術(shù)）、貝瑞和康的NextSeq CN500、達安基因的DA8600（基于Life Technologie公司的測序儀）和博奧生物的BioelectronSeq 4000（基于Life Technologie公司的測序儀），以及這些儀器配套的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測。但是目前還沒有獲批開發(fā)用于其他臨床領(lǐng)域的商業(yè)化NGS產(chǎn)品，例如腫瘤相關(guān)遺傳突變、遺傳評估和PGD/PGS，這些產(chǎn)品目前都處于審批階段。 

NHFPC在2014年4月宣布了臨床試點項目，向NGS實驗室授予許可資質(zhì)。到目前為止已經(jīng)有9家實驗室獲批進行NIPT檢測，6家獲批進行PGD/PGS檢測，26家獲批進行腫瘤檢測，18家獲批進行遺傳病檢測。試點實驗室必須依據(jù)NHFPC監(jiān)管文件《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴增檢驗實驗室管理辦法》獲得政府認(rèn)證，實驗室中利用NGS技術(shù)的臨床檢測必須依照相應(yīng)條例執(zhí)行。實驗室必須建立一個標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行流程（SOP），遵守所有的質(zhì)控（QC）標(biāo)準(zhǔn)，并對每個檢測的性能進行記錄。按照SOP和QC標(biāo)準(zhǔn)，NGS流程應(yīng)該在每個實驗室中達到預(yù)期運行特性。內(nèi)部質(zhì)控和外部質(zhì)量評估（EQA）對于實驗室評估NGS結(jié)果也是必不可少的。

為了評估提供NGS檢測的實驗室的能力，中國衛(wèi)生部臨床檢驗中心（NCCL）在2014年推出了一次針對21、18、13三體綜合征測序檢測的試點外部質(zhì)量評估（EQA）。結(jié)果表明大多數(shù)參與的實驗室都使用CFDA批準(zhǔn)的試劑，并能提供可靠的NIPT檢測[3]。2015年，NCCL啟動了一項全國范圍的試點EQA，評估 NGS技術(shù)在體細胞突變檢測方面的有效性。參與單位包括26所獲得政府許可進行腫瘤NGS診斷的實驗室，以及仍在申請NGS檢測許可的實驗室。參與者提供的所有檢測都是實驗室開發(fā)的檢測。在64個實驗室中，51.6%（33/64）的實驗室檢測結(jié)果達標(biāo)，但是僅26.6%（17/64）的實驗室能正確識別NCCL panle中DNA樣本的所有突變[4]。結(jié)果表明，實驗室在利用NGS技術(shù)檢測腫瘤中體細胞突變方面的能力急需加強，這個情況也有可能是檢測過程較為復(fù)雜造成的。

利用NGS技術(shù)，臨床實驗室科研可以使用疾病靶基因panel、外顯子組測序和全基因組測序進行分析。NGS檢測與傳統(tǒng)的分子檢測技術(shù)截然不同，這也為監(jiān)管方面帶來了挑戰(zhàn)。

對CFDA而言，NGS檢測需要新方法來確保分析和臨床有效性。第一，對于傳統(tǒng)檢測方法來說，只能檢測單個或一定量的因素，而NGS檢測可以鑒定出人類基因組中大量變異，但是無法對每個疑似變異進行驗證分析。第二，NGS檢測可以識別具有臨床意義的變異以及意義未明的變異，因此每一個變異的臨床驗證要求各不相同。第三，NGS檢測的預(yù)期用途是針對特定病人群體、藥物或疾病。然而根據(jù)美國國家癌癥研究所的MATCH項目，用于治療的試劑的選擇應(yīng)該基于靶向NGS分析所得到的具體分子發(fā)現(xiàn)，而不是依賴于癌癥類型進行選擇[5]。隨著臨床研究的快速發(fā)展，因此，針對那些擴增獲批試劑的預(yù)期用途的應(yīng)用，CFDA必須重新考慮其審批流程。

NGS技術(shù)的出現(xiàn)還給NHFPC帶來了挑戰(zhàn)。雖然試點實驗室需要依據(jù)《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴增檢驗實驗室管理辦法》進行NGS檢測，但是NGS臨床檢測比傳統(tǒng)分子檢測更復(fù)雜，因此需要開發(fā)新的監(jiān)管標(biāo)準(zhǔn)對提供NGS檢測的實驗室進行監(jiān)管。近年來，美國疾病預(yù)防與控制中心[6]、美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)會[7]和美國病理學(xué)家學(xué)會[8]已經(jīng)制定了用于NGS方法的有效驗證、分析過程監(jiān)控和變異報告的指南。然而，對實驗室而言將這些要求轉(zhuǎn)變成常規(guī)操作仍然是一個挑戰(zhàn)。

總而言之，中國政府已經(jīng)啟動了NGS臨床檢測的監(jiān)管工作，也在盡最大努力使NGS診斷檢測標(biāo)準(zhǔn)化。在確保安全和有效性的同時尋求合適的方法，保證該領(lǐng)域的創(chuàng)新性，支持精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展和進步。 

參考文獻

1. China Food and Drug Administration, “The Notice of the China Food and Drug Administration and the National Health and Family Planning Commission on the Inspection of Sequencing Diagnostic Tests”; available at www.sda.gov.cn/WS01/CL1105/96853.html (in Chinese).

2. China Food and Drug Administration, “Approval of NextGeneration Sequencing Diagnostic Tests”; available at www .sda.gov.cn/WS01/CL1103/102239.html (in Chinese).

3. R. Zhang et al., J. Mol. Diagn.18, 244–252 (2016).

4. R. Zhang et al., Oncotarget 36, 58500–58515 (2016).

5. J. Abrams et al. Am. Soc. Clin. Oncol. Educ. Book 34, 71–76  (2014).

6. A. S. Gargis et al., Nat. Biotechnol. 30, 1033–1036 (2012).

7. H. L. Rehm et al., Genet. Med. 15, 733–747 (2013).

8. N. Aziz et al., Arch. Pathol. Lab. Med. 139, 481–493 (2015).