秦代于境內(nèi)盧邑設(shè)盧縣，屬濟(jì)北郡。西漢時(shí)為泰山郡盧縣、茌縣和平原郡祝阿縣地。三國(guó)魏時(shí)為兗州濟(jì)北國(guó)盧縣、泰山郡山茌縣和青州濟(jì)南國(guó)祝阿縣地。西晉時(shí) 區(qū)境屬濟(jì)北國(guó)盧縣，縣經(jīng)東北部屬青州濟(jì)南郡祝阿縣地，東部為兗州泰山郡山茌縣地。東晉時(shí)為太原縣地。南朝宋時(shí)區(qū)境屬濟(jì)北郡;北朝魏時(shí)為齊州東太原縣、盧縣和山茌縣地。585年，廢太原縣于升城置長(zhǎng)清鎮(zhèn)。594年，以長(zhǎng)清鎮(zhèn)置長(zhǎng)清縣。至此始有長(zhǎng)清縣名，縣以境內(nèi)齊長(zhǎng)城和清水命名。此時(shí)長(zhǎng)清縣屬濟(jì)北郡，縣境東北部為歷城縣和祝阿縣地。唐代，長(zhǎng)清縣初屬河南道濟(jì)州。643年，廢濟(jì)州，長(zhǎng)清屬河南道齊州。北宋時(shí)以路轄府， 長(zhǎng)清屬京東東路齊州濟(jì)南府?？h內(nèi)界首鎮(zhèn)屬京東西路鄆州。996年，長(zhǎng)清縣城由升城遷至刺榆店、即今日長(zhǎng)清老城區(qū)。金代，長(zhǎng)清屬山東東路濟(jì)南府?？h廣里鎮(zhèn)屬山東西路東平府。元代，長(zhǎng)清屬中書(shū)省泰安州。明代，長(zhǎng)清屬山東省濟(jì)南府。1428年。屬山東布政使司濟(jì)南府。1724年，長(zhǎng)清屬泰安州。1734年，復(fù)屬濟(jì)南府。 明代洪武年間，縣內(nèi)居民多元末土著，行政區(qū)劃設(shè)置里甲。永樂(lè)年間，徙直隸、川陜等地居民來(lái)長(zhǎng)清縣定居后，行政區(qū)劃實(shí)行倉(cāng)里制。清代沿襲明制，至道光年間，全縣劃為4倉(cāng)44里，轄1018個(gè)村莊。

民國(guó)成立后，1921年劃全縣為10個(gè)區(qū)71里，轄912個(gè)村莊。民國(guó)20年(1931年)取消里制，舊區(qū)名稱改為第一至第十區(qū)，區(qū)內(nèi)村莊劃分為鄉(xiāng)鎮(zhèn)閭鄰，共有31鎮(zhèn)、184鄉(xiāng)、3618閭、17377鄰。民國(guó)23年(1934年)，全縣劃為10個(gè)區(qū)、184個(gè)鄉(xiāng)、31個(gè)鎮(zhèn)。1939年6月，成立長(zhǎng)清縣抗日民主政府后，轄12個(gè)區(qū)。1941年，為適應(yīng)抗日戰(zhàn)爭(zhēng)的需要，劃長(zhǎng)清為峰山、長(zhǎng)清兩縣。黃河以東的峰山縣，劃為峰山第一至第八區(qū)，耀南區(qū)(1940年6月成立，1941年12月撤消)和第十區(qū)。抗日戰(zhàn)爭(zhēng)勝利后，于1946年改峰山縣為長(zhǎng)清縣，改長(zhǎng)清縣為河西縣，長(zhǎng)清縣的區(qū)域范圍與原峰山縣相同。

1949年，中華人民共和國(guó)成立后，長(zhǎng)清縣劃為11個(gè)區(qū) 、94個(gè)鄉(xiāng)。1950年，長(zhǎng)清、河西兩縣合并統(tǒng)稱長(zhǎng)清縣，全縣劃為17個(gè)區(qū)，黃河以東劃為第一至第八區(qū)和第十七區(qū)9個(gè)區(qū);黃河以西劃為第九至第十六區(qū)8個(gè)區(qū)。1952年11月，并17個(gè)區(qū)為15個(gè)區(qū)。1956年，將長(zhǎng)清縣所屬黃河以西1個(gè)區(qū)，劃歸齊河縣，全縣改為1個(gè)鎮(zhèn)、11個(gè)區(qū)、94個(gè)鄉(xiāng)。1957年調(diào)整為1個(gè)鎮(zhèn)52個(gè)鄉(xiāng)。1958年，將全縣改劃為18個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)。1958年，人民公社化運(yùn)動(dòng)中，取消鄉(xiāng)鎮(zhèn)成立人民公社，全縣設(shè)10個(gè)人民公社。1959年2月，張夏、崮山兩公社合并為張夏公社，全縣設(shè)9個(gè)公社。1959年10月，撤消長(zhǎng)清縣，原孝里公社劃屬平陰縣，雙泉、馬山、五峰公社劃屬平陰縣，其余各公社劃入歷城縣。1961年5月，恢復(fù)長(zhǎng)清縣建制。1962年，五峰、馬山兩公社合并為馬山公社，全縣共設(shè)8個(gè)公社。1976年8月，恢復(fù)崮山公社和五峰公社，全縣共設(shè)10個(gè)公社。1982年2月，將全縣劃為1個(gè)鎮(zhèn)9個(gè)人民公社。1984年2月，撤消人民公社，全縣劃為9個(gè)區(qū)、1個(gè)區(qū)級(jí)鎮(zhèn)、31個(gè)鄉(xiāng)、5個(gè)鄉(xiāng)級(jí)鎮(zhèn)、610個(gè)村民委員會(huì)、743個(gè)自然村。1985年，區(qū)劃調(diào)整時(shí)，設(shè)立武家莊鄉(xiāng)，全縣劃為7個(gè)鎮(zhèn)、4個(gè)鄉(xiāng)，共有611個(gè)行政村。1995年4月，撤消馬山鄉(xiāng)、五峰山鄉(xiāng)，同時(shí)設(shè)立馬山鎮(zhèn)、五峰山鎮(zhèn)，全縣共轄9鎮(zhèn)、2鄉(xiāng)、613個(gè)行政村。2001年6月26日，撤消長(zhǎng)清縣，設(shè)立濟(jì)南市長(zhǎng)清區(qū)。

齊長(zhǎng)城橫亙于齊魯大地，始建于春秋時(shí)期，距今已2500余年，齊長(zhǎng)城源于長(zhǎng)清縣孝里鎮(zhèn)廣里村，古濟(jì)水河?xùn)|岸，從大峰山山頂通過(guò)，蜿蜒千里，直達(dá)青島市黃島區(qū)東于家河村北入海，全長(zhǎng)618.9公里，共翻越1518座山峰。雙乳山漢墓位于長(zhǎng)清縣歸德鎮(zhèn)雙乳村的雙乳山上，距濟(jì)南市38公里。始建于西漢武帝天漢四年(公元前97年)。由于雙乳山漢墓不曾被盜，出土珍貴文物數(shù)量驚人，其中有很多國(guó)家級(jí)文物。這在古墓中是非常少見(jiàn)的。雙乳山漢墓被評(píng)為1996年"全國(guó)十大考古發(fā)現(xiàn)"之一。靈巖寺始建于東晉，距今己有1600多年的歷史。該寺歷史悠久，佛教底蘊(yùn)豐厚，自唐代起就與浙江國(guó)清寺、南京棲霞寺、湖北玉泉寺并稱"海內(nèi)四大名剎"，并名列其首。靈巖寺，現(xiàn)為世界自然與文化遺產(chǎn)泰山的重要組成部分，是全國(guó)重點(diǎn)文物保護(hù)單位，國(guó)家級(jí)風(fēng)景名勝區(qū)，全國(guó)首批4A級(jí)旅游區(qū)。