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windows下安裝VituralBox以使用Linux系統(tǒng)分析數(shù)據(jù)

 生信藥丸 2021-07-26

出發(fā)點

一直以來,別人找過來,說是要討論生物信息、討論高通量測序,很抱歉,我從一開始就會亮出底牌,我是做生物的,不是做生信的。
沒錯,我就是一個做生物的。既然是做生物的,我寫了大多數(shù)東西的出發(fā)點就是,
我們做濕實驗的也看得懂,能重復(fù),可以出沒有原則性錯誤的結(jié)果
既然如此,既然改變不了搞生信的一班子,無法讓他們寫windows下能運行的東西,那么我們只能讓步,搞搞一些linux。想來想去,那就用最粗暴的方式,我們搞搞大家都能搞定的虛擬機 — VirtualBox

目的

在windows下安裝VirtualBox,
使用最友好最簡單Linux運行班,Ubuntu

下載ubuntu系統(tǒng)安裝文件

進入ubuntu官網(wǎng),進入下載頁面(https://link.jianshu.com/?t=https%3A%2F%2Fwww.ubuntu.com%2Fdownload%2Fdesktop),點擊Download

跳轉(zhuǎn)到新的頁面,如果你愿意的話,那么可以捐助,一般直接點擊“Not now…”,進入下載頁面

一般這種情況會彈出下載對話框,可以下載ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso,如果沒有,那么點擊download now。并等待下載完成
于是我們得到了ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso這個文件,后面可以用于創(chuàng)建虛擬機。

下載與安裝VirtualBox

下載結(jié)束之后,雙擊圖標安裝

點擊創(chuàng)建,進入下一步,有必要的話,我們自定義一個虛擬機文件放置位置

確定位置之后,我們給50Gb的硬盤空間,同時設(shè)置為固定大小,這樣運行起來會很快都要分析數(shù)據(jù)了,這點空間不算什么

開始創(chuàng)建

創(chuàng)建好了之后是這樣的

在VituralBox上安裝Ubuntu系統(tǒng)

雙擊該虛擬機,會彈出選擇啟動盤

隨后選擇之前下載的ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso,并點擊啟動即可

注意

此時在彈出電話框中,選擇之前下載的 ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso

隨后關(guān)閉關(guān)閉虛擬機,并雙擊重啟即可進入Ubuntu安裝界面

安裝Ubuntu

接下來的步驟,基本全部直接點擊下一步即可
在時間區(qū)域,或許可以直接選擇上海

設(shè)置一些有的沒的信息

過程還是比較順暢,沒有發(fā)現(xiàn)什么問題
安裝完成直接,會提示重啟虛擬機的Ubuntu系統(tǒng),進入之后可能看到提示,大概意思是,請移除系統(tǒng)安裝介質(zhì)的英文,那是因為剛才的光盤沒有彈出,可能可以做以下操作

OK,就這樣,安裝完成

一些可選設(shè)置(可選),可以提高運行性能

輸入sudo apt-get update,隨后輸入密碼,回車

類似的,輸入sudo apt-get upgrade

輸入Y就可以了,等著升級完成

從上圖的提示可以看到,我們已經(jīng)成功了

設(shè)置共享文件夾

畢竟我們是在windows下面操作的比較多,如何將windows下的文件,直接在虛擬機的Linux下使用,這個應(yīng)是會直接影響我們的工作,所以需要設(shè)置一下共享文件夾
如此,先在windows下,創(chuàng)建一個目錄

隨后在彈出的對話框中選擇剛才我們創(chuàng)建的文件夾

點擊OK,確定添加,并點擊OK,即可
隨后在桌面,鼠標郵件,打開Terminal
依次輸入以下命令

lscd Desktop mkdir share sudo mount -t vboxsf share share

掛載完成,以后,凡是在share目錄下的文件,無論是windows下,還是Linux下,都可以直接看到

似乎保存不了,于是我直接重新在linux下創(chuàng)建了一個new.txt
隨后黏貼文本,保存,直接在windows下打開
沒問題。

設(shè)置開機自動掛載

以上操作,虛擬機重啟之后,就會消失,所以我們需要設(shè)置下虛擬機中Ubuntu的開機自動掛載共享目錄
切換到root用戶,并編輯類似windows開機啟動項的文件 rc.local

sudo -s nano /etc/rc.local

exit 0 的上一行添加以下命令,即為共享目錄掛載命令

sudo mount -t vboxsf share /home/tbtools/Desktop/share

ctrl+X,隨后摁鍵盤Y,表示確認保存

推送結(jié)束

嗯….這只是一個鋪墊,
雖然我們要盡可能避免使用linux,但是很多時候還是沒有辦法

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