第一、中央司法機關

1. 大理寺

大理寺為中央審判機關，內設左斷刑、右治獄。左斷刑負責讞獄（地方上報復審的案件）和地方官吏犯罪案件；右治獄負責京師百官犯罪案件。

實行了“審”與“判”相分立的制度，由斷司負責審訊；議司負責判決、用法。

2. 刑部

刑部為中央司法行政機關，負責復核全國死刑已決案件以及官員敘復、昭雪等事。神宗改制后，審刑院并入刑部，職權有所擴大。

3. 審刑院

審刑院是由宋太宗時設立，院知事一人為其長，下設詳議官六人，為皇帝御用機構，操控司法。

凡地方上報的案件，都需要先交給審刑院備案，然后再交給大理寺復審，再返回審刑院詳議并奏請圣裁。

但凡大理寺審判的案件，經過刑部復核后，還須送審刑部院詳議，再奏請皇帝批準。

第二、地方司法機關

1. 路

設提點刑獄司（提刑司），為中央在各路的司法派出機構，擁有對各州死刑案件的復核權，同時對各州進行司法監(jiān)督。

2. 州

州設專職司法官司理參軍和司法參軍，分別負責案件的調查審訊和法律適用。體現(xiàn)了審與叛的分立。

3. 縣

形成縣知事親自坐堂問案制度。