明朝設(shè)秋林為驛。秋林為潼川至鹽亭必經(jīng)之地，又恰處路線中點(diǎn)，故設(shè)置供傳遞官府文書之信使駐足的驛站，屬潼川州轄地。明朝嘉靖《潼川志》卷二建置志：“秋林驛，洪武二十五年（1392年）百戶楊德建。”清嘉慶《三臺縣志》：“古者郵傳之設(shè)所，以速詔命而候星使者也。三邑當(dāng)川北之沖，向?yàn)槿腙兛椎馈！?秋林鋪，鋪司一名，鋪兵一名?！?民國《三臺縣志》：“秋林驛，名秋林鎮(zhèn)，后改為秋林寨，又改霜林驛，明末改為秋林驛?！?/span>

清雍正十二年（1734）升潼川州為潼川府，以潼川州本州置三臺縣。三臺縣以28星宿命名，設(shè)東、南、西、北4路28鄉(xiāng)。此時(shí)秋林名“虛日鄉(xiāng)”，治所設(shè)在萬壽宮（原秋林供銷分社采購站）。道光六年（1826年），奉令核查戶口，編為保甲，改里為保，改牌為甲。咸豐中，奉令督辦團(tuán)練，設(shè)民團(tuán)練丁。保設(shè)團(tuán)正，數(shù)?；蚴?dāng)?shù)保設(shè)團(tuán)總，縣設(shè)團(tuán)防局。光緒六年（1880年），奉令整頓戶口，鄉(xiāng)、保、甲、民團(tuán)制度未變。

民國初年，沿襲清制，今秋林鎮(zhèn)仍名“虛日鄉(xiāng)”。民國9年（1920年）全縣28鄉(xiāng)中的19鄉(xiāng)劃分為上、中、下鄉(xiāng)或上、下鄉(xiāng)，設(shè)團(tuán)練辦事處49個。虛日鄉(xiāng)（駐秋林）設(shè)1團(tuán)練辦事處。民國14年，改組行政區(qū)劃，全縣置9區(qū)28鄉(xiāng)49團(tuán)練103保。虛日鄉(xiāng)（駐秋林驛）屬第二區(qū)（駐秋林驛），設(shè)1團(tuán)練辦事處。民國16年又將團(tuán)練辦事處改為團(tuán)甲公所，駐地未變。民國19年，實(shí)行軍政合一的基層政權(quán)機(jī)構(gòu)，全縣設(shè)4路9區(qū)62團(tuán)甲公所，保甲數(shù)未變。虛日鄉(xiāng)（駐秋林驛）屬東二區(qū)（駐秋林驛），轄秋林場、潼射場團(tuán)甲公所。民國24年，川政統(tǒng)一，調(diào)整政區(qū)，改團(tuán)甲公所為聯(lián)保辦公處，劃小保甲。秋林鎮(zhèn)區(qū)屬第二區(qū)署（駐秋林驛），第二區(qū)署轄23聯(lián)保中有秋林聯(lián)保（駐秋林驛）。民國29年，全縣59聯(lián)保改為鄉(xiāng)。今秋林鎮(zhèn)屬第二區(qū)署（駐秋林驛）秋林鄉(xiāng)（駐秋林驛）。民國31年，撤4區(qū)署，成立10個指導(dǎo)區(qū)，60鄉(xiāng)鎮(zhèn)。今秋林鎮(zhèn)屬第二指導(dǎo)區(qū)（駐秋林鄉(xiāng)），第二指導(dǎo)區(qū)轄6鄉(xiāng)中有秋林鄉(xiāng)。民國35年8月，全縣改為4個指導(dǎo)區(qū)，59鄉(xiāng)1鎮(zhèn)。今秋林鎮(zhèn)屬第一指導(dǎo)區(qū)（駐城廂鎮(zhèn)），名秋林鄉(xiāng)。民國37年1月，經(jīng)省政府批準(zhǔn)，香山鄉(xiāng)并入秋林鄉(xiāng)，駐秋林場。民國38年，全縣為6個指導(dǎo)區(qū)，56鄉(xiāng)1鎮(zhèn)，592保，8826甲。今秋林鎮(zhèn)屬第一指導(dǎo)區(qū)（駐城廂鎮(zhèn)武昌館），名秋林鄉(xiāng)轄27保。

1950年初，全縣設(shè)5區(qū)56鄉(xiāng)1鎮(zhèn)。今秋林鎮(zhèn)屬第五區(qū)（駐秋林驛）秋林鄉(xiāng)；是年11月廢除保甲制。1951年5月，政區(qū)大調(diào)整，改設(shè)鄉(xiāng)、村、組，秋林鄉(xiāng)分為秋林和香山兩個鄉(xiāng)（香山鄉(xiāng)1956年劃歸射洪縣）。是年底，全縣設(shè)15區(qū)115鄉(xiāng)1鎮(zhèn)715村，今秋林鎮(zhèn)屬第五區(qū)（駐富順），名秋林鄉(xiāng)。1952年行政區(qū)劃調(diào)整，是年底全縣為18區(qū)138鄉(xiāng)1鎮(zhèn)。今秋林鎮(zhèn)屬第五區(qū)（區(qū)駐秋林），秋林區(qū)轄七鄉(xiāng)中有秋林鄉(xiāng)和金玉鄉(xiāng)。1955年11月，撤銷秋林區(qū)，是年底，全縣為14區(qū)121鄉(xiāng)1鎮(zhèn)。今秋林鎮(zhèn)屬富順區(qū)（駐富順），富順區(qū)轄12鄉(xiāng)中有秋林、金玉。1956年金玉鄉(xiāng)2個村劃歸射洪縣，是年11月，全縣為9區(qū)92鄉(xiāng)1鎮(zhèn)，秋林屬富順區(qū)。1963年5月恢復(fù)金玉公社。秋林公社、金玉公社屬富順區(qū)。1984年3月，改社、隊(duì)為鄉(xiāng)村。秋林公社改為秋林鄉(xiāng)，金玉公社改為金玉鄉(xiāng)。1988年9月置秋林鎮(zhèn)屬富順區(qū)。1992年9月5日，經(jīng)省政府批準(zhǔn)同意撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，秋林鎮(zhèn)、金玉鄉(xiāng)合并建秋林鎮(zhèn)。

 20世紀(jì)初名噪四方的園藝學(xué)家和植物學(xué)家爾尼斯特·亨利·威爾遜，先后4次到中國西部采集植物標(biāo)本和種子，并將1593份植物種子帶到西方，被稱為“打開中國西部花園的人”。他在中國西部拍攝了200多張照片，其中一張拍攝于四川省三臺縣秋林鎮(zhèn)古驛道旁的桓候廟(張飛廟)，照片上的張飛塑像怒目圓睜、威風(fēng)凜凜、栩栩如生，生動地體現(xiàn)了百年前中國民間高超的雕塑藝術(shù)。