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推薦：江舜堯 編譯：莫沉 編輯：小菌菌 愛爾蘭科克大學(xué)微生物系PaulW. O’Toole教授團(tuán)隊(duì)于2019年11月24日在《Gastroenterology》上發(fā)表題目為《Differences in Fecal Microbiomes and Metabolomesof People With vs Without Irritable Bowel Syndrome and Bile Acid Malabsorption》的文章。該研究發(fā)現(xiàn)IBS患者的腸道微生物組成與對照組不同，并反映在糞便代謝物中。盡管IBS癥狀存在異質(zhì)性，但與對照組相比，患者的尿液和糞便代謝體以及糞便微生物組存在顯著差異，且與IBS的癥狀亞型無關(guān)。該研究表明，糞便微生物組和代謝組的分析可以區(qū)分有無腸易激綜合征、有無膽汁酸吸收障礙的患者，上述發(fā)現(xiàn)為用于開發(fā)基于微生物的IBS的治療策略提供了參考。
文章摘要 腸易激綜合征(Irritable bowel syndrome, IBS) 作為一種異質(zhì)性疾病，其診斷和亞型的確定通常要基于患者具體癥狀而定。在本實(shí)驗(yàn)中，研究者分析了IBS患者和非IBS患者的糞便微生物群落，以確定這種疾病的生物標(biāo)志物。本研究共收集了80名IBS患者(RomeIV criteria; 年齡16-70歲)和65名匹配的非IBS患者(對照組)的糞便和尿液樣本，以及常規(guī)的醫(yī)學(xué)和飲食信息。分別對上述糞便樣本進(jìn)行Shotgun和16S rRNA擴(kuò)增子測序，并對尿液和糞便代謝物進(jìn)行氣相色譜和液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析?；跀?shù)據(jù)之間顯著的Spearman相關(guān)性生成同現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)，同時通過對放射標(biāo)記的硒-75?；悄懰幔_定腹瀉患者存在明顯的膽汁酸吸收不良(Bile acidmalabsorption, BAM)。與對照組相比，IBS患者在飲食和糞便微生物之間的網(wǎng)絡(luò)關(guān)聯(lián)上有顯著差異，同時都伴隨著糞便代謝物的差異。此外，研究者并未發(fā)現(xiàn)不同IBS癥狀亞型患者的糞便微生物組成有顯著的差異，而糞便樣本的代謝譜則可以較好地區(qū)分IBS患者和對照組。盡管尿液代謝物在IBS患者和對照組之間也有顯著差異，但大多數(shù)差別代謝物與飲食或藥物有關(guān)。糞便代謝組，而不是微生物組，可以顯著區(qū)分患者IBS有和沒有BAM癥狀。盡管IBS具有較高的異質(zhì)性，但患者的尿液和糞便代謝物及糞便菌群與對照組有著顯著的差異，且與IBS的癥狀亞型無關(guān)，同時糞便代謝組分析可用于區(qū)分有無BAM的IBS患者。上述研究可用來開發(fā)基于腸道微生物的針對IBS的治療策略。本研究表明，IBS患者的腸道微生物組成與對照組不同，并反映在糞便代謝物中。然而，宏基因組和代謝組構(gòu)型并不能有效區(qū)分IBS的臨床亞型(IBS-C，-D，-M)。同時，研究者還發(fā)現(xiàn)，患有膽汁酸吸收不良的IBS-D和IBS-M患者的糞便代謝物發(fā)生了改變，可以在不需要SeHCAT(75 Selenium (Se) homocholic acid taurine)檢測的情況下區(qū)分這些患者。對飲食-微生物-代謝軸的綜合分析顯示，與對照組相比，IBS患者的飲食成分與腸道微生物的相互作用，并揭示了一組不同的糞便代謝物，這些代謝物可能驅(qū)動或延續(xù)IBS綜合征。文中重要圖片說明： 
圖1 |對照組和腸易激綜合征組的微生物組成分析
圖2 | SeHCAT檢測受試者膽汁酸吸收不良的分布、微生物組和代謝組譜
圖3 |對照組與腸易激綜合征尿液和糞代謝產(chǎn)物的比較分析
圖4 |跨多個基因組數(shù)據(jù)集的結(jié)構(gòu)和共豐度的可視化分析
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