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ASCO 2020丨一項針對MET 14外顯子跳躍突變肺癌患者的分析

 松s214lluoyg5s 2020-06-14


MET基因14外顯子跳躍是非小細胞肺癌(NSCLC)的驅(qū)動癌基因。由于MET 14外顯子的周圍有眾多位點可結(jié)合剪接體復(fù)合物,很多基因變異都可導(dǎo)致不利的基因改變。2020 ASCO的一項口頭匯報研究(摘要9511),介紹了MET 14外顯子跳躍突變(METex14 SA)患者的特征和潛在獲得性耐藥機制(摘要9511)。

這項研究采用基于NGS的雜交捕獲測序方法,分析了60 495例NSCLC患者的基因,共發(fā)現(xiàn)1 387例(2.3%)NSCLC患者攜帶MET 14外顯子跳躍突變。研究人員對1 378例患者進行檢測,以驗證潛在的獲得性耐藥機制。
在1 387例MET 14外顯子跳躍突變NSCLC患者中,共檢測出1393種MET 14外顯子跳躍突變,橫跨多個功能位點:供體區(qū)(donor,42%)、受體區(qū)(acceptor,4.7%)、多嘧啶序列(poly-pyrimidine tract,15%)、受體和多嘧啶序列(13%)、D1010(23%)、Y1003(2.1%)和全外顯子缺失(whole exon deletions,0.3%)(圖1)。其中,6個樣本(5個組織樣本,1個ctDNA)攜帶2個MET 14外顯子跳躍突變。

圖1. 1387例NSCLC樣本的MET 14外顯子跳躍突變
此外,腫瘤突變負(fù)荷(TMB)在MET 14外顯子突變NSCLC中的分布顯著低于MET ex14野生型NSCLC, TMB中位數(shù)分別為3.6 vs. 7.0mut/Mb(P<0.001)。供體區(qū)的TMB分布顯著低于受體區(qū)、PPT和D1010。

圖2. TMB分布
然而,MET 14外顯子跳躍突變NSCLC的PD-L1高表達(≥50%)比例高于野生型,分別為48% vs. 29%(p=5.5E-19),PD-L1陽性率在MET 14外顯子突變的各功能位點亞組的分布情況相似。在所有MET 14外顯子跳躍突變NSCLC病例中,TMB和PD-L1表達沒有相關(guān)性(P=0.76)。

圖3. PD-L1高表達情況
MET 14外顯子跳躍突變NSCLC樣本中,32%合并 MDM2 擴增;19% 合并 CDK4 擴增;12%存在MET擴增。在MET 14外顯子跳躍突變患者中,其他合并驅(qū)動基因罕見,所有METex 14樣本中 KRAS突變占3.2%,EGFR突變比例為0.65%。

圖4. METex14 合并其他基因改變
36 例患者提供了配對樣本,在第二份樣本中檢測到32名患者的MET 14外顯子跳躍突變。22/36例(61%)患者的二次標(biāo)本存在獲得性改變。其中,9 例(25%)具有 ≥ 1 種獲得性 MET 突變 [D1228X (4)、Y1230X (3)、Y1003F (1)、D1228A/E/H L1195V (1)] ,3 例(8%)患者存在獲得性 MET 擴增(圖5)。其他獲得性改變包括 ERBB2 擴增和突變、EGFR ex19 插入、KRAS 擴增、PIK3CA 突變、AKT2 擴增以及其他功能意義不明的基因改變。

圖5. 36例患者的獲得性耐藥情況
小結(jié):在60 495例 NSCLC 患者中,MET 14外顯子跳躍突變存在于 2.3% NSCLC樣本中,METex14功能位點合并許多其他基因共變異(CDK4,MDM2,MET擴增)。MET 14外顯子跳躍突變NSCLC中,PD-L1高表達和低TMB的比例更高,未來需要更多數(shù)據(jù)來確認(rèn)這些標(biāo)志物對免疫治療反應(yīng)的預(yù)測性作用。獲得性耐藥機制包括二次MET突變(25%)、MET擴增(8%)、EGFR/ERBB2激活、KRAS擴增和PI3K突變。

參考文獻

Mark M. Awad, et al. Characterization of 1,387 NSCLCs with MET exon 14 (METex14) skipping alterations (SA) and potential acquired resistance (AR) mechanisms. Presented at: 2020 ASCO Virtual Scientific Program; May 29, 2020. Abstract 9511.




(來源:《腫瘤瞭望》編輯部)

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