? box尺度設(shè)定為30A,不代表模擬區(qū)域就是30A。真實長度是30×晶格長度(單位:埃米A)。也就是設(shè)置的代表30個晶格(30層原子)。07:15 ?? 需要加命令:units box。08:14 ?? create_box 1 box1 # 1代表盒子中只有一類原子,box1是盒子名稱。09:02 ?? w使原子間相互作用。勢函數(shù)名稱注意不要寫錯。不同勢函數(shù)類型,pair_coeff 原子的排列寫法不同。具體要查詢。12:27 ?? 14:27 ?? xxyz文件可在OVITO直接打開,生成原子構(gòu)型圖17:27 ?? y設(shè)定運行時間。在metal單位制下,單位為ps。20:11 ?? 20:52 ?創(chuàng)建初始速度,也可理解為創(chuàng)建初始溫度。 all - 關(guān)鍵字。也可以對劃分的組進行設(shè)定。create 關(guān)鍵字,要創(chuàng)建的初始溫度,300K。12345是隨機種子。 ? 22:37 ?1,命令的ID。all 所有原子,也可以對分組設(shè)定。npt,系綜。temp 溫度,300 300 1--初始溫度-截止溫度-溫度阻尼系數(shù)。iso 控壓方式,對x y z三個方向聯(lián)合控壓; 0 0 1:初始壓強-結(jié)束壓強-阻尼系數(shù)。 ? 26:30 ?輸出步長間隔。1000步輸出一次。 ? 27:35 ?輸出樣式, ? 28:50 ?1-命令的ID。all關(guān)鍵字,對所有原子操作。custom 自定義輸出。1000步輸出一次,輸出在Al.xyz文件中,輸出類型x y z坐標。 OVITO可以動態(tài)演示xyz文件的原子運動。 |
|
來自: 2023我來過 > 《科研關(guān)注》