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奧密克戎加速變異:比癥狀差異更重要的是多次感染可能性加大

 huage30 2022-12-14 發(fā)布于浙江

奧密克戎亞分支。

奧密克戎亞分支。

自2021年底奧密克戎(Omicron)亞型出現(xiàn)以來,新冠病毒變異株在全球掀起多輪疫情,持續(xù)向加強(qiáng)免疫逃逸的方向進(jìn)化。全球多國主要流行株已被BQ.1和XBB家族替代,而中國目前流行的仍以奧密克戎BA.5亞分支BA.5.2和BF.7(BA.5.2.1.7的縮寫)為主。

BQ.1是奧密克戎BA.5變異產(chǎn)生的第六代亞分支,而BQ.1.1是BQ.1的第一代亞分支。12月13日,據(jù)中國疾控中心通報,中國已在9個省份的本土病例中檢出BQ.1及其亞分支49例,但尚未廣泛流行,也未觀察到患者感染BQ.1后,臨床嚴(yán)重程度較其他變異株有所增加?!斑@些進(jìn)化分支致病力明顯減弱,致重癥和死亡比例明顯低于早期流行的變異毒株?!?/p>

新毒株的出現(xiàn)是否會增加二次感染的可能,引起公眾關(guān)注。北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心副研究員曹云龍致力于新冠病毒突變免疫逃逸機(jī)制研究。在近日的公開演講中,他援引以色列的統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,近一年來,以色列新冠再感染率隨著新的毒株流行而走高,近幾周來,BQ.1.1和XBB(兩個奧密克戎亞變體BJ.1和BA.2.75的組合)大流行下,再感染率從20%上升到35%并且仍在增長,而在BA.1和BA.5流行時期,再感染率高峰分別超過15%和20%。

以色列統(tǒng)計的奧密克戎不同亞型的再感染率。受訪者供圖

以色列統(tǒng)計的奧密克戎不同亞型的再感染率。受訪者供圖

曹云龍表示,這意味著群體免疫對于新突變株的防感染作用很弱,新的突變株會逃逸之前疫苗接種和自然感染所建立的免疫屏障,“感染新冠后短時間內(nèi)可能三到四個月內(nèi)不會感染,但對于一些免疫力較差的人,一年內(nèi)感染好多次,在歐美國家已經(jīng)司空見慣?!?/p>

“只要有感染,就會有重癥和死亡,即使比例降低,但感染基數(shù)較大的情況下,總的絕對數(shù)也會令人擔(dān)憂。”曹云龍認(rèn)為,雖然奧密克戎致病性下降,但依然會引發(fā)高危人群死亡以及后遺癥風(fēng)險,“因此我們還需要持續(xù)監(jiān)測奧密克戎以及后續(xù)可能出現(xiàn)的變異株在致病性、重癥率、后遺癥風(fēng)險等方面的變化?!?/p>

新毒株流行或縮短二次感染“安全窗口”

目前,北京流行的變異株以BF.7為主,廣州流行的變異株以BA.5.2為主。有網(wǎng)友反映,北京患者的感染癥狀似乎比廣州患者嚴(yán)重,是否意味著BF.7的致病力高于BA5.2?北京市呼吸疾病研究所所長童朝暉在接受采訪時指出,只要病毒還是奧密克戎分支,其毒性、致病力和傳染性不會有本質(zhì)改變,“百分之九十幾都在上呼吸道癥狀”,癥狀輕重主要因人而異,和自身免疫力、年齡、基礎(chǔ)疾病有關(guān)。

北京佑安醫(yī)院感染綜合科主任醫(yī)師、小湯山方艙醫(yī)院醫(yī)療專家李侗曾此前曾介紹,BF.7變異株是國內(nèi)奧密克戎“家族”里傳播力最強(qiáng)的亞分支,傳染性和隱匿性都更強(qiáng),R0值(即在沒有干預(yù)的情況下,在一個全部是易感人群的環(huán)境中,平均一個患者可以傳染的人數(shù))可達(dá)10到18.6。

曹云龍告訴澎湃科技記者,BF.7的局部進(jìn)化優(yōu)勢主要體現(xiàn)在免疫逃逸能力的顯著增強(qiáng)。目前沒有證據(jù)表明BA.5.2和BF.7在傳染力和致病力上有差異。傳染力和致病力的研究需要在病毒流行幾個月后才能回顧性開展。

曹云龍研究團(tuán)隊檢測發(fā)現(xiàn),對于三針滅活疫苗接種者,在之前BA.1、BA.2、BA.5已有的強(qiáng)烈免疫逃逸的基礎(chǔ)上,近期流行的BF.7、BQ.1、BQ.1.1、BQ.1.1.10(或BQ.1.18)、XBB顯示出進(jìn)一步的抗體逃逸,導(dǎo)致中和抗體滴度幾乎低于檢測下限(20倍稀釋)。

“即使是接種疫苗的突破感染康復(fù)者也很難預(yù)防再感染?!辈茉讫埮e例稱,接種三針滅活疫苗后又感染了BA.5的患者,康復(fù)一個月后的血漿對BA.5和BF.7的中和滴度較高,但對BQ.1.1.10(BQ.1.18)、XBB等亞型的防感染作用較低。而康復(fù)兩三個月后,中和滴度還會再下降至少兩三倍。

曹云龍解釋,BA.5.2和BF.7都屬于奧密克戎BA.5支系,氨基酸序列有較高的相似度,在理論上應(yīng)該有較好的交叉保護(hù),發(fā)生交叉感染的概率較低。上述檢測也證明,BA.5感染者短期內(nèi)再感染BF.7的概率較低,但是,BF.7對BA.5康復(fù)者血漿確實(shí)造成了一定程度的逃逸,所以BA.5感染者再次感染BF.7的概率要高于BA.5再感染。

奧密克戎趨同突變株對mRNA疫苗導(dǎo)致嚴(yán)重免疫逃逸。受訪者供圖

奧密克戎趨同突變株對mRNA疫苗導(dǎo)致嚴(yán)重免疫逃逸。受訪者供圖

該團(tuán)隊還找了大量接種mRNA疫苗的患者血漿樣本,其中有不少樣本接種了兩針滅活疫苗、兩針mRNA疫苗再加上感染了BA.5,相當(dāng)于五次免疫加強(qiáng),但其康復(fù)一個月后的血漿對于最新突變株的中和抗體滴度仍然較低,可能再過兩個月就無法防止再感染。這意味著,mRNA疫苗與滅活疫苗類似,在防止XBB和BQ.1.1突破感染方面的作用也十分有限。

“作為我國人群主要的免疫背景,三針原始株滅活疫苗,特別是大多數(shù)人距離接種第三針已經(jīng)過去半年以上,已經(jīng)無法對部分最新的Omicron亞型產(chǎn)生較高的防感染作用,會導(dǎo)致我國絕大多數(shù)人群對此類新突變株易感。”曹云龍說。

他認(rèn)為,對于目前國內(nèi)的流行株而言,許多專家提到的“感染后半年內(nèi)通常不會再次感染”的說法基本是正確的,但隨著具備更強(qiáng)免疫逃逸能力的新毒株流行,再次感染的安全窗口可能會縮短。而且,每個人的具體情況也因人而異,波動較大。

不應(yīng)以自然感染代替接種疫苗

2020年6月,《自然-醫(yī)學(xué)》雜志曾刊登一篇重慶學(xué)者對于新冠無癥狀感染者的臨床和免疫學(xué)評估的論文,對37位新冠無癥狀感染者的追蹤研究發(fā)現(xiàn),81.1%的無癥狀感染者在康復(fù)8周后抗體水平下降,而同期有癥狀感染者抗體水平下降的比例是62.2%。

曹云龍稱,該研究結(jié)果表明,無癥狀感染誘導(dǎo)的體液免疫應(yīng)答要弱于有癥狀感染,“理論上來講無癥狀感染者二次感染風(fēng)險確實(shí)會更高一點(diǎn),但是目前仍缺乏嚴(yán)謹(jǐn)?shù)呐R床研究來證實(shí)這一結(jié)論,也不清楚具體會高多少?!?/p>

《自然-醫(yī)學(xué)》雜志上月刊登的另一篇論文近日也引發(fā)大量關(guān)注。這項針對美國退伍軍人中新冠患者的研究顯示,與未再次感染者相比,新冠再感染者死亡的可能性要高出一倍,住院可能性則高出兩倍,患肺部疾病、心臟病、腦部疾病的可能性分別高3.5倍、3倍和1.6倍。

曹云龍認(rèn)為,該研究中的患者大多是老年人,相關(guān)結(jié)論可能無法適用于其他年齡群體。但這個結(jié)果提示老年人會面臨更高的后遺癥風(fēng)險,再次強(qiáng)調(diào)了老年人接種疫苗的重要性。

科學(xué)界普遍認(rèn)為,接種疫苗的主要目的不是防感染而是防重癥。香港今年1月1日至3 月31日BA.2大流行期間大規(guī)模新冠病例研究表明,65歲以上老年人如接種兩劑新冠滅活疫苗,新冠重癥保護(hù)效率達(dá)到58.9%,接種滅活疫苗或mRNA疫苗加強(qiáng)針,重癥保護(hù)效率分別提高到88%和95.2%。

曹云龍解釋,目前的疫苗防重癥效果比較好,是因為接種疫苗后體內(nèi)會產(chǎn)生一些有效抗體的記憶B細(xì)胞,在病毒侵入后這些記憶B細(xì)胞可以很快被激活,在3-7天內(nèi)很快產(chǎn)生新的抗體,從而可以有效防重癥。

相對的,疫苗防感染主要通過誘導(dǎo)中和抗體來實(shí)現(xiàn),防感染的效果取決于暴露時有效抗體的中和滴度。由于注射疫苗誘導(dǎo)的抗體大部分在血液中循環(huán),很難進(jìn)入上呼吸道,且誘導(dǎo)產(chǎn)生的抗體會被新突變株逃逸,加上抗體滴度隨時間自然衰減的影響,導(dǎo)致目前的疫苗防感染效果不好。

“疫苗接種建立的免疫屏障雖然不能有效預(yù)防新毒株的再感染,但對于癥狀的減輕和后遺癥的減少仍有不錯的保護(hù)作用?!辈茉讫埐⒉毁澩宰匀桓腥敬娼臃N疫苗。一方面,新突變株的再感染率很高,感染一次也不能預(yù)防新毒株再次感染;另一方面,感染副反應(yīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于疫苗接種的副作用,尤其是對于老年人等高風(fēng)險人群來說,疫苗接種是最安全的選擇。

新冠病毒進(jìn)化進(jìn)入“變異湯”新階段。

新冠病毒進(jìn)化進(jìn)入“變異湯”新階段。

新冠病毒加速趨同進(jìn)化

曹云龍在演講中指出,此前Alpha→Delta→BA.1→BA.2→BA.5,是非常清晰的單一毒株的依次更替。但今年9月份以來,這種規(guī)律已被打破,各類突變株百花齊放,上百種突變株在全球范圍內(nèi)同時出現(xiàn),且每種突變株與BA.5相比都具有增長優(yōu)勢,這種新冠病毒進(jìn)化現(xiàn)象是前所未有的。

目前BQ.1和XBB是流行度最高的兩個突變株家族。BQ.1來源于奧密克戎BA.5株,其子系BQ.1.1已經(jīng)成為全球主要流行株。而作為兩個奧密克戎BA.2后代突變株的重組體的XBB,有極強(qiáng)的免疫逃逸能力,在出現(xiàn)后短短兩周內(nèi)就在新加坡成為主要流行株,印度也基本被XBB所占據(jù)。二者在歐美廣泛流行,上升趨勢顯著。

這些新變異株的崛起,主要“歸功”于病毒刺突蛋白的受體結(jié)合域(RBD)發(fā)生突變,幫助新冠病毒逃逸新冠疫苗和自然感染誘導(dǎo)的中和性抗體。而且RBD突變越多,變異株的崛起速度似乎越快。BQ.1.1有6個RBD突變,比BQ.1多了一個關(guān)鍵突變,而XBB的RBD突變有7個。

曹云龍指出,這些新的奧密克戎突變株的受體結(jié)合域(RBD)所攜帶的突變表現(xiàn)出趨同效應(yīng),在整個RBD上有7-10個突變位點(diǎn)相同,是此前新冠疫情中不曾見過的,這表明:這些趨同進(jìn)化的突變位點(diǎn)具備很高的選擇優(yōu)勢,而且進(jìn)化壓力非常集中,才會最終導(dǎo)致趨同進(jìn)化且進(jìn)化速度加快。

為什么新冠病毒變異會出現(xiàn)這樣的趨勢?曹云龍/謝曉亮院士所在研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),奧密克戎突破感染在極大程度上受限于“免疫印跡”,也稱“免疫原罪”。也就是說,接種過原始毒株的疫苗后,感染其他突變株主要喚起的還是原始株疫苗所誘導(dǎo)的記憶B細(xì)胞,很少產(chǎn)生針對新毒株的特異性中和抗體。相關(guān)論文今年6月發(fā)表于《自然》雜志,在國際學(xué)術(shù)界引起廣泛關(guān)注。

奧密克戎突破感染誘導(dǎo)的抗體分布。交叉結(jié)合抗體主要富集于E2.1、E2.2、E3、F1等非ACE2競爭表位,且中和活性較差,隨著病毒變異,突破感染誘導(dǎo)的這類抗體例不斷上升。受訪者供圖

奧密克戎突破感染誘導(dǎo)的抗體分布。交叉結(jié)合抗體主要富集于E2.1、E2.2、E3、F1等非ACE2競爭表位,且中和活性較差,隨著病毒變異,突破感染誘導(dǎo)的這類抗體例不斷上升。受訪者供圖

“我們?nèi)梭w的免疫識別系統(tǒng),在打過原始毒株疫苗后,更喜歡能同時結(jié)合感染毒株和原始毒株的抗體,原始株、BA.2、BA.5突破感染誘導(dǎo)的這類抗體的比例從30%一直上升到70%,但它們并不是'有效抗體’,只結(jié)合但不中和,而且不能阻斷病毒結(jié)合受體ACE2。”曹云龍說,在有效抗體占比越來越少的情況下,抗體表位多樣性也越來越低,從而導(dǎo)致病毒免疫壓力越來越集中,各毒株獨(dú)立進(jìn)化可選擇的突變逃逸位點(diǎn)顯著減少。

疫苗和抗體藥物失效,未來如何應(yīng)對?

目前國外已有基于奧密克戎亞型的二價疫苗,英國批準(zhǔn)的疫苗使用的是BA.1,而美國批準(zhǔn)的疫苗使用的是BA.5。不過它們防感染的作用可能不如預(yù)期。按照“免疫印跡”原理,這些疫苗誘導(dǎo)產(chǎn)生的中和抗體,最容易識別的仍然是最早的新冠原始株,而不是奧密克戎毒株。

曹云龍在接受《自然》雜志采訪時稱,這些加強(qiáng)針可能需要打兩劑才能產(chǎn)生高水平的奧密克戎特異性中和抗體。在他看來,在大部分民眾已經(jīng)接種原始毒株疫苗的情況下,即使再基于新毒株開發(fā)吸入式疫苗進(jìn)行免疫加強(qiáng),也很難產(chǎn)生大量針對新毒株的特異性中和抗體,但吸入式疫苗相比以往的注射式疫苗已經(jīng)是一步重要突破。

新冠病毒加速進(jìn)化的免疫逃逸能力,也使得全部獲批中和抗體藥物宣告失效。此前禮來公司bebtelovimab是唯一在體外保留了對BA.5有效中和活性的抗體藥物,但最近已被確認(rèn)對BQ.1和BQ.1.1變異株不具有中和活性。11月30日,美國FDA已取消bebtelovimab的緊急使用授權(quán)。

曹云龍所在研究團(tuán)隊已經(jīng)構(gòu)建了基于中和抗體免疫壓力的新冠病毒RBD進(jìn)化趨勢預(yù)測模型。今年7月,他們構(gòu)建了在BA.2.75和BA.5突變株的基礎(chǔ)上攜帶不同RBD和NTD趨同突變的假病毒,準(zhǔn)確預(yù)測了10月份大量出現(xiàn)的BQ.1.1病毒。NTD指的是病毒刺突蛋白上的另一重要區(qū)域——N端結(jié)構(gòu)域,研究發(fā)現(xiàn),XBB在編碼NTD的基因組區(qū)段中也有突變,使其能夠感染對BQ.1及其近親免疫的人群,而BQ.1家族,包括BQ.1.1獲得NTD突變的速度也快得驚人。

“病毒趨同進(jìn)化,最終是否有一個進(jìn)化的終點(diǎn)?在獲得全部突變后,它的免疫逃逸能力能有多強(qiáng),我們現(xiàn)在的疫苗是否會完全無效?”這也是曹云龍感到好奇的問題。他告訴澎湃科技記者,目前基于實(shí)驗數(shù)據(jù)可以預(yù)測新冠病毒在一定時間范圍內(nèi)(幾個月到半年)的突變規(guī)律,但是病毒還會持續(xù)突變,“現(xiàn)在無法預(yù)測病毒最終的進(jìn)化結(jié)局,不過我們會一直基于目前人群的免疫背景更新實(shí)驗數(shù)據(jù)。如果可以預(yù)測新冠在未來一段時間內(nèi)的進(jìn)化趨勢,就可以提前制備疫苗和抗體藥物去應(yīng)對未來可能出現(xiàn)的疫情,這正是我們在做的工作?!?/p>

從非典康復(fù)者篩選出的廣譜中和抗體組合SA58/SA55。

從非典康復(fù)者篩選出的廣譜中和抗體組合SA58/SA55。

2022年8月,曹云龍所在研究團(tuán)隊宣布,在接種過三針新冠疫苗的非典(SARS)康復(fù)者中篩選出廣譜中和抗體組合SA55/SA58,轉(zhuǎn)讓給北京科興中維生物技術(shù)有限公司開展臨床。據(jù)曹云龍介紹,SA55是目前國際上唯一對包括BQ.1和XBB在內(nèi)所有當(dāng)前流行株都有效的臨床階段抗體藥物,SA58對于BF.7也有效。

“由于SA55抗體在人群中非常稀缺,因此其對應(yīng)的逃逸位點(diǎn)幾乎不存在免疫壓力,新冠病毒很難進(jìn)化出相應(yīng)逃逸的突變株?!辈茉讫埥榻B,目前開發(fā)的SA55/SA58噴霧劑,可以用于暴露后預(yù)防,噴一次提供的即時保護(hù)可維持6-12小時,初步的單盲隨機(jī)對照試驗顯示,預(yù)防效率可達(dá)到80%以上,且成本較低,方便使用。目前正在進(jìn)行更嚴(yán)謹(jǐn)?shù)呐R床試驗,預(yù)計將來可以大規(guī)模使用。

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