2021年,據(jù)國(guó)家癌癥中心統(tǒng)計(jì),我國(guó)每20秒左右就有1人患乳腺癌,每40秒左右就有1人死于乳腺癌。而國(guó)際腫瘤學(xué)頂級(jí)期刊《美國(guó)醫(yī)學(xué)會(huì)雜志·腫瘤學(xué)》(JAMA Oncology)的一份大規(guī)模研究顯示:男性乳腺癌患者的死亡率更高,比女性高出19%。 乳腺癌,無(wú)形之中成為了當(dāng)代青年以及中老年人的奪命殺手之一。 近日,由國(guó)際知名雜志《CELL》旗下的子刊《cancer cell》在7月12號(hào)最新一期的雜志中評(píng)選出了8大關(guān)于癌癥研究的最新進(jìn)展,其中便包含了一篇關(guān)于乳腺癌的研究論文。 在該篇文章中,科研人員們從170名乳腺癌患者中,獲取了全基因組的測(cè)序數(shù)據(jù)。通過(guò)一系列研究表明,那些引起癌癥轉(zhuǎn)移或復(fù)發(fā)的“癌癥種子”,與最初的癌細(xì)胞有著類似的變異過(guò)程。但發(fā)生遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)移的癌細(xì)胞,則出現(xiàn)了原代癌細(xì)胞中不曾見(jiàn)的變異,且這些變異的癌細(xì)胞能不斷驅(qū)動(dòng)癌癥的發(fā)展。 轉(zhuǎn)移性乳腺癌在過(guò)去的5-10年內(nèi)幾乎令醫(yī)學(xué)界束手無(wú)策,這一令人沮喪的現(xiàn)象在過(guò)去20-30年里并沒(méi)有發(fā)生太大研究變化和進(jìn)展,本篇文章的研究成果給轉(zhuǎn)移性乳腺癌帶來(lái)了一些新的治療思路。 圖1.原發(fā)性乳腺癌轉(zhuǎn)移或局部復(fù)發(fā)的進(jìn)化樹(shù)狀圖 本篇文章先后論述了17例原發(fā)性乳腺癌轉(zhuǎn)移或局部復(fù)發(fā)的進(jìn)化中每一塊樹(shù)狀圖區(qū)域所代表一個(gè)患者的匹配正常樣本和每例2-4個(gè)腫瘤樣本(共有40個(gè)腫瘤樣本),根據(jù)結(jié)果對(duì)樹(shù)狀圖進(jìn)行分組:分別為遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)移組(紅色區(qū)域),局部復(fù)發(fā)組(藍(lán)色區(qū)域)或同步腋淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組(綠色區(qū)域)。 這其中,轉(zhuǎn)移或復(fù)發(fā)的分支遵循相同的顏色主題,而代表原發(fā)性腫瘤特異性克隆的分支為灰色。黑色的線條代表了每個(gè)樣本中100%的細(xì)胞中都存在的克隆性病毒突變。紫色分支代表原發(fā)性腫瘤內(nèi)亞克隆的轉(zhuǎn)移或復(fù)發(fā)內(nèi)的突變。分支的長(zhǎng)度反映了由該亞克隆引起的群集體細(xì)胞突變的比例。紅圓圈則確定了轉(zhuǎn)移/復(fù)發(fā)種子之間的發(fā)散點(diǎn)。 圖2.16例乳腺癌實(shí)驗(yàn)組的全基因組軀體突變時(shí)間 在此基礎(chǔ)上,科研人員們對(duì)16例乳腺癌病例展開(kāi)了進(jìn)一步研究,通過(guò)柱形圖2(A)展示了復(fù)發(fā)型播種克隆與原發(fā)型腫瘤不同的分子時(shí)間點(diǎn)(分子時(shí)間由堿基取代的數(shù)量決定),又在圖B、C、D中采用范圍差異和散點(diǎn)圖展示了16例樣本中的復(fù)發(fā)特異性以及輻射突變特征,并通過(guò)繪制10個(gè)乳腺癌局部復(fù)發(fā)或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移樣本的全基因組病例的每個(gè)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分支來(lái)說(shuō)明研究突變的特征組成(HRD,同源重組缺陷;MMR,失配修復(fù)缺陷)。 乳腺癌在發(fā)展過(guò)程中可以獲得許多不同的突變過(guò)程和廣泛的癌癥基因。其結(jié)果往往是基因組特征的差異相當(dāng)大,甚至比原發(fā)性乳腺癌中已經(jīng)令人生畏的水平更明顯。后續(xù)為了驗(yàn)證乳腺癌原發(fā)性和復(fù)發(fā)性的突變過(guò)程以及放療對(duì)基因組可能造成的影響,團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)三例乳腺癌復(fù)發(fā)病例PD9193中的結(jié)構(gòu)變異驅(qū)動(dòng)因素突變展開(kāi)研究,發(fā)現(xiàn)了結(jié)構(gòu)變異因素驅(qū)動(dòng)導(dǎo)致的CCND1重新擴(kuò)增、TP53副本丟失圖3(A)以及FGFR1擴(kuò)增(B)等現(xiàn)象。有趣的是,這些數(shù)據(jù)顯示,轉(zhuǎn)移發(fā)展過(guò)程中復(fù)雜的災(zāi)難性事件與團(tuán)隊(duì)所檢測(cè)的單細(xì)胞測(cè)序研究結(jié)果顯示,原發(fā)性乳腺癌病變的間斷拷貝數(shù)進(jìn)化居然相一致。 這也就意味著,哪怕是對(duì)原發(fā)性腫瘤進(jìn)行了最佳治療,但約有10%的患者仍會(huì)存在局部復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn),而剩余的30%和60%的病例也均有可能在未來(lái)伴隨不同程度上的遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)移性疾病。 圖3.三例乳腺癌復(fù)發(fā)(A)病例PD9193中的結(jié)構(gòu)變異驅(qū)動(dòng)因素突變結(jié)果 文章在最后提到,精確腫瘤學(xué)的概念是建立在這樣一個(gè)假設(shè)之上的:即了解患者癌癥的基因組基礎(chǔ)將指導(dǎo)可能有效的靶向治療方法的選擇。 建立在這個(gè)假設(shè)的基礎(chǔ)之上,這意味著可以獲得代表我們治療靶向的腫瘤細(xì)胞的樣本。目前世界上對(duì)于原發(fā)性乳腺癌的基因組已經(jīng)有了很好的檢測(cè)表征結(jié)果,但對(duì)復(fù)發(fā)或轉(zhuǎn)移性乳腺癌的分析數(shù)據(jù)則要少得多。由于樣本量較小,在當(dāng)代醫(yī)療應(yīng)用中很難提取原發(fā)性和復(fù)發(fā)之間的一般進(jìn)化模式,這些尚未解決的問(wèn)題對(duì)于人類治療乳腺癌具有重要的生物學(xué)和臨床意義。 文章作者同時(shí)表明,本篇文章進(jìn)行這項(xiàng)研究主要辨是為了解決上述提到的現(xiàn)有問(wèn)題中的一部分,包括與乳腺癌密切相關(guān)的轉(zhuǎn)移與其原發(fā)性病變;同區(qū)域復(fù)發(fā)、淋巴傳播引起的腋下轉(zhuǎn)移和血細(xì)胞傳播引起的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的進(jìn)化是否存在差異;轉(zhuǎn)移的驅(qū)動(dòng)景觀是否與原發(fā)性癌癥不同;以及是否有與轉(zhuǎn)移特異性的癌癥基因。由于轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者的生存率非常低,因此確定新出現(xiàn)的轉(zhuǎn)移驅(qū)動(dòng)突變是否可能提供個(gè)性化治療的機(jī)會(huì)尤為重要。 在尋找一種非常適合身體遙遠(yuǎn)地區(qū)自主生活的基因組時(shí),乳腺癌可以進(jìn)入許多不同的突變過(guò)程和廣泛的癌癥基因庫(kù)?;蚪M譜中往往存在著相當(dāng)大的患者間差異,甚至比原發(fā)性乳腺癌的基因組譜差異性更明顯。要想統(tǒng)計(jì)和確認(rèn)這種復(fù)雜性極高的基因組譜通常需要招募大量的轉(zhuǎn)移性疾病患者病例,并與轉(zhuǎn)錄,表觀基因組和臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合分析。本文的研究表明,這種研究方法具有潛在的臨床影響,能夠提供乳腺癌突變過(guò)程的克隆進(jìn)化模式,治療失敗機(jī)制和新治療靶點(diǎn)的方向。(生物谷 bioon)
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