清代縣級政區(qū)衙門首要官員一般有知縣、縣丞、典史三職共3人，俗稱“縣三巨頭”。

       知縣總攬一縣之政，秩七品。縣丞分理糧務(wù)、水利、交通等，秩正八品。典史專司緝捕盜賊和監(jiān)獄事項(xiàng)，秩從八品。此外還設(shè)有教諭、訓(xùn)導(dǎo)各一名，負(fù)責(zé)教學(xué)和文廟祭祀，秩正八品。

       在地處水陸要沖縣，還要設(shè)置有招待所，設(shè)吏一名。清同治間設(shè)有厘金局（稅務(wù)局），由省委派“外委”一員。

       女埠設(shè)有巡檢所（公安派出所）設(shè)攢吏一名，秩從九品。武官駐有綠營中的千總（把總）、外委各一名。秩分為正八品、正九品。

       縣衙內(nèi)的設(shè)置有六房三班。六房分吏、戶、禮、兵、刑、工房與王朝六部對口；三班為：皂班、快班、捕班。

六房的職責(zé)是：

吏房：任免官吏升降、考課、調(diào)動(dòng)等事項(xiàng)。

戶房：掌管土地、戶口、漕運(yùn)、救荒、田賦、派捐等財(cái)政收支事項(xiàng)。

禮房：掌管學(xué)校，貢舉和風(fēng)化教育、宗教以及接待賓客事項(xiàng)。

兵房：掌管兵器保管、驛站、郵傳、關(guān)禁等事項(xiàng)。

刑房：掌管法律、刑獄。

工房：掌管屯出、水利、交通、營繕、工匠等事項(xiàng)。

       除六房外有架閣庫，掌六房文卷薄賬。猶似今天檔案、收發(fā)工作。六房內(nèi)設(shè)有司吏、典吏，似工作多寡而定。在卯簿（吏員名冊簿）的第一名俗稱“當(dāng)家”是房中主要負(fù)責(zé)人。

       在六房中以戶房和刑房與群眾接觸最多。如戶房在經(jīng)收田賦、雜稅和派捐，其胥吏巧于多方繞算，任意浮收。又借死亡、逃戶征多報(bào)少侵犯中飽。如出賦征收，緣因歷代兵災(zāi)，魚鱗冊散失無存。書吏則都有密簿冊子，不肯獻(xiàn)出，父子相傳，視為他們的衣食命根子?？h官雖明知他們的弊端，因?yàn)?/typo>離開他們就無法征收。

       同時(shí)也不敢輕易撤換。再是刑房，刑房是經(jīng)辦民刑訴訟。這些書吏案例熟悉，經(jīng)辦案件慣能移重就輕，并能私改口供、毀滅證據(jù)。只要須得到訴訟任何一方的賄賂，就有偷天換日的手段。民間有諺“一紙入衙門，九牛拉不出”，人們往往一場官司打的傾家蕩產(chǎn)，后悔莫及。衙門大堂照例設(shè)有一個(gè)大鼓，名為堂鼓，小民如有冤枉，可以隨時(shí)擊鼓鳴冤，但這個(gè)鼓放在高高架上，并有一個(gè)差役日夜看守，不準(zhǔn)小民在堂鼓房近處走動(dòng)和觀望，苦有人擊堂鼓，縣官就要把看守的差役重加答責(zé)，所以堂鼓形同虛假，裝裝樣子的。其他各房事務(wù)繁簡，與民眾直接利害關(guān)系不多。然而遇有事求見也必有麻煩讓你苦惱，敲詐也是常事。

       三班的職責(zé)是：皂班，掌看守牢獄?？彀?，又稱壯班，掌傳遞召喚。捕班，掌偵查破案緝拿。各班人數(shù)不一，少則十余人，多則近百。每班都是正副班頭。所有差役由正副班頭分派辦事，遇有訴訟傳案都是以當(dāng)事人的貧富和案情輕重來勒索或借端敲詐。捕班名為緝捕盜賊，實(shí)則是豢養(yǎng)盜賊。

       新官到位照例要把六房三班在卯簿（名冊）點(diǎn)名一次，名為“卯點(diǎn)”，各房各班照例要新新官一項(xiàng)例規(guī)，名為“卯禮”，書吏差役如不照例送禮就要將其除名，書吏差役一經(jīng)點(diǎn)過卯，以為位置得到保證，就又敢無所作惡了。

       清代有納捐之例，這實(shí)是明碼標(biāo)價(jià)的賣官鬻爵。據(jù)《清史稿·選舉》指出：“由此而名氣不尊，登進(jìn)乃濫，仕途因之淆雜矣！”納捐與增加財(cái)政收入也不無關(guān)系。然而敞了為那些地主官商買官的方便之門，不論什么人，什么出身，只要有錢都可捐官。例如自遵臺三品大員以至“從九品”（十八等級官最低級官員）和“未入流”（沒有上等級一班書吏）。

       賣官價(jià)位須銀兩分別為：道員16400兩，知府13300兩，同知6820兩，知縣4620兩，縣丞980兩，主簿600兩，吏目360兩，未入流從九品180兩。捐官開始只是一個(gè)虛銜。如果要補(bǔ)獲得實(shí)職，還要一定程序，才能分配到某地候補(bǔ)，不是馬上可以上任的。

       在清代衙門內(nèi)有“無紹不成衙”之說，這是封建官僚體制下產(chǎn)生的一個(gè)地域性、專業(yè)性幕僚制度。由于種種原因，紹興師爺布滿全國各地，明顧炎武在《日知錄》中說：“戶部十三司胥皆紹興人”。雍正帝曾下詔“六部經(jīng)辦不許專用紹興人”，然而仍未能打破紹興師爺占據(jù)之地。紹興師爺中多以名刑、錢谷二席，名刑主要處理民刑訴訟案。錢谷師爺職責(zé)很廣，凡有關(guān)征收田賦，雜稅和經(jīng)濟(jì)糾紛均按他處理。由于紹興師爺上有內(nèi)線，縣官也對紹興師爺恭維備至，不敢得罪，稱紹興師爺為老夫子。