土壤消毒常用的方法有日光高溫消毒、新鮮生石灰消毒、石灰氮（氰氨化鈣）消毒、化學(xué)藥劑（百菌清、多菌靈、咯菌腈等）消毒等方法。

1、日光高溫消毒，比較適合蔬菜大棚土壤消毒，在夏季高溫季節(jié)，利用蔬菜大棚休棚時(shí)間，土壤適量灌水后覆蓋地膜，然后密閉大棚，利用自然光熱進(jìn)行高溫消毒，可以殺滅土壤淺層病菌和害蟲，環(huán)保無污染。

2、新鮮生石灰消毒。新鮮的生石灰具有強(qiáng)堿性，對喜歡酸性的土傳病害病菌具有比較好的殺滅作用，同時(shí)還可以調(diào)節(jié)土壤酸堿度，還可以補(bǔ)充鈣肥，只要不是土壤呈現(xiàn)比較高的堿性土壤都可以采取這種方法進(jìn)行消毒。

3、石灰氮消毒。石灰氮名字比較多，通常又稱氰氨化鈣、碳氮化鈣、氨腈鈣、氰胺鈣等，呈堿性，純品含氮量約為 30%，含鈣量為 50%,是非常好的堿性氮肥和鈣肥，也是生產(chǎn)多菌靈的主要原料之一。其與土壤中的水分發(fā)生反應(yīng)，生成氨氣和氧化鈣，其中中間產(chǎn)物氰胺具有非常好的除草、殺蟲、殺菌的作用，尤其對線蟲、蛆蟲，以及土傳病害枯萎病、根腐病、姜瘟病等頑固性病菌具有很好的殺滅作用，常用于溫室大棚土壤消毒。

在使用時(shí)要把石灰氮均勻撒于地表，翻耕后覆蓋地膜，然后膜下灌水，密閉消毒15天后揭去地膜通風(fēng)，兩天后即可開始播種。

優(yōu)點(diǎn)是無污染、無殘留、效果好，缺點(diǎn)是價(jià)格高、用量大、投資多。

4、化學(xué)藥劑消毒。常用的土壤消毒化學(xué)藥劑有百菌清（克菌靈）、惡霉靈、多菌靈、咯菌腈等藥劑。這幾種藥劑具有殺菌譜廣、效果好、持續(xù)時(shí)間長等特點(diǎn)，適合在土壤消毒、拌種、灌根時(shí)使用。