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Python數(shù)模筆記-StatsModels 統(tǒng)計回歸(2)線性回歸

 LibraryPKU 2022-04-01

1、背景知識

1.1 插值、擬合、回歸和預測

  插值、擬合、回歸和預測,都是數(shù)學建模中經(jīng)常提到的概念,而且經(jīng)常會被混為一談。

  • 插值,是在離散數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上補插連續(xù)函數(shù),使得這條連續(xù)曲線通過全部給定的離散數(shù)據(jù)點。 插值是離散函數(shù)逼近的重要方法,利用它可通過函數(shù)在有限個點處的取值狀況,估算出函數(shù)在其他點處的近似值。

  • 擬合,是用一個連續(xù)函數(shù)(曲線)靠近給定的離散數(shù)據(jù),使其與給定的數(shù)據(jù)相吻合。

  因此,插值和擬合都是根據(jù)已知數(shù)據(jù)點求變化規(guī)律和特征相似的近似曲線的過程,但是插值要求近似曲線完全經(jīng)過給定的數(shù)據(jù)點,而擬合只要求近似曲線在整體上盡可能接近數(shù)據(jù)點,并反映數(shù)據(jù)的變化規(guī)律和發(fā)展趨勢。插值可以看作是一種特殊的擬合,是要求誤差函數(shù)為 0的擬合。由于數(shù)據(jù)點通常都帶有誤差,誤差為 0 往往意味著過擬合,過擬合模型對于訓練集以外的數(shù)據(jù)的泛化能力是較差的。因此在實踐中,插值多用于圖像處理,擬合多用于實驗數(shù)據(jù)處理。

  • 回歸,是研究一組隨機變量與另一組隨機變量之間關(guān)系的統(tǒng)計分析方法,包括建立數(shù)學模型并估計模型參數(shù),并檢驗數(shù)學模型的可信度,也包括利用建立的模型和估計的模型參數(shù)進行預測或控制。

  • 預測是非常廣泛的概念,在數(shù)模中是指對獲得的數(shù)據(jù)、信息進行定量研究,據(jù)此建立與預測目的相適應的數(shù)學模型,然后對未來的發(fā)展變化進行定量地預測。通常認為,插值和擬合都是預測類的方法。

  回歸是一種數(shù)據(jù)分析方法,擬合是一種具體的數(shù)據(jù)處理方法。擬合側(cè)重于曲線參數(shù)尋優(yōu),使曲線與數(shù)據(jù)相符;而回歸側(cè)重于研究兩個或多個變量之間的關(guān)系。


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1.2 線性回歸

  回歸分析(Regression analysis)是一種統(tǒng)計分析方法,研究是自變量和因變量之間的定量關(guān)系,經(jīng)常用于預測分析、時間序列模型以及發(fā)現(xiàn)變量之間的因果關(guān)系。按照變量之間的關(guān)系類型,回歸分析可以分為線性回歸和非線性回歸。

  線性回歸(Linear regression) 假設(shè)給定數(shù)據(jù)集中的目標(y)與特征(X)存在線性關(guān)系,即滿足一個多元一次方程 。 回歸分析中,只包括一個自變量和一個因變量,且二者的關(guān)系可用一條直線近似表示,稱為一元線性回歸;如果包括兩個或多個的自變量,且因變量和自變量之間是線性關(guān)系,則稱為多元線性回歸。
  
  根據(jù)樣本數(shù)據(jù),采用最小二乘法可以得到線性回歸模型參數(shù)的估計量,并使根據(jù)估計參數(shù)計算的模型數(shù)據(jù)與給定的樣本數(shù)據(jù)之間誤差的平方和為最小。

  進一步地,還需要分析對于樣本數(shù)據(jù)究竟能不能采用線性回歸方法,或者說線性相關(guān)的假設(shè)是否合理、線性模型是否具有良好的穩(wěn)定性?這就需要使用統(tǒng)計分析進行顯著性檢驗,檢驗因變量與自變量之間的線性關(guān)系是否顯著,用線性模型來描述它們之間的關(guān)系是否恰當。



2、Statsmodels 進行線性回歸

  本節(jié)結(jié)合 Statsmodels 統(tǒng)計分析包 的使用介紹線性擬合和回歸分析。線性模型可以表達為如下公式:

2.1 導入工具包

import statsmodels.api as sm
from statsmodels.sandbox.regression.predstd import wls_prediction_std

2.2 導入樣本數(shù)據(jù)

  樣本數(shù)據(jù)通常保存在數(shù)據(jù)文件中,因此要讀取數(shù)據(jù)文件獲得樣本數(shù)據(jù)。為便于閱讀和測試程序,本文使用隨機數(shù)生成樣本數(shù)據(jù)。讀取數(shù)據(jù)文件導入數(shù)據(jù)的方法,將在后文介紹。

# 生成樣本數(shù)據(jù):
nSample = 100
x1 = np.linspace(0, 10, nSample) # 起點為 0,終點為 10,均分為 nSample個點
e = np.random.normal(size=len(x1)) # 正態(tài)分布隨機數(shù)
yTrue = 2.36 + 1.58 * x1 # y = b0 + b1*x1
yTest = yTrue + e # 產(chǎn)生模型數(shù)據(jù)

  本案例是一元線性回歸問題,(yTest,x)是導入的樣本數(shù)據(jù),我們需要通過線性回歸獲得因變量 y 與自變量 x 之間的定量關(guān)系。yTrue 是理想模型的數(shù)值,yTest 模擬實驗檢測的數(shù)據(jù),在理想模型上加入了正態(tài)分布的隨機誤差。

2.3 建模與擬合

  一元線性回歸模型方程為:
  y = β0 + β1 * x + e
  先通過 sm.add_constant() 向矩陣 X 添加截距列后,再用 sm.OLS() 建立普通最小二乘模型,最后用 model.fit() 就能實現(xiàn)線性回歸模型的擬合,并返回擬合與統(tǒng)計分析的結(jié)果摘要。

X = sm.add_constant(x1) # 向 x1 左側(cè)添加截距列 x0=[1,...1]
model = sm.OLS(yTest, X) # 建立最小二乘模型(OLS)
results = model.fit() # 返回模型擬合結(jié)果

  statsmodels.OLS 是 statsmodels.regression.linear_model 的函數(shù),有 4個參數(shù) (endog, exog, missing, hasconst)。

  第一個參數(shù) endog 是回歸模型中的因變量 y(t), 是1-d array 數(shù)據(jù)類型。

  第二個輸入 exog 是自變量 x0(t),x1(t),…,xm(t),是(m+1)-d array 數(shù)據(jù)類型。
  需要注意的是,statsmodels.OLS 的回歸模型沒有常數(shù)項,其形式為:
  y = B*X + e = β0*x0 + β1*x1 + e, x0 = [1,...1]
  而之前導入的數(shù)據(jù) (yTest,x1) 并不包含 x0,因此需要在 x1 左側(cè)增加一列截距列 x0=[1,...1],將自變量矩陣轉(zhuǎn)換為 X = (x0, x1)。函數(shù) sm.add_constant() 實現(xiàn)的就是這個功能。
  參數(shù) missing 用于數(shù)據(jù)檢查, hasconst 用于檢查常量,一般情況不需要。  

2.4 擬合和統(tǒng)計結(jié)果的輸出

  Statsmodels 進行線性回歸分析的輸出結(jié)果非常豐富,results.summary() 返回了回歸分析的摘要。

print(results.summary()) # 輸出回歸分析的摘要

  摘要所返回的內(nèi)容非常豐富,這里先討論最重要的一些結(jié)果,在 summary 的中間段落。

==============================================================================                 coef    std err          t      P>|t|      [0.025      0.975]
------------------------------------------------------------------------------const          2.4669      0.186     13.230      0.000       2.097       2.837x1             1.5883      0.032     49.304      0.000       1.524       1.652
==============================================================================
  • coef:回歸系數(shù)(Regression coefficient),即模型參數(shù) β0、β1、...的估計值。

  • std err :標準差( Standard deviation),也稱標準偏差,是方差的算術(shù)平方根,反映樣本數(shù)據(jù)值與回歸模型估計值之間的平均差異程度 。標準差越大,回歸系數(shù)越不可靠。

  • t:t 統(tǒng)計量(t-Statistic),等于回歸系數(shù)除以標準差,用于對每個回歸系數(shù)分別進行檢驗,檢驗每個自變量對因變量的影響是否顯著。如果某個自變量 xi的影響不顯著,意味著可以從模型中剔除這個自變量。

  • P>|t|:t檢驗的 P值(Prob(t-Statistic)),反映每個自變量 xi 與因變量 y 的相關(guān)性假設(shè)的顯著性。如果 p<0.05,可以理解為在0.05的顯著性水平下變量xi與y存在回歸關(guān)系,具有顯著性。

  • [0.025,0.975]:回歸系數(shù)的置信區(qū)間(Confidence interval)的下限、上限,某個回歸系數(shù)的置信區(qū)間以 95%的置信度包含該回歸系數(shù) 。注意并不是指樣本數(shù)據(jù)落在這一區(qū)間的概率為 95%。

    此外,還有一些重要的指標需要關(guān)注:

  • R-squared:R方判定系數(shù)(Coefficient of determination),表示所有自變量對因變量的聯(lián)合的影響程度,用于度量回歸方程擬合度的好壞,越接近于 1說明擬合程度越好。

  • F-statistic:F 統(tǒng)計量(F-Statistic),用于對整體回歸方程進行顯著性檢驗,檢驗所有自變量在整體上對因變量的影響是否顯著。

  Statsmodels 也可以通過屬性獲取所需的回歸分析的數(shù)據(jù),例如:

print("OLS model: Y = b0 + b1 * x") # b0: 回歸直線的截距,b1: 回歸直線的斜率
print('Parameters: ', results.params) # 輸出:擬合模型的系數(shù)
yFit = results.fittedvalues # 擬合模型計算出的 y值
ax.plot(x1, yTest, 'o', label="data") # 原始數(shù)據(jù)
ax.plot(x1, yFit, 'r-', label="OLS") # 擬合數(shù)據(jù)



3、一元線性回歸

3.1 一元線性回歸 Python 程序:

# LinearRegression_v1.py# Linear Regression with statsmodels (OLS: Ordinary Least Squares)# v1.0: 調(diào)用 statsmodels 實現(xiàn)一元線性回歸# 日期:2021-05-04import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltimport statsmodels.api as smfrom statsmodels.sandbox.regression.predstd import wls_prediction_std# 主程序# === 關(guān)注 Youcans,分享更多原創(chuàng)系列 https://www.cnblogs.com/youcans/ ===def main():  # 主程序# 生成測試數(shù)據(jù):nSample = 100x1 = np.linspace(0, 10, nSample)  # 起點為 0,終點為 10,均分為 nSample個點e = np.random.normal(size=len(x1))  # 正態(tài)分布隨機數(shù)yTrue = 2.36 + 1.58 * x1  #  y = b0 + b1*x1yTest = yTrue + e  # 產(chǎn)生模型數(shù)據(jù)# 一元線性回歸:最小二乘法(OLS)X = sm.add_constant(x1)  # 向矩陣 X 添加截距列(x0=[1,...1])model = sm.OLS(yTest, X)  # 建立最小二乘模型(OLS)results = model.fit()  # 返回模型擬合結(jié)果yFit = results.fittedvalues  # 模型擬合的 y值prstd, ivLow, ivUp = wls_prediction_std(results) # 返回標準偏差和置信區(qū)間# OLS model: Y = b0 + b1*X + eprint(results.summary())  # 輸出回歸分析的摘要print("\nOLS model: Y = b0 + b1 * x")  # b0: 回歸直線的截距,b1: 回歸直線的斜率print('Parameters: ', results.params)  # 輸出:擬合模型的系數(shù)# 繪圖:原始數(shù)據(jù)點,擬合曲線,置信區(qū)間fig, ax = plt.subplots(figsize=(10, 8))
    ax.plot(x1, yTest, 'o', label="data")  # 原始數(shù)據(jù)ax.plot(x1, yFit, 'r-', label="OLS")  # 擬合數(shù)據(jù)ax.plot(x1, ivUp, '--',color='orange',label="upConf")  # 95% 置信區(qū)間 上限ax.plot(x1, ivLow, '--',color='orange',label="lowConf")  # 95% 置信區(qū)間 下限ax.legend(loc='best')  # 顯示圖例plt.title('OLS linear regression ')
    plt.show()returnif __name__ == '__main__': #YouCans, XUPTmain()

3.2 一元線性回歸 程序運行結(jié)果:

OLS Regression Results                            ==============================================================================Dep. Variable:                      y   R-squared:                       0.961Model:                            OLS   Adj. R-squared:                  0.961Method:                 Least Squares   F-statistic:                     2431.Date:                Wed, 05 May 2021   Prob (F-statistic):           5.50e-71Time:                        16:24:22   Log-Likelihood:                -134.62No. Observations:                 100   AIC:                             273.2Df Residuals:                      98   BIC:                             278.5Df Model:                           1                                         Covariance Type:            nonrobust                                         ============================================================================== coef    std err          t      P>|t|      [0.025      0.975]------------------------------------------------------------------------------const          2.4669      0.186     13.230      0.000       2.097       2.837x1             1.5883      0.032     49.304      0.000       1.524       1.652==============================================================================Omnibus:                        0.070   Durbin-Watson:                   2.016Prob(Omnibus):                  0.966   Jarque-Bera (JB):                0.187Skew:                           0.056   Prob(JB):                        0.911Kurtosis:                       2.820   Cond. No.                         11.7==============================================================================OLS model: Y = b0 + b1 * xParameters:  [2.46688389 1.58832741]


4、多元線性回歸

4.1 多元線性回歸 Python 程序:

# LinearRegression_v2.py# Linear Regression with statsmodels (OLS: Ordinary Least Squares)# v2.0: 調(diào)用 statsmodels 實現(xiàn)多元線性回歸# 日期:2021-05-04import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltimport statsmodels.api as smfrom statsmodels.sandbox.regression.predstd import wls_prediction_std# 主程序# === 關(guān)注 Youcans,分享更多原創(chuàng)系列 https://www.cnblogs.com/youcans/ ===def main():  # 主程序# 生成測試數(shù)據(jù):nSample = 100x0 = np.ones(nSample)  # 截距列 x0=[1,...1]x1 = np.linspace(0, 20, nSample)  # 起點為 0,終點為 10,均分為 nSample個點x2 = np.sin(x1)
    x3 = (x1-5)**2X = np.column_stack((x0, x1, x2, x3))  # (nSample,4): [x0,x1,x2,...,xm]beta = [5., 0.5, 0.5, -0.02] # beta = [b1,b2,...,bm]yTrue = np.dot(X, beta)  # 向量點積 y = b1*x1 + ...+ bm*xmyTest = yTrue + 0.5 * np.random.normal(size=nSample)  # 產(chǎn)生模型數(shù)據(jù)# 多元線性回歸:最小二乘法(OLS)model = sm.OLS(yTest, X)  # 建立 OLS 模型: Y = b0 + b1*X + ... + bm*Xm + eresults = model.fit()  # 返回模型擬合結(jié)果yFit = results.fittedvalues  # 模型擬合的 y值print(results.summary())  # 輸出回歸分析的摘要print("\nOLS model: Y = b0 + b1*X + ... + bm*Xm")print('Parameters: ', results.params)  # 輸出:擬合模型的系數(shù)    # 繪圖:原始數(shù)據(jù)點,擬合曲線,置信區(qū)間prstd, ivLow, ivUp = wls_prediction_std(results) # 返回標準偏差和置信區(qū)間fig, ax = plt.subplots(figsize=(10, 8))
    ax.plot(x1, yTest, 'o', label="data")  # 實驗數(shù)據(jù)(原始數(shù)據(jù)+誤差)ax.plot(x1, yTrue, 'b-', label="True")  # 原始數(shù)據(jù)ax.plot(x1, yFit, 'r-', label="OLS")  # 擬合數(shù)據(jù)ax.plot(x1, ivUp, '--',color='orange', label="ConfInt")  # 置信區(qū)間 上屆ax.plot(x1, ivLow, '--',color='orange')  # 置信區(qū)間 下屆ax.legend(loc='best')  # 顯示圖例plt.xlabel('x')
    plt.ylabel('y')
    plt.show()returnif __name__ == '__main__':
    main()

4.2 多元線性回歸 程序運行結(jié)果:

OLS Regression Results                            
==============================================================================Dep. Variable:                      y   R-squared:                       0.932
Model:                            OLS   Adj. R-squared:                  0.930
Method:                 Least Squares   F-statistic:                     440.0
Date:                Thu, 06 May 2021   Prob (F-statistic):           6.04e-56
Time:                        10:38:51   Log-Likelihood:                -68.709
No. Observations:                 100   AIC:                             145.4
Df Residuals:                      96   BIC:                             155.8
Df Model:                           3                                         
Covariance Type:            nonrobust                                         
==============================================================================                 coef    std err          t      P>|t|      [0.025      0.975]
------------------------------------------------------------------------------const          5.0411      0.120     41.866      0.000       4.802       5.280
x1             0.4894      0.019     26.351      0.000       0.452       0.526
x2             0.5158      0.072      7.187      0.000       0.373       0.658x3            -0.0195      0.002    -11.957      0.000      -0.023      -0.016
==============================================================================Omnibus:                        1.472   Durbin-Watson:                   1.824
Prob(Omnibus):                  0.479   Jarque-Bera (JB):                1.194
Skew:                           0.011   Prob(JB):                        0.551Kurtosis:                       2.465   Cond. No.                         223.
==============================================================================OLS model: Y = b0 + b1*X + ... + bm*Xm
Parameters:  [ 5.04111867  0.4893574   0.51579806 -0.01951219]



5、附錄:回歸結(jié)果詳細說明

    Dep.Variable: y 因變量Model:OLS 最小二乘模型Method: Least Squares 最小二乘No. Observations: 樣本數(shù)據(jù)的數(shù)量Df Residuals:殘差自由度(degree of freedom of residuals)Df Model:模型自由度(degree of freedom of model)Covariance Type:nonrobust 協(xié)方差陣的穩(wěn)健性R-squared:R 判定系數(shù)Adj. R-squared: 修正的判定系數(shù)F-statistic: 統(tǒng)計檢驗 F 統(tǒng)計量Prob (F-statistic): F檢驗的 P值Log likelihood: 對數(shù)似然coef:自變量和常數(shù)項的系數(shù),b1,b2,...bm,b0std err:系數(shù)估計的標準誤差t:統(tǒng)計檢驗 t 統(tǒng)計量P>|t|:t 檢驗的 P值[0.025, 0.975]:估計參數(shù)的 95%置信區(qū)間的下限和上限Omnibus:基于峰度和偏度進行數(shù)據(jù)正態(tài)性的檢驗Prob(Omnibus):基于峰度和偏度進行數(shù)據(jù)正態(tài)性的檢驗概率Durbin-Watson:檢驗殘差中是否存在自相關(guān)Skewness:偏度,反映數(shù)據(jù)分布的非對稱程度Kurtosis:峰度,反映數(shù)據(jù)分布陡峭或平滑程度Jarque-Bera(JB):基于峰度和偏度對數(shù)據(jù)正態(tài)性的檢驗Prob(JB):Jarque-Bera(JB)檢驗的 P值。Cond. No.:檢驗變量之間是否存在精確相關(guān)關(guān)系或高度相關(guān)關(guān)系。


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