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9篇17分重磅綜述:聚焦菌群產(chǎn)學(xué)研

 成靖 2020-12-19
9篇17分重磅綜述:聚焦菌群產(chǎn)學(xué)研

“健康”微生物組的多態(tài)多元性(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 微生物組即在機體中共生菌群基因信息的集合,含細菌、病毒和真菌。其“健康”的定義受環(huán)境、飲食及生活方式等因素影響;② 定義“健康”微生物組就要正確分類、找出核心菌群并采用離群值細化范疇;③ 如以社會工業(yè)化程度、非傳播性慢性疾病風(fēng)險作為指標界定工業(yè)化、非工業(yè)化菌群;④ 微生物組具功能冗余性,采用保守的功能性定義如代謝更能區(qū)分常態(tài)、非常態(tài);⑤ 還需關(guān)注菌種特異性、生物節(jié)律、微生物組在人生進程中的進化等重要參數(shù)。

【主編評語】

從2008年人類微生物組工程(HMP)開啟至今,我們對微生物的認知越來越廣泛也越來越深化。在繼續(xù)推進微生物診斷、微生物療法向臨床轉(zhuǎn)化前,應(yīng)該更準確的給出什么才是健康腸道微生物組的定義。Gastroenterology發(fā)表的綜述對此進行了探討。顯然“健康”微生物組是一個受多因素影響、多態(tài)多元的概念。不同群體都需建立相應(yīng)的標準參。在這十多年的研究中,我們獲得了很多已知,但還有更多已知的未知,和未知的未知需要探索。其中一個大方向在最近幾篇綜述中均有提及,即腸道研究從菌群組成轉(zhuǎn)向菌群功能性分類。(@好雨)

【原文信息】

The Healthy Microbiome (What is the definition of a healthy gut microbiome?)

2020-11-26, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.057


一文讀懂IBD與菌群的密切關(guān)聯(lián)(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 無菌條件下IBD不易感,反之IBD患者腸道菌群多樣性下降、厚壁菌門減少、變形桿菌增多,表明其菌群基礎(chǔ);② 菌群失調(diào)也包括真菌、噬菌體及古細菌,除了區(qū)分類群更應(yīng)注重菌群的功能性變化;③ 菌群失調(diào)誘發(fā)因素:遺傳、免疫、膳食、代謝產(chǎn)物如膽酸鹽、腸道屏障完整性及嬰幼兒時期的環(huán)境擾動;④ IBD由共生致病菌引起或關(guān)鍵共生菌減少,特別是其重要功能無法維系;⑤ 治療包括手術(shù)、藥物、益生素、益生菌、糞菌移植等,以及新興的后生元。

【主編評語】

Gastroenterology發(fā)表的綜述,詳細討論了IBD背后的腸道菌群基礎(chǔ),總結(jié)看來答案并不或從不唯一。文章內(nèi)容十分全面,意在為相關(guān)流行病學(xué)、發(fā)病機理、及致病因素的分析提供一個概念框架。特別值得注意的是,文章反復(fù)提出對于IBD菌群失調(diào)和開發(fā)相應(yīng)治療手段,更應(yīng)關(guān)注功能類群而非個別菌種。(@好雨)

【原文信息】

Inflammatory Bowel Diseases (IBD) (Inflammatory Bowel Diseases and the Microbiome: Searching the Crime Scene for Clues)

2020-11-26, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.056


腸道菌群調(diào)控體重、脂質(zhì)代謝及胰島素敏感性的機制

Gastroenterology——[17.373]

① 腸道菌群通過調(diào)節(jié)能量的提取、處理及貯存、白色脂肪組織褐變、代謝產(chǎn)生吲哚調(diào)節(jié)microRNA等方式調(diào)控體重;② 腸道菌群可通過膽汁酸、短鏈脂肪酸等代謝產(chǎn)物以影響脂質(zhì)的吸收與清除,從而調(diào)控脂質(zhì)代謝;③ 腸道菌群衍生的代謝產(chǎn)物,包括丙酸咪唑、色氨酸衍生代謝產(chǎn)物、吲哚、犬尿氨酸、5-羥色胺、支鏈氨基酸、短鏈脂肪酸可影響胰島素抵抗;④ 靶向調(diào)控腸道菌群及其代謝產(chǎn)物、限制熱量攝入、間歇性禁食等手段可改善代謝。

【主編評語】

腸道菌群的變化與肥胖及2型糖尿病相關(guān)。來自Gastroenterology上發(fā)表的一篇綜述文章,詳細介紹了腸道菌群調(diào)控體重、脂質(zhì)代謝及胰島素抵抗的機制,并討論了通過靶向調(diào)控菌群、飲食干預(yù)等方式改善代謝疾病的可能。(@szx)

【原文信息】

Metabolism and Metabolic Disorders and the Microbiome: The intestinal microbiota associated with obesity, lipid metabolism and metabolic health: pathophysiology and therapeutic strategies

2020-11-26, doi: 10.1053/j.gastro.2020.10.057


菌群對腫瘤發(fā)展、抗腫瘤免疫及腫瘤免疫治療的影響(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 幽門螺桿菌釋放CagA、VacA等毒力因子引起胃上皮細胞的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激、自噬及氧化應(yīng)激,以促進胃癌發(fā)展;② 具核梭桿菌通過毒力因子FadA上調(diào)原癌基因表達等機制促進結(jié)直腸癌;③ 次級膽汁酸、LPS等腸道菌群代謝產(chǎn)物進入肝臟,促進肝癌發(fā)展及免疫逃逸;④ 腸道菌群通過多種方式影響抗腫瘤免疫應(yīng)答及腫瘤治療:瘤內(nèi)細菌對藥物的修飾、細菌代謝產(chǎn)物及MAMP對抗原呈遞細胞的激活/脫敏、誘導(dǎo)T細胞對腫瘤抗原的交叉應(yīng)答、誘導(dǎo)免疫細胞的抑制性表型等。

【主編評語】

來自Gastroenterology上發(fā)表的一篇綜述文章,詳細介紹了在結(jié)直腸癌、肝癌、胃癌及胰腺癌等癌癥中,腸道菌群對腫瘤發(fā)生發(fā)展、局部及全身的抗腫瘤免疫應(yīng)答、PD-1單抗及CTLA-4單抗等腫瘤免疫治療的調(diào)控機制。(@szx)

【原文信息】

Cancer and the Microbiome: Influence of the commensal microbiota on cancer, immune responses, and immunotherapy

2020-11-27, doi: 10.1053/j.gastro.2020.11.041


腸道菌群與慢性肝病綜合管理(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 腸道菌群失調(diào)是所有慢性肝?。–LD)共有特征,菌群隨病程(前期-進展-惡化)變化并起重要作用;② 無菌動物和糞菌移植揭示菌群是CLD同謀,其中致病共生菌決定肝臟損傷程度;③ 菌群是卓越的生物感受器,在CLD的肝-腦-腸軸中至關(guān)重要;④ 菌群和宿主在飲食、生活方式改變下繼續(xù)共同進化;⑤ 飲食(如富含纖維)、益生菌治療等或可通過調(diào)節(jié)菌群改善CLD;⑥ 微生物療法應(yīng)聚焦相關(guān)檢測、肝臟移植前或危重病護理、口腸軸、個性化飲食和噬菌體療法等。

【主編評語】

隨著肥胖、非酒精性脂肪肝和酗酒的日益增多,慢性肝?。–LD)已成為流行病,發(fā)病率及死亡率均不可小覷。Gastroenterology發(fā)表綜述,討論微生物組與CLD的相關(guān)性。CLD病因復(fù)雜,與遺傳背景、并發(fā)癥、社會經(jīng)濟因素及飲食相關(guān),需要分而視之。舉例說明,酒精性肝病和非酒精性脂肪肝在北美、歐洲常見,而非洲、亞洲則更多見乙肝病毒感染。盡管如此,腸道菌群失調(diào)卻越來越被認同作為各種CLD共同點之一。這一認識有助于我們對CLD的了解,以期達到盡早診斷,綜合治療的目的。文章圖文并茂,并提出了很多需要關(guān)注的問題和未來研究領(lǐng)域。(@好雨)

【原文信息】

Chronic Liver Diseases and the Microbiome: Translating Our Knowledge of Gut Microbiota to Management of Chronic Liver Disease

2020-11-27, doi: 10.1053/j.gastro.2020.10.056


基于菌群的功能性胃腸病治療,如何邁向臨床轉(zhuǎn)化?(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 不少研究報道了IBS患者腸道菌群的組成和代謝物(SCFA、GABA、膽汁酸等)變化及其潛在的致病機制(腸屏障、免疫活化、神經(jīng)反應(yīng)等),但尚無定論;② 目前菌群導(dǎo)向的IBS干預(yù)方法有益生菌/元、飲食、抗生素、糞菌移植等,仍需深入研究;③ 功能性胃腸病中,相互增強的宿主和菌群的變化或是重要因素;④ 基于癥狀、生理和多組學(xué)的方法可對患者精細分類,研發(fā)針對特定疾病機制的菌群干預(yù)(多菌、單菌、微生物代謝物、微生物過程)。

【主編評語】

Gastroenterology近期發(fā)表來自美國梅奧醫(yī)學(xué)中心的綜述,回顧了目前在腸道菌群與功能性胃腸病(特別是腸易激綜合征IBS)的研究所取得的進展,重點探討了未來開發(fā)菌群療法的研究策略,推薦專業(yè)人士參考。(@mildbreeze)

【原文信息】

Functional Gastrointestinal Disorders and the Microbiome: What is the best strategy for moving microbiome-based therapies for functional gastrointestinal disorders into the clinic?

2020-11-27, doi: 10.1053/j.gastro.2020.10.058


菌群如何影響兒童發(fā)育的方方面面?(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 腸道微生物組通過調(diào)節(jié)能量代謝、生長激素信號、病菌定植以及炎癥反應(yīng)等影響兒童早期發(fā)育,或可決定生長表型好壞;② 菌群與神經(jīng)系統(tǒng)并行發(fā)育,失調(diào)可導(dǎo)致神經(jīng)發(fā)育不良、多動癥等神經(jīng)精神疾??;③ 先天免疫保護嬰兒腸道不受病菌侵擾,反之菌群影響腸道相關(guān)淋巴組織發(fā)育及胸腺形成;④ “斷奶反應(yīng)”是菌群與免疫互作的放大反應(yīng),也是調(diào)節(jié)腸道菌群的“關(guān)鍵窗”;⑤ 早期菌群失調(diào)可導(dǎo)致過敏、哮喘,而調(diào)節(jié)性T細胞生成則可產(chǎn)生長期腸-肺軸免疫保護。

【主編評語】

兒童早期發(fā)育包括了生理、心理以及情緒的變化??煞譃閶雰浩?、學(xué)齡前、兒童中期以及青春期四個階段。Gastroenterology發(fā)表綜述,討論從生命之初到青春期結(jié)束的時間里,腸道微生物組作為一個多功能器官系統(tǒng)如何影響人類發(fā)育的方方面面。包括菌群與大腦、免疫系統(tǒng)以及肺功能的發(fā)育之間的關(guān)系。(@好雨)

【原文信息】

Childhood Development and the Microbiome: The Intestinal Microbiota in Maintenance of Health and Development of Disease During Childhood Development

2020-12-07, doi: 10.1053/j.gastro.2020.08.065


菌群失調(diào)或可加速衰老?(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 衰老、衰弱人群常呈現(xiàn)腸道菌群紊亂、免疫力下降及代謝功能失調(diào);② 菌群失調(diào)特別是產(chǎn)丁酸菌減少和促炎菌增多,或可導(dǎo)致老年性衰弱;③ 也可能加重炎性衰老及免疫衰老,誘發(fā)阿爾茲海默癥、帕金森等老年疾?。虎?使用抗生素或其它藥物可引起菌群失調(diào)及多藥耐藥菌的產(chǎn)生,特別是在養(yǎng)老院護理系統(tǒng)中;⑤ 長壽人群菌群多樣性高且富含產(chǎn)短鏈脂肪酸的有益菌;⑥ 關(guān)注功能性核心菌群,采用益生菌、益生元和健康飲食等手段或可調(diào)節(jié)菌群從而延緩衰老。

【主編評語】

社會老齡化已經(jīng)是一個全球現(xiàn)象。Gastroenterology發(fā)表的綜述探討了腸道微生物組與衰老及老年性疾病的關(guān)系。深度解析了腸道菌群失調(diào)如何影響衰老、衰弱等人類生理狀態(tài),也相應(yīng)討論了年輕化菌群是否能延緩衰老以及如何使菌群年輕化。怎樣才能健康地老去?與腸道菌群又何相干?也許在閱讀此篇綜述的同時,也可再翻看由現(xiàn)代微生物學(xué)與免疫學(xué)開創(chuàng)元老élie Metchnikoff撰寫的《壽命延長:樂觀的研究》這本書。(@好雨)

【原文信息】

Aging, Frailty, and the Microbiome: How Dysbiosis Influences Human Aging and Disease

2020-12-07, doi: 10.1053/j.gastro.2020.09.060


如何破除益生菌市場亂象,讓大眾更好的了解益生菌產(chǎn)品?(綜述)

Gastroenterology——[17.373]

① 菌群研究的進展促進了益生菌產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,但由于監(jiān)管等問題,對益生菌產(chǎn)品健康益處的聲明目前仍存在亂象,這不僅對醫(yī)生和消費者造成困擾,也為開展相關(guān)研究帶來阻礙;② 為解決這一問題,需要聯(lián)合學(xué)術(shù)界、專業(yè)組織和產(chǎn)業(yè)界,建立沒有利益沖突的專業(yè)機構(gòu),采用GRADE分析評估益生菌產(chǎn)品臨床益處的證據(jù)等級,嚴格評價產(chǎn)品質(zhì)量,并公開相關(guān)信息供大眾參考;③ 這將有助于益生菌企業(yè)和產(chǎn)品獲得大眾信任,構(gòu)建更好的市場秩序。

【主編評語】

Gastroenterology近期發(fā)表的綜述,回顧了益生菌的發(fā)展歷史,介紹了益生菌產(chǎn)品的監(jiān)管分類,針對如何改善目前益生菌產(chǎn)品健康益處聲明中存在的問題,提出了一種解決方案,希望能夠促進開展高質(zhì)量的益生菌研究,增加公眾信任,改善市場秩序。(@mildbreeze)

【原文信息】

Probiotics and the Microbiome: How can we help patients make sense of probiotics?

2020-12-08, doi: 10.1053/j.gastro.2020.11.047


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