海軍司令部在斯普利特，編有:5個海軍基地、海軍陸戰(zhàn)隊(1個獨立陸戰(zhàn)連）、海岸警衛(wèi)隊(下設(shè):第一分區(qū)（總部在斯普利特）、第二分區(qū)（總部在普拉）)等，現(xiàn)在克羅地亞海軍人數(shù)大概為3000人，加上海軍陸戰(zhàn)隊之后的總和。

獨立之后的克羅地亞一直陷入了經(jīng)濟困難，當時對于陸軍方面的建設(shè)更為迫切，因此很長一段時間重點都在建設(shè)陸軍，前些年克羅地亞海軍自行建造巡邏艇算是克羅地亞開始重視海軍的第一步。

1艘潛艇救援艦Faust Vrancic號。滿載排水量1590噸；長55.5米，寬12米，吃水4.3米；2臺柴油機,雙軸,4340馬力,航速13節(jié)；司令部成員19人。這艘艦可以攜帶救生鐘，執(zhí)行救援水下300米潛艇的任務(wù)。

克羅地亞在南斯拉夫解體之后繼承了大量的海軍造船廠，有了自己建造微型袖珍潛艇的能力，而救援船就是用來保障自己微型潛艇的安全，作為小國海軍來說這型艦艇算是相當合算性價比極高。

2艘赫爾辛基級導(dǎo)彈艇，芬蘭建造的。滿載排水量300噸；長45米，寬8.9米；航速30節(jié)；主要武器：1門博福斯57毫米/70炮；2座雙聯(lián)裝薩科23毫米/87炮；4部薩博RBS 15型反艦導(dǎo)彈發(fā)射裝置。2部深彈投放裝置。(赫爾辛基級原裝備的“西北風”防空導(dǎo)彈是否保留情況不詳)

2艘國王級快速攻擊艇。滿載排水量385噸；長53.6米，寬8.5米，吃水2.3米；3臺柴油機,三軸,12500馬力,航速36節(jié)；主要武器為1座博福斯57mm炮，1座AK-630型近防炮；4座Saab RBS-15反艦導(dǎo)彈。

作為南斯拉夫的海軍遺產(chǎn)繼承給了克羅地亞，現(xiàn)在也是克羅地亞維護自己近海權(quán)益的保障，搭載的反艦導(dǎo)彈能對現(xiàn)在的大型艦艇造成多少的威懾，那就見仁見智了，畢竟現(xiàn)在沱江級都能叫航母殺手。

1艘Sibenic級導(dǎo)彈艇。滿載排水量271噸；長45米，寬8.4米，吃水2.6米；2臺巡航柴油機,2臺加速燃氣輪機,最高航速38節(jié)；1座博福斯57mm炮，1座AK-630型近防炮；4座Saab RBS-15反艦導(dǎo)彈。

4艘洛維格達級巡邏艇。滿載排水量142噸；長32米，寬6.7米，吃水2.3米；2臺柴油機,雙軸,5292馬力,航速28節(jié)；1門40mm炮,1座四聯(lián)高射機槍,1座四聯(lián)裝SA-N-5防空導(dǎo)彈。

2艘Cetina級登陸艦。滿載排水量880噸；長49.7米，寬10.2米，吃水3.2米；2臺柴油機,雙軸,3100馬力,航速12節(jié)；1門40mm炮或2座雙聯(lián)裝30mm炮,四聯(lián)裝SA-N-5防空導(dǎo)彈。

1艘海軍新建造的巡邏艦，艦長43.25米，寬8米，排水量216噸，裝備了一些輕型武器。

這是克羅地亞海軍主要艦艇一督，在巴爾干半島亞得里亞海沿岸還是有一點實力的，是對于門第內(nèi)哥羅、斯洛文尼亞這樣曾經(jīng)的南斯拉夫邦聯(lián)兄弟國來說，在亞得里亞海對岸的意大利海軍來說，真是不值一提。克羅地亞海軍的一些導(dǎo)彈艇、炮艇、潛艇和特戰(zhàn)潛艇，有些是自制，可見當年南斯拉夫邦聯(lián)時的造船實力，對于小國組成的聯(lián)盟來說的確不多。