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螺環(huán)化合物在藥物研發(fā)中的應(yīng)用

 北極熊_ 2021-04-23

概述

螺環(huán)化合物具有剛性結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,存在端基異構(gòu)效應(yīng)、螺共軛以及螺超共軛等一般有機(jī)化合物不具備的特殊性質(zhì)。螺環(huán)結(jié)構(gòu)與單環(huán)結(jié)構(gòu)或者平面的芳香結(jié)構(gòu)相比,擁有更大的空間三維結(jié)構(gòu)(圖1);雜環(huán)螺環(huán)結(jié)構(gòu)也被當(dāng)作某些基團(tuán)的生物電子等排體,能在一定程度上改變藥物分子的水溶性、親脂性、優(yōu)勢構(gòu)象和ADMET性質(zhì),使優(yōu)化后的先導(dǎo)分子更容易成藥[1]。因此,螺環(huán)化合物在藥物研發(fā)中占據(jù)非常重要的地位。不同尺寸和環(huán)系的螺環(huán)具有豐富的三維立體結(jié)構(gòu),從而提供了改善藥效的可能性和藥物專利的創(chuàng)新性;既可以突破現(xiàn)有藥物的專利,又能用于設(shè)計(jì)全新結(jié)構(gòu)或者骨架的小分子化合物[2]。

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圖1 簡單螺環(huán)化合物骨架

從近年來在藥物化學(xué)期刊上發(fā)表的文章數(shù)量中觀察到,以“spiro”為關(guān)鍵詞的出版物數(shù)量逐年增多,08年達(dá)到峰值之后緩慢下降,這說明螺環(huán)化合物已經(jīng)成為現(xiàn)代藥物研發(fā)的重要方向(圖2)[3]。

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圖2 藥物化學(xué)期刊中以“spiro”為關(guān)鍵詞的出版物數(shù)量[3]

螺環(huán)化合物的多樣性、立體構(gòu)型對藥物性質(zhì)的影響

常見的螺環(huán)骨架由碳、氮、氧和硫等元素組成。除了這幾種元素外,其他元素是比較少見的[4]。Tacke等人研究報(bào)道了一種含硅的螺環(huán)骨架(圖3),作為σ1配體表現(xiàn)出了很好的選擇性和效果。他們合成了1,2,3,4-四氫-1,4-硅羅[萘-1,4-哌啶]衍生物并與碳類似物進(jìn)行了比較。利用單晶x射線衍射研究,可以觀察到結(jié)構(gòu)上的差異,由于碳(0.77 ?)和硅(1.17 ?)的共價(jià)半徑不同,硅烷衍生物表現(xiàn)出了較高的σ1親和力和較低的σ2親和力,從而增加了選擇性,這是由于C/Si交換引起的形狀和構(gòu)象行為的結(jié)構(gòu)差異造成的[5] 。

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圖3 含硅的螺環(huán)化合物[4]

Zhao等人開發(fā)了一系列新的螺環(huán)砜類γ-分泌酶(GS)抑制劑。該抑制劑降低了Aβ肽的產(chǎn)生,表現(xiàn)出了很好抑制活性。環(huán)狀膦酸酯的修飾也產(chǎn)生了一種在大鼠中具有良好藥代動(dòng)力學(xué)特征的有效抑制劑(圖4)[6]。

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圖4 含磷的螺環(huán)化合物[5]

含硼的螺環(huán)化合物也具有潛在醫(yī)療用途,硼的優(yōu)勢作用是它的空p軌道,它可以共價(jià)結(jié)合目標(biāo)蛋白,例如與目標(biāo)蛋白的絲氨酸或蘇氨酸殘基結(jié)合。Natsutani等人合成了含硼的螺環(huán)骨架,對其在人肝微粒體(HLMs)中的親脂性和代謝穩(wěn)定性進(jìn)行了評價(jià)。研究表明該螺環(huán)化合物的log P值低于4,具有良好的穩(wěn)定性圖5[7]。

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圖5 含硼的螺環(huán)化合物[6]

螺環(huán)化合物的構(gòu)型會(huì)極大地影響親和作用從而影響藥物性質(zhì)。Zhou等開發(fā)了一種新的登革病毒(DENV)抑制劑,在登革病毒高通量表型篩選中發(fā)現(xiàn)了目標(biāo)螺環(huán)化合物的外消旋體,其對DENV表現(xiàn)出活性。這種含有螺旋吡唑吡啶酮骨架的抑制劑可以通過非結(jié)構(gòu)蛋白4B (NS4B)抑制DENV的復(fù)制。通過手性高效液相色譜法對映體進(jìn)行分離后發(fā)現(xiàn),(R)-構(gòu)型抑制劑的體外活性是(S)-對映體的225倍(圖6)[8]。

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圖6 吡唑吡啶酮螺旋骨架化合物

Tai等開發(fā)了一系列哌啶惡唑烷酮螺環(huán)骨架化合物,用于抑制丙型肝炎病毒(HCV)的復(fù)制,研究該螺環(huán)化合物不同立體構(gòu)型對抗HCV活性(1a和1b復(fù)制子)的影響。測試結(jié)果表明,四種非對映體中有三種是有效的,只有一種非對映體無效(圖7)[9]。

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圖7 哌啶惡唑烷酮螺環(huán)骨架化合物

螺環(huán)在藥物結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)中的應(yīng)用

藥物設(shè)計(jì)的進(jìn)展很大程度上依賴于x射線晶體學(xué)、核磁共振或電子顯微鏡所確定的配體-蛋白復(fù)合物的生物活性構(gòu)象,這使得螺環(huán)骨架的合理應(yīng)用成為可能。生物活性信息包含了二面角和分子內(nèi)的相互作用等信息。利用這些信息,可以引入剛性螺環(huán)骨架,取代可旋轉(zhuǎn)的鍵,同時(shí)保留原有官能團(tuán)特性。在這方面,將螺環(huán)應(yīng)用于柔性配體的類似物(如肽)的設(shè)計(jì)是很有吸引力的。螺環(huán)的硬化不僅可以用來優(yōu)化藥效,而且可以用于合理地提高藥效和ADME特性[10]。

Caenepeel等人在MCL-1抑制劑的優(yōu)化過程中,在結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)方面做出了大量努力。非螺環(huán)抑制劑IC50為0.3 μM,該結(jié)構(gòu)中2,4-二氯苯取代基以112°的二面角占據(jù)了一個(gè)緊密的疏水口袋,螺環(huán)抑制劑的引入將苯基部分的旋轉(zhuǎn)限制在107°的二面角,使藥效提高了10倍(圖8)[11]。

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圖8 藥物結(jié)構(gòu)引入螺環(huán)的應(yīng)用[10]

螺環(huán)在選擇性優(yōu)化方面的應(yīng)用

藥物設(shè)計(jì)中引入螺環(huán)后,盡管藥效會(huì)適度增加或降低,但是選擇性會(huì)顯著提高。Reilly等人研究了多巴胺D3受體拮抗劑中不同螺環(huán)骨架對哌嗪核心的替代[12]。研究發(fā)現(xiàn)盡管有些片段具有螺環(huán)骨架,其活性卻比哌嗪類似物降低了100多倍,但與相關(guān)的多巴胺D2受體作用相比,其選擇性增加了10倍 (圖9)。在進(jìn)一步優(yōu)化的過程中,通過對一組特定的胺受體的結(jié)合親和力的測量,發(fā)現(xiàn)螺環(huán)骨架與哌嗪核選擇性比為905倍,說明螺環(huán)化合物的選擇性更好[13]。

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圖9 選擇性多巴胺D3受體拮抗劑[12]

螺環(huán)骨架化合物的未來發(fā)展展望

螺環(huán)骨架在藥物化學(xué)中應(yīng)用廣泛,近年來合成方法的發(fā)展使得螺環(huán)在藥物化學(xué)中不斷引入和增加。目前,多種多樣的反應(yīng)途徑可用于制備所需要的螺環(huán)骨架,促進(jìn)螺環(huán)系統(tǒng)的多樣性。然而,它們的潛力尚未得到全部開發(fā),系統(tǒng)探索螺環(huán)化學(xué)空間的方法仍處于起步階段。螺環(huán)化產(chǎn)生的剛性增加是影響藥效和選擇性重要的因素。雖然到目前為止開發(fā)最廣泛的螺環(huán)骨架大都涉及的是5元環(huán)和6元環(huán),但藥物化學(xué)家認(rèn)為在未來將看到更多的螺環(huán)系列被開發(fā),包括更多的4元環(huán)和7元環(huán)。即使在spiro[3.3]環(huán)系中,其多樣性也比通常認(rèn)為的要大得多。要充分發(fā)揮螺環(huán)的潛力,還必須有能力控制螺旋環(huán)上的多個(gè)立體中心。因?yàn)樵谝粋€(gè)商業(yè)藥物發(fā)現(xiàn)的環(huán)境中,涉及多個(gè)立體中心的化學(xué)研究可能是非常有挑戰(zhàn)的。各種穩(wěn)健的合成方法在學(xué)術(shù)界的發(fā)展,以及合成砌塊的商業(yè)可用性,將加速立體化學(xué)復(fù)雜螺環(huán)在藥物發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用。

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