一、 關于Trizol Reagent需要的試劑
1. Chloroform:氯仿(分析純) 2. Isoproplyl alcohol:異丙醇(分析純) 3. 75% Ethanol(in DEPC-treated water):75%乙醇。要求用分析純無水乙醇并用0.01%的DEPC處理過的無Rnase的水稀釋。 4. RNase-free water:無Rnase的水。方法是:將DEPC按0.01%(V/V)加在d H2O中500ml(50ul),在37℃過夜,并高壓滅菌即得(150℃ 3小時) 5. 一次性塑料手套 6. 注意:DEPC有致癌之嫌 二、 關于Trizol Reagent的使用過程: 1. Homogenization(勻漿) a. Tissues:組織 每100mg組織勻漿加1mlTrizol試劑,樣品體積不能超過Trizol試劑的10%。 1) 組織接入預冷的EP管中,加入Trizol試劑1ml/10cm2(量一定要加足,否則易污染),混勻,吹吸幾次,以破裂細胞,置室溫5min,以使核蛋白復合物徹底分離。 (2) 加氯仿0.2ml(每1ml Trizol試劑加入氯仿0.2ml),蓋好,劇烈震蕩15s,置室溫2-3分鐘。 (3) 4℃離心,10000g×15min,離心后,混合物將分離為底層為淺紅的、中層為酚-氯仿相、上層為無色的水相。RNA包含在水相中,水相的體積約相當于所加的Trizol試劑量的60%。 (4) 仔細吸取上層水相,移至另一EP管中。 (5) 加0.5ml異丙醇,以沉淀RNA(每1ml Trizol試劑加入0.5ml異丙醇),置室溫10min。 (6) 4℃離心,10000g×10min。RNA沉淀為一層如凝膠樣透明的小塊附在管底和管壁。 (7) 棄上清液,加入預冷的75%乙醇1ml(每1ml Trizol試劑加入75%乙醇至少1ml),震蕩,充分洗滌沉淀,4℃離心,5500g×5min。棄上清液,空氣干燥(或真空干燥)后,沉淀重懸于無 Rnase dH2O中,吹吸幾次,55℃-60℃作用10分鐘以溶解RNA,-70℃保存?zhèn)溆谩?br> RNA定量:
RNA也最好至少要用電泳,一方面定量,另一方面可以看看完整性。至于用分光光度計比較 不同標本之間就更不準了。 RNA的貯藏,最主要的是溫度,-20不夠,最好-80,液氮最保險。 mRNA是不能代替蛋白水平的分析的,因為還有翻譯效率和RNA降解速度的影響。 防止RNA酶污染的措施:
1. 所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。 2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。 3. 有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室溫10min,然后用0.1% DEPC水沖洗,晾干。 4. 配制的溶液應盡可能的用0.1% DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經(jīng)0.22μm濾膜過濾除菌。 5. 操作人員戴一次性口罩、帽子、手套,實驗過程中手套要勤換。 6. 設置RNA操作專用實驗室,所有器械等應為專用。 |
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