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2021.04在線數(shù)據(jù)庫匯總

 醫(yī)學數(shù)據(jù)庫百科 2021-04-26

在4月期間,總共發(fā)表了醫(yī)學相關在線數(shù)據(jù)庫34個。下面就來給大家介紹一下主要有哪些數(shù)據(jù)庫,以及筆者比較感興趣的數(shù)據(jù)庫。如果想要所有相關數(shù)據(jù)庫信息的,后臺回復:2104。

疾病和藥物相關數(shù)據(jù)庫

在這個部分,一共發(fā)表了4個數(shù)據(jù)庫。其中兩個基因和疾病相關的數(shù)據(jù)庫。

其中, GPCards是一個在基因組水平分析基因和疾病相關性的數(shù)據(jù)庫。通過數(shù)據(jù)相對應的基因組信息。就可以查詢信息內的基因哪些和疾病有關。

微生物和病毒相關數(shù)據(jù)庫

在這個部分,總共發(fā)表了1個數(shù)據(jù)庫。這個數(shù)據(jù)庫主要收集了病毒當中circRNA的信息。對于研究病毒方面的而言,如果把病毒circRNA當作一個研究對象也是一個創(chuàng)新點的。

在這個數(shù)據(jù)庫當中,包含了來自26種病毒的46,440種病毒circRNA。

DNA相關數(shù)據(jù)庫

在這個部分,總共發(fā)表了6個和DNA有關的數(shù)據(jù)庫。

其中, CanDriS是一個腫瘤驅動基因查詢數(shù)據(jù)庫。這個數(shù)據(jù)庫使用TCGA、ICGC數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)利用多種不同的算法來預測腫瘤相關驅動基因。在數(shù)據(jù)庫當中,我們可以預測腫瘤相關驅動基因,也可以預測耐藥相關驅動基因。

RNA相關數(shù)據(jù)庫

在這個部分,總共發(fā)表了7個數(shù)據(jù)庫。

其中 TRlnc是一個用來預測lncRNA調控作用的數(shù)據(jù)庫。這個數(shù)據(jù)庫的團隊之前也發(fā)表了很多關于轉錄調控的數(shù)據(jù)庫,例如我們之前介紹的:KnockTFSEanalysis。

蛋白相關數(shù)據(jù)庫

在和蛋白相關的數(shù)據(jù)庫當中,總共發(fā)表了7個相關的數(shù)據(jù)庫。有興趣的可以自己了解一下。

其中 HLA Ligand Atlas 是一個查詢正常組織當中HLA配體的數(shù)據(jù)庫。在這個數(shù)據(jù)庫當中,作者從227個良性人體組織樣本中首次廣泛收集的成對的HLA-I和HLA-II免疫肽。這樣獲得的HLA配體信息,比相較于腫瘤癌旁正常的組織更加準確。

流程化分析數(shù)據(jù)庫

在這個部分,這個月發(fā)表了3個數(shù)據(jù)庫。包括多個組學的數(shù)據(jù)分析。

其他方面數(shù)據(jù)庫

在3月份其他方面一共發(fā)表了3個數(shù)據(jù)庫。

其中 MegaGO是用來比較兩組GO分析結果相似性的網(wǎng)站。經(jīng)常我們在進行不同分組的GO富集分析的時候,會得到不同的GO的結果。但是這些結果是否相似,很難進行比較了。這個數(shù)據(jù)庫則是可以在輸入兩個不同的GO ID之后,比較出兩者富集分析的相似性。

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