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Matlab是一個(gè)商業(yè)軟件，現(xiàn)在后悔一開(kāi)始學(xué)習(xí)Matlab了。想慢慢轉(zhuǎn)移到python平臺(tái)，找找有哪些圖像處理的庫(kù)。 1. ITK 這是醫(yī)學(xué)圖像處理最流行的庫(kù)了，雖然是使用C++語(yǔ)言編寫(xiě)的，但也提供了齊全的python綁定。在編譯的時(shí)候，可以選擇綁定python。這樣就可以直接用python調(diào)用ITK函數(shù)了。在ubuntu里，源里面就有，直接安裝即可。通過(guò)import itk即可載入ITK函數(shù)庫(kù)。 另外，為了進(jìn)一步簡(jiǎn)化ITK的使用，最近出現(xiàn)了一個(gè)SimpleITK的項(xiàng)目。SimpleITK省略了模板的使用，更符合python的編程模式。SimpleITK目前正在開(kāi)發(fā)，還缺少很多庫(kù)函數(shù)，尤其是配準(zhǔn)部分，因此，暫時(shí)還不能滿足我的需求。 2. PIL/Pillow 試用了一下，感覺(jué)功能非常簡(jiǎn)單，而且是針對(duì)二維圖片設(shè)計(jì)的，顯然無(wú)法滿足我們處理海量圖像數(shù)據(jù)集的需要。 結(jié)論：不能滿足需求。 官方網(wǎng)站： https://pypi./pypi/Pillow/2.4.0 教程： http://pillow./en/latest/handbook/tutorial.html 3. VIGRA 針對(duì)多維圖像數(shù)據(jù)集設(shè)計(jì)，而且有很強(qiáng)的并行能力。其中的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)可以在python和C++之間無(wú)縫轉(zhuǎn)換！這個(gè)軟件維護(hù)還比較活躍，最新版是13年11月。 關(guān)鍵是有應(yīng)用案例，處理的是海量的電鏡成像神經(jīng)元結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)集，這點(diǎn)與我的職業(yè)發(fā)展方向吻合！展示的圖片中顯示了優(yōu)美的三維結(jié)構(gòu)，也表明軟件處理結(jié)果可以完美地展現(xiàn)。 缺點(diǎn)：缺乏配準(zhǔn)功能模塊。 結(jié)論：值得深入研究。 官方網(wǎng)站： 介紹的ppt 基于這個(gè)庫(kù)，衍生出了一個(gè)軟件ilastik 官方網(wǎng)站：http://www./index.php?cat=Home 4. Medpy 由著名的LOLI開(kāi)發(fā)，滿足海量高維圖像處理的需求，其中核心的應(yīng)用是圖割分割。Medpy基于Python-ITK，屬于ITK以上的高級(jí)庫(kù)吧。另外，Medpy是一個(gè)很好的學(xué)習(xí)怎么用python玩轉(zhuǎn)ITK的例子，可以看Medpy的代碼來(lái)學(xué)習(xí)怎么用Python-ITK。 主頁(yè)，其中有ITK的編譯和配置步驟（解決了一個(gè)ITK的bug） https://pypi./pypi/MedPy/0.1.0 5. openCV openCV是計(jì)算機(jī)視覺(jué)領(lǐng)域的開(kāi)源庫(kù)，主要是處理視頻的，因此，多維圖像處理方面還不是特別適合。但是openCV的目標(biāo)是實(shí)時(shí)的視頻處理，因此，里面的函數(shù)計(jì)算速度都很快，可以用于二維圖像的快速處理，而且有很多基本的函數(shù)，用于預(yù)處理和特征提取還是非常合適的。 python-opencv可以直接在ubuntu源里面安裝，調(diào)用方式是import cv2 python-opencv官方教程 這個(gè)教程雖然是對(duì)應(yīng)opencv3的，但大部分內(nèi)容對(duì)目前的2.X也適用（親測(cè)可用）。 6. IRTK (Image Registration toolkit) 顧名思義，IRTK主要是用于配準(zhǔn)的。作者并沒(méi)有基于ITK，而是自己實(shí)現(xiàn)很多基本圖像處理和配準(zhǔn)的函數(shù)。根據(jù)作者的解釋?zhuān)@個(gè)工具包相對(duì)于ITK和SimpleITK的優(yōu)點(diǎn)就是調(diào)用簡(jiǎn)單！如果是這樣的話，學(xué)這個(gè)工具還不如學(xué)習(xí)更為通用的ITK了。 官方網(wǎng)站 python調(diào)用的方法 7. (Astronomical) Image Registration 同樣是基于python的，但主要是面對(duì)天文成像圖片的。根據(jù)作者的描述，特點(diǎn)是可以適應(yīng)對(duì)比度差異大的圖像間配準(zhǔn)。 http://image-registration./en/latest/index.html 在2012年，一幫圖像處理牛人搞了個(gè)會(huì)議，討論并且推動(dòng)大家從Matlab轉(zhuǎn)到python平臺(tái)，并且做了很好的總結(jié)。 有很多文件可以從會(huì)議的網(wǎng)站下載到 http://code.google.com/p/python-for-matlab-users/ 包括一個(gè)演講的ppt，相當(dāng)于做了個(gè)完整的綜述 用python調(diào)用openCV的例子
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