關于掛靠經(jīng)營的稅收問題，在營改增之前，營業(yè)稅法規(guī)有明確規(guī)定，增值稅暫行條例及其實施細則等增值稅規(guī)定則未涉及。
營業(yè)稅暫行條例實施細則第十一條規(guī)定：“單位以承包、承租、掛靠方式經(jīng)營的，承包人、承租人、掛靠人（以下統(tǒng)稱承包人）發(fā)生應稅行為，承包人以發(fā)包人、出租人、被掛靠人（以下統(tǒng)稱發(fā)包人）名義對外經(jīng)營并由發(fā)包人承擔相關法律責任的，以發(fā)包人為納稅人；否則以承包人為納稅人?！?/span>
全面實施營改增后，增值稅法規(guī)吸收了上述規(guī)定。《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）附件1《營業(yè)稅改征增值稅試點實施辦法》第二條規(guī)定：“單位以承包、承租、掛靠方式經(jīng)營的，承包人、承租人、掛靠人（以下統(tǒng)稱承包人）以發(fā)包人、出租人、被掛靠人（以下統(tǒng)稱發(fā)包人）名義對外經(jīng)營并由發(fā)包人承擔相關法律責任的，以該發(fā)包人為納稅人。否則，以承包人為納稅人?！?/span>
對照來看，上述案例中，乙公司經(jīng)營礦產(chǎn)品銷售收入的增值稅，應以甲公司為納稅義務人，這點不存在爭議。但對于甲公司收取的掛靠費是否需要繳納增值稅，因為目前尚無明確規(guī)定，有不同看法，典型的比如本案中征納雙方的分歧?！?/span>

觀點一：掛靠費不需要繳納增值稅

甲公司認為，根據(jù)財稅〔2016〕36號文件規(guī)定和甲公司與乙公司的協(xié)議約定，乙公司以甲公司的名義對外經(jīng)營，甲公司是發(fā)包人并承擔相關法律義務，因而甲公司是增值稅納稅義務人，甲公司作為與乙公司一致對外的唯一納稅人，只需對來自下游客戶的銷售收入繳納增值稅。至于乙公司向甲公司支付的掛靠費，屬于同一納稅人名下的資金內(nèi)部流轉(zhuǎn)，或者說是納稅人內(nèi)部的利潤分成，不是增值稅的應稅行為，不應對甲公司收取的掛靠費再次征收增值稅。該觀點與稅務總局的營改增政策解讀一致，有關解讀明確，現(xiàn)在所說的承包承租掛靠行業(yè)，如果以發(fā)包人（出租人、被掛靠人）名義對外經(jīng)營并由發(fā)包人承擔相關法律責任，以發(fā)包人為納稅人；如果未同時滿足上述兩個條件，以承包人（承租人、掛靠人）為納稅人，發(fā)包人向承包人收取的管理費或掛靠費，屬于同一納稅人的內(nèi)部行為，不征增值稅?！　?/span>

觀點二：掛靠費需要繳納增值稅

甲公司屬地主管稅務機關認為，雖然財稅〔2016〕36號文件規(guī)定掛靠經(jīng)營的以被掛靠人為納稅義務人，但于本案而言，那只是針對乙公司銷售礦產(chǎn)品取得的收入，并不涉及乙公司支付給甲公司的掛靠費。一方面，乙公司與甲公司不是合作經(jīng)營關系，甲公司收取的掛靠費不是銷售收入的直接分配，而是將經(jīng)營利潤或者說是銷售所得分攤給甲公司；另一方面，甲公司收取的掛靠費，是其讓渡經(jīng)營權、采礦權等權利所獲得的對價，屬于轉(zhuǎn)讓無形資產(chǎn)的經(jīng)營活動，應對掛靠費金額按轉(zhuǎn)讓無形資產(chǎn)計算繳納增值稅。有其他稅務機關也持此觀點，如《江西省國家稅務局關于全面推開營改增試點政策問題解答（八）》中提問：被掛靠企業(yè)按年取得的純掛靠費收入是否屬于增值稅應稅范圍？若屬于，應按照什么品目開具發(fā)票？回答是：根據(jù)財稅〔2016〕36號文件規(guī)定，以掛靠方式經(jīng)營的，如掛靠人以被掛靠人名義對外經(jīng)營并由發(fā)包人承擔相關法律責任的，被掛靠人為納稅人，被掛靠人從掛靠人收取的掛靠費，應按照所掛靠經(jīng)營業(yè)務的性質(zhì)確定適用稅率并繳納增值稅；以掛靠人為納稅人的，被掛靠人收到的掛靠費按照“商務輔助服務-企業(yè)管理服務”繳納增值稅?！　?/span>

觀點三：根據(jù)掛靠費的構成判斷是否需繳納增值稅

筆者認為，對掛靠費是否征收增值稅，應根據(jù)掛靠費的構成來判斷。具體來說，如果被掛靠方收取的掛靠費為固定金額，因該金額與掛靠方的生產(chǎn)經(jīng)營無關，則被掛靠方收取的掛靠費應繳納增值稅；如果被掛靠方收取的掛靠費與掛靠方的經(jīng)營收入掛鉤，則可視為掛靠方與被掛靠方分攤經(jīng)營收入，屬于合作經(jīng)營的表現(xiàn)，被掛靠方收取的掛靠費屬于同一納稅人名下的資金內(nèi)部流轉(zhuǎn)，不應對掛靠費再次征收增值稅。對于如本文所述案例的特殊情況，即掛靠費由固定金額與經(jīng)營分攤兩部分構成的，應分別處理：對于固定金額部分的掛靠費，應按適用稅目征收增值稅；對于與掛靠方經(jīng)營收入相關的那部分掛靠費，不再另行計算繳納增值稅。