學(xué)院有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、口腔醫(yī)學(xué)院、藥學(xué)院、生命科學(xué)院、護理學(xué)院等6所學(xué)院。

開設(shè)本科專業(yè)臨床醫(yī)學(xué)、法醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、生物科學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗與技術(shù)、醫(yī)學(xué)信息學(xué)、麻醉醫(yī)學(xué)、精神醫(yī)學(xué)。

國家重點學(xué)科（二級學(xué)科）：病理學(xué)與病理生理學(xué)、遺傳學(xué)、藥理學(xué)、精神病與精神衛(wèi)生學(xué)、神經(jīng)病學(xué)、胸心外科學(xué)、內(nèi)分泌與代謝病學(xué)、耳鼻咽喉科學(xué)、普通外科學(xué)

省級重點學(xué)科（一級學(xué)科）：內(nèi)科學(xué)、外科學(xué)、婦產(chǎn)科學(xué)、皮膚病與性病學(xué)、兒科學(xué)、眼科學(xué)、護理學(xué)、腫瘤學(xué)、醫(yī)學(xué)心理學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)學(xué)、特種醫(yī)學(xué)

一級學(xué)科博士后流動站：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合、藥學(xué)、特種醫(yī)學(xué)、護理學(xué)

WHO研究合作中心：湘雅國際轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)聯(lián)合研究院

國家重點實驗室：醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國家重點實驗室

國家地方聯(lián)合工程實驗室：抗癌藥物國家地方聯(lián)合工程實驗室

國家工程研究中心：人類干細胞國家工程研究中心

國家臨床醫(yī)學(xué)研究中心：中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院國家代謝性疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院國家精神心理疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心

教育部重點實驗室：教育部癌變與侵襲原理重點實驗室、教育部糖尿病免疫學(xué)重點實驗室

衛(wèi)生部重點實驗室：衛(wèi)生部癌變原理重點實驗室、衛(wèi)生部腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)重點實驗室、衛(wèi)生部納米生物技術(shù)重點實驗室、衛(wèi)生部人類干細胞與生殖工程重點實驗室

國家中醫(yī)藥管理局重點實驗室：中醫(yī)肝藏象重點實驗室