問題與數(shù)據(jù) 某研究者擬觀察某新藥的抗腫瘤效果,將70名肺癌患者隨機分為兩組,分別采用該新藥和常規(guī)藥物進行治療,觀察兩組肺癌患者的生存情況,共隨訪2年。研究以死亡為結(jié)局,兩種治療方式為主要研究因素,同時考慮調(diào)整年齡和性別的影響,比較兩種療法對肺癌患者生存的影響是否有差異。變量的賦值和部分原始數(shù)據(jù)見表1和表2。 表1. 肺癌患者生存的影響因素與賦值 表2. 兩組患者的生存情況 對數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的分析 該研究以死亡為結(jié)局,治療方式為主要研究因素,每個研究對象都有生存時間(隨訪開始到死亡、失訪或隨訪結(jié)束的時間),同時考慮調(diào)整年齡和性別的影響。欲了解兩種療法對肺癌患者生存的影響是否有差異,可以用Cox比例風(fēng)險模型(Cox proportional-hazards model,也稱為Cox回歸)進行分析。 實際上,Cox回歸的結(jié)局不一定是死亡,也可以是發(fā)病、妊娠、再入院等。其共同特點是,不僅考察結(jié)局是否發(fā)生,還考察結(jié)局發(fā)生的時間。 在進行Cox回歸分析前,如果樣本不多而變量較多,建議先通過單變量分析(KM法繪制生存曲線、Logrank檢驗等)考察所有自變量與因變量之間的關(guān)系,篩掉一些可能無意義的變量,再進行多因素分析,這樣可以保證結(jié)果更加可靠。即使樣本足夠大,也不建議把所有的變量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各個變量之間的相互關(guān)系,確定自變量進入方程的形式,這樣才能有效的進行分析。 單因素分析后,應(yīng)當(dāng)考慮應(yīng)該將哪些自變量納入Cox回歸模型。一般情況下,建議納入的變量有:1)單因素分析差異有統(tǒng)計學(xué)意義的變量(此時,最好將P值放寬一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);2)單因素分析時,沒有發(fā)現(xiàn)差異有統(tǒng)計學(xué)意義,但是臨床上認(rèn)為與因變量關(guān)系密切的自變量。 (敲黑板:上面兩段加粗部分是重點,重點,重點?。。。?/p> 1. 數(shù)據(jù)錄入SPSS 2. Analyze→Survival→Cox Regression 3.選項設(shè)置 1)主對話框設(shè)置: ①將生存時間變量送入Time框中→②將結(jié)局變量送入Status框中→③點擊Define Event→④定義表示終點事件發(fā)生的數(shù)值(此例中為死亡,用1表示)→⑤Continue→⑥將分組因素和需要調(diào)整的變量送入Covariates框中→⑦Method選擇Forward:LR。 對于自變量篩選的方法(Method對話框),SPSS提供了7種選擇,使用各種方法的結(jié)果略有不同,讀者可相互印證。各種方法之間的差別在于變量篩選方法不同,其中Forward: LR法(基于最大似然估計的向前逐步回歸法)的結(jié)果相對可靠,但最終模型的選擇還需要獲得專業(yè)理論的支持。 2)Categorical Covariates選項設(shè)置: ①將分類變量group選入右側(cè)Categorical Covariates里,②并選擇Reference Category以First為參比(即選擇最小數(shù)值為參照組),其他按默認(rèn)選項→③Change→Continue 注意:在數(shù)據(jù)錄入時,建議將二分類變量賦值為0和1;多分類變量賦值為0、1、2、3或者1、2、3、4等,并根據(jù)以下情況設(shè)置Categorical Covariates選項: A. 以下情況,可以不定義Categorical Covariates選項:當(dāng)自變量是二分類變量,并且賦值的差值為1,例如賦值為0和1,也不需要繪制該變量不同組間的生存曲線時。 B. A以外的情況都必須定義Categorical Covariates選項。需特別注意兩種情況:①當(dāng)自變量是二分類變量,但要在Plots選項中設(shè)置,得到不同組間的生存曲線時。比如本例中,group為二分類變量,但要觀察不同用藥組間的生存曲線,就需要在Categorical Covariates選項中定義group變量;②多分類變量時。 3)Plots選項設(shè)置: 要繪制生存曲線,①可選擇Plots Type中的Survival作為輸出的圖形,②將主要分類變量選入右側(cè)Separate lines for中,可以輸出該變量不同組間對應(yīng)的生存曲線,其他按默認(rèn)選項→Continue 4)Options選項設(shè)置: ①選擇Model Statics中的CI for exp(B)要求輸出HR值的95%置信區(qū)間,②選擇Display model imformation中的At last step(即要求僅輸出最后一步的模型),其他按默認(rèn)選項→Continue→OK 結(jié)果解讀 (1)Case Processing Summary表格給出了分析數(shù)據(jù)的基本情況,其中包括事件發(fā)生數(shù)(Event)、刪失數(shù)(Censored)和總數(shù)(Total)等信息。 (2)Categorical Variable Codings表格給出了Categorical Covariates選項中設(shè)置的變量(本例中為group)所對應(yīng)的賦值情況和頻率(Frequency)。最后一列給出了變量編碼的情況。腳注b. Indicator Parameter Coding說明了本研究中g(shù)roup變量以First為參照組(Categorical Covariates選項中的設(shè)置)。 (3)Omnibus Tests of Model Coefficients表格給出了模型中所有變量的回歸系數(shù)全為0的檢驗結(jié)果。對于本例,①Score統(tǒng)計量為5.065, P=0.024;②對數(shù)似然比檢驗χ2=5.399, P=0.020。說明模型中至少有一個自變量的HR值不為1,模型整體檢驗有統(tǒng)計學(xué)意義。 (4)Variables in the Equation表格給出了參數(shù)估計的結(jié)果。結(jié)果顯示最后篩選后的模型僅包含group變量,①P=Sig.=0.029說明治療方式為影響肺癌患者預(yù)后的獨立因素。②相對危險度HR=Exp(B)=0.410,說明使用新藥的患者死亡風(fēng)險為使用常規(guī)藥物患者的0.410倍,③HR的95%可信區(qū)間(95% CI)為0.184-0.914。 (5) 生存曲線。前述Plots選項的設(shè)置要求輸出按照不同藥物分組的生存曲線。新藥組(賦值為1,綠色線條)比常規(guī)藥物組(賦值為0,藍(lán)色線條)的生存率高。值得注意的是,該圖片并未編輯,不符合給雜志投稿的要求。關(guān)于圖片的編輯此處不再展開討論。 撰寫結(jié)論 治療方式為影響肺癌的獨立因素(P=0.029)。與常規(guī)藥物相比,使用新藥的肺癌患者的死亡風(fēng)險低于使用常規(guī)藥物的患者,HR=0.410(95% CI: 0.184-0.914)。 備注 Cox回歸使用的前提是滿足比例風(fēng)險假定(PH假定),即主要研究因素(包括Covariates框中放入的其它協(xié)變量)的各層間均應(yīng)滿足PH假定。如果不滿足,則應(yīng)當(dāng)將變量放入Strata框中進行分層變量控制。 具體如何判斷各變量是否滿足PH假定,以及如何設(shè)置Strata對話框?qū)ψ兞窟M行分層控制,咱們以后再聊。 |
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