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生物醫(yī)藥領(lǐng)域,咱們低估了STATA

 松哥精鼎統(tǒng)計(jì) 2021-03-01
緣起
     當(dāng)今世界,統(tǒng)計(jì)軟件,以SPSS、SAS、R、Stata最為人們所熟知,SPSS簡(jiǎn)單易學(xué),SAS深厚寬宏,R軟件披荊斬棘,Stata則被認(rèn)為計(jì)量經(jīng)濟(jì)學(xué)一方霸主。
    今天松哥來(lái)談?wù)凷tata,初識(shí)Stata是06年讀博期間,統(tǒng)計(jì)老師講授的就是Stata,當(dāng)時(shí)也就學(xué)了皮毛,了解一個(gè)大概,就是為了統(tǒng)計(jì)考試,沒(méi)想深入研究。
    后來(lái)接觸到Meta分析,忽然發(fā)現(xiàn),Stata軟件專門有Meta Analysis模塊,分析起來(lái)非常方便,比起官方的Revman,功能強(qiáng)大很多!也就是那時(shí)候開始有點(diǎn)喜歡Stata,但是絕大多數(shù)數(shù)據(jù)還是使用SPSS。
   再后來(lái)開始研究臨床預(yù)測(cè)模型,遍歷SPSS、SAS、R和Stata,最終松哥不得不承認(rèn),Stata做臨床預(yù)測(cè)模型,功能不亞于R,超過(guò)SAS和SPSS,最為關(guān)鍵的是,stata實(shí)現(xiàn)臨床預(yù)測(cè)模型基本就是一句代碼。而不是像R,為了出點(diǎn)結(jié)果,拼命的用代碼去堆砌。
   很多既往參加過(guò)R軟件臨床預(yù)測(cè)班的學(xué)員,在后臺(tái)向松哥反映,參加2天R軟件預(yù)測(cè)模型,就像做夢(mèng)一樣夢(mèng)了兩天,那是確實(shí)。很多人學(xué)習(xí)完統(tǒng)計(jì)最終就明白一件事,肯定一件事,那就是“咱不適合學(xué)統(tǒng)計(jì)!
   其實(shí)統(tǒng)計(jì)思想并不難,難的是算法,算法交給軟件,用理解的思想去指導(dǎo)軟件實(shí)踐即可。但是R確實(shí)增加了軟件實(shí)現(xiàn)的難度,但是R確實(shí)是一款偉大的軟件。但是對(duì)于初學(xué)者或者非統(tǒng)計(jì)學(xué)專業(yè)人員,也確實(shí)難以逾越!
   但是Stata基本上,一行代碼,就可以實(shí)現(xiàn)臨床預(yù)測(cè)模型中的所有的檢驗(yàn),如模型構(gòu)建、模型間AIC比較、區(qū)分度、校準(zhǔn)度、臨床決策曲線、nomo圖,甚至Lasso、交叉驗(yàn)證等等!
   而所有基本一行代碼,完美呈現(xiàn)!所以松哥切身感到,生物醫(yī)藥領(lǐng)域?qū)τ赟tata著實(shí)有點(diǎn)低估了!如下為STATA臨床預(yù)測(cè)模型部分統(tǒng)計(jì)圖展現(xiàn),供各位重新審視統(tǒng)計(jì)提供參考!

模型展示結(jié)果:Nomogram

校準(zhǔn)度:Calibration Plot

區(qū)分度展示結(jié)果:ROC曲線

臨床適用性展示:DCA(臨床決策曲線)

交叉驗(yàn)證:CV plot

變量篩選:Lasso

松哥統(tǒng)計(jì)說(shuō)






    本文就是給大家提供一個(gè)方向與選擇,并未傳授具體的實(shí)踐,若大家有意,4月份精鼎統(tǒng)計(jì)將開設(shè)《基于SPSS與Stata的臨床預(yù)測(cè)模型研習(xí)班》,屆時(shí)將會(huì)干貨滿滿,關(guān)鍵簡(jiǎn)單易學(xué),案例實(shí)戰(zhàn),掌握一門SCI利器,助力科研與職稱雙豐收!時(shí)間為周末兩天,暫定價(jià)格3000元,提前報(bào)名享受早鳥價(jià)格2000(限前10名),有意聯(lián)系微信:data916。

    本期學(xué)員將贈(zèng)送松哥編寫的SPSS插件,可以對(duì)Logistic回歸和Cox回歸實(shí)現(xiàn)一鍵統(tǒng)計(jì)分析,一鍵制表!


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