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lncRNA m6A甲基化:RNA m6A甲基化促進lncRNA XIST介導(dǎo)的X染色體沉默

 生物_醫(yī)藥_科研 2018-12-27

該研究由美國康奈爾大學(xué)和加州理工學(xué)院的研究者共同完成,發(fā)表在2016年Nature雜志上,文章揭示了m6A甲基化對于lncRNA XIST介導(dǎo)X染色體基因沉默或失活的重要性。


XIST(X-inactive specific transcript)是雌性哺乳動物細胞中失活的X染色體上轉(zhuǎn)錄的一個長鏈非編碼RNA,介導(dǎo)兩條X染色體中一條X染色體上的基因的失活或沉默。


作者的研究表明,XIST是高度甲基化的,有至少78個甲基化位點。而XIST上的m6A甲基化對于其介導(dǎo)X染色體基因失活必不可少,其作用過程可描述如下:

1. XIST 發(fā)生m6A修飾:由RBM15(RNA-binding motif 蛋白15)/RBM15B(RBM15的旁系同源蛋白)-WTAP-METTL3構(gòu)成的甲基化復(fù)合體被招募至XIST上特定的區(qū)域,完成XIST的m6A甲基化。

2.甲基化識別及基因沉默:甲基化修飾識別蛋白YTHDC1與XIST上的m6A甲基化區(qū)域結(jié)合,同時招募沉默蛋白,進而完成整個基因抑制過程。


康成生物丨數(shù)譜生物表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究平臺

Arraystar mRNA&lncRNA表觀轉(zhuǎn)錄組芯片(m6A):適用于mRNA, lncRNA, pre-miRNA, pri-miRNA, snoRNA 和 snRNA.

Arraystar circRNA表觀轉(zhuǎn)錄組芯片(m6A):適用于circular RNA

  • MeRIP Seq|超90%的MeRIP 成功率;適合mRNA m6A甲基化檢測;

  • Arrystar NuRNA? Epitranscriptomics PCR Array全面收錄目前已知的m6A\m1A\m5c\甲尿嘧啶(ψ)與肌苷(I)的修飾酶Writer、修飾識別蛋白Reader和去修飾酶Eraser基因;

  • LC-MS mRNA/tRNA堿基修飾檢測質(zhì)譜檢測mRNA或tRNA上的36種堿基修飾; 

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