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Cell 最新:科學(xué)家成功繪制出完整的果蠅大腦神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)!

 秋水共藍(lán)天 2018-09-13

Cell 最新:科學(xué)家成功繪制出完整的果蠅大腦神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)!

編譯:集智翻譯組

來源:

原題:Complete fly brain imaged at nanoscale resolution

兩個(gè)高速電子顯微鏡,7062個(gè)腦切片, 2100萬張圖片,這些數(shù)字意味著什么?

對于位于弗吉尼亞州的Howard Hughes醫(yī)學(xué)院的Janelia研究院的一組科學(xué)家來說,這些數(shù)字加起來是技術(shù)上的第一步:一張成年果蠅大腦的高分辨率數(shù)碼快照。

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Davi Bock,神經(jīng)學(xué)家,該研究組的負(fù)責(zé)人

Janelia研究院的小組負(fù)責(zé)人,神經(jīng)學(xué)家Davi Bock說,研究人員現(xiàn)在可以在整個(gè)大腦中,追蹤任何一個(gè)神經(jīng)元到任何其他神經(jīng)元的路徑,他在2018年7月19日與他的同事一起在Cell雜志上報(bào)告了這項(xiàng)工作。

他說:“對果蠅大腦的繪制,從來沒有達(dá)到過如此高的分辨率,在這個(gè)分辨率下,你可以看到神經(jīng)元之間的連接?!?strong>這個(gè)細(xì)節(jié)是繪制大腦回路的關(guān)鍵——精確的神經(jīng)元連接網(wǎng)是支持果蠅特定行為的基礎(chǔ)。

Janelia研究院小組的數(shù)據(jù)為科學(xué)家們提供了一個(gè)新的工具來繪制這些連接圖譜。而且,在大腦的一個(gè)記憶中心,數(shù)據(jù)還揭示了一種新的細(xì)胞類型和其他驚喜。“每當(dāng)你看到分辨率更高和更完整的圖像時(shí),你就會發(fā)現(xiàn)新事物?!?Bock說。

果蠅如何學(xué)習(xí)和記憶

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果蠅(Drosophila melanogaster),因?yàn)樗鼈冊诔墒斓南憬吨車宋俗黜懚劽?。但Bock說,這些微小的昆蟲卻驚人地復(fù)雜?!八鼈兛梢詫W(xué)習(xí)和記憶。它們知道哪些地方是安全和哪些危險(xiǎn)的。它們擁有復(fù)雜的求偶和梳毛行為?!?/p>

Bock想弄清楚這一切是如何運(yùn)作的。

果蠅的大腦大約有罌粟種子那么大,包含大約10萬個(gè)神經(jīng)元(人類有1000億)。每個(gè)神經(jīng)元分支成一個(gè)放射狀的細(xì)線結(jié)構(gòu),來跟其他神經(jīng)元進(jìn)行連接。神經(jīng)元通過這些接觸點(diǎn),或這說突觸,來相互溝通,形成密集的通訊網(wǎng)絡(luò)。

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通過使用被稱為序列切片透射電子顯微鏡的成像技術(shù),科學(xué)家們可以觀察這些線和突觸。首先,它們向果蠅的大腦注入重金屬混合物。這些金屬聚集在細(xì)胞膜和突觸中,最終標(biāo)記每個(gè)神經(jīng)元及其連接的輪廓。

然后,研究人員用電子束擊中了大腦的切片,電子束除了有金屬的部分外,其他地方都能穿過。Bock解釋說:“這就像X射線能穿過你的身體任何地方,除了骨頭?!?/p>

由此產(chǎn)生的圖像揭示了大腦曾經(jīng)隱藏的角落和裂縫。

加快速度

在歷史上,電子顯微鏡的使用一直是一個(gè)緩慢的過程。Bock說,十年前,根本不可能收集到觀察整個(gè)果蠅大腦所需的數(shù)百萬張圖像。“想象一下用iPhone拍2100萬張照片,”他說。“你需要坐著點(diǎn)擊幾十年?!?/p>

他和一組科學(xué)家開發(fā)了新的工具來加速這一過程。該小組使用高速相機(jī)和兩個(gè)定制的系統(tǒng),以8微米的增量快速移動組織樣本,使它們能夠快速捕獲鄰近區(qū)域的圖像。

他們能夠在不到7分鐘的時(shí)間內(nèi)拍攝到整個(gè)腦切片—比之前的高通量透射電子顯微鏡相機(jī)陣列TEMCA 1(high-throughput transmission electron microscope camera array, TEMCA1)快5倍。Bock和他的同事們還得益于一個(gè)在Janeliia研究院建造出來的自定義機(jī)器人裝載機(jī),它可以自動拾取和放置樣本。

Bock說,創(chuàng)造這種尖端技術(shù)是一項(xiàng)不小的成就。這項(xiàng)工作需要數(shù)十名Janelia研究院的神經(jīng)科學(xué)家、機(jī)械工程師和軟件開發(fā)人員以及約翰霍普金斯大學(xué)(Johns Hopkins University)和分子生物學(xué)MRC實(shí)驗(yàn)室的工程顧問和科學(xué)家的合作。

在這些科學(xué)家之間進(jìn)行了長期的非正式合作之后,為了推動這項(xiàng)工作的完成,由Bock和Janelia研究院的軟件工程師Khaled Khairy共同管理的正式的Janelia的項(xiàng)目組于2016年成立。

Bock說,如果沒有整個(gè)團(tuán)隊(duì),這項(xiàng)研究是不可能的。“這是一種‘只在Janelia’的企業(yè)?!?/p>

一個(gè)更細(xì)致的觀察

Bock的團(tuán)隊(duì)收集并拼接的數(shù)百萬張圖片,提供了一個(gè)深入觀察果蠅的大腦—以及探索未知區(qū)域的機(jī)會。

Bock的研究小組追蹤了到達(dá)蘑菇體的神經(jīng)元的路徑,蘑菇體是一個(gè)涉及記憶和學(xué)習(xí)的區(qū)域。這些細(xì)胞,被稱為嗅覺投射神經(jīng)元,以前用光學(xué)顯微鏡已經(jīng)有過很好的描述。手動跟蹤這些神經(jīng)元的輪廓和它們所有的線狀投射,讓Bock的團(tuán)隊(duì)確認(rèn)了他們的圖像數(shù)據(jù)的質(zhì)量。

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果蠅的大腦包含大約10萬個(gè)神經(jīng)元,現(xiàn)在科學(xué)家已經(jīng)可以通過使用一個(gè)包含大約2100萬張圖像的數(shù)據(jù)集來詳細(xì)追蹤這些神經(jīng)元??茖W(xué)家們追蹤到了神經(jīng)元到達(dá)蘑菇體的路徑(圖中有色線),蘑菇體是一個(gè)涉及記憶和學(xué)習(xí)的區(qū)域。

他說,“我們也碰到了一些有趣的新事物。”

嗅覺投射神經(jīng)元向被稱為Kenyon細(xì)胞的神經(jīng)元發(fā)送信息。反過來,這些細(xì)胞會與不同的神經(jīng)元群對話。直到現(xiàn)在,科學(xué)家們還沒有確定,在蘑菇體的一個(gè)叫做花萼(calyx)的區(qū)域中,Kenyon細(xì)胞的交流伙伴到底是誰。

Bock的團(tuán)隊(duì)找到了這些神經(jīng)元中的一些,以及一個(gè)以前未知的跨越大腦的神經(jīng)元,它也向Kenyon細(xì)胞轉(zhuǎn)送信息的。

Bock說,嗅覺投射神經(jīng)元似乎比科學(xué)家之前認(rèn)為的更緊密的捆綁在一起。這種捆綁表明,在之前曾經(jīng)被認(rèn)為基本上是隨機(jī)的東西中,存在著一種有序的結(jié)構(gòu)。

Bock說,更好地理解這種大腦環(huán)路可以讓科學(xué)家洞察果蠅的行為。他解釋說:“我們認(rèn)為它會告訴我們動物是如何學(xué)習(xí)的—它是如何將氣味與獎(jiǎng)勵(lì)或懲罰聯(lián)系在一起的。”

現(xiàn)在,20多個(gè)實(shí)驗(yàn)室小組正在挖掘新的數(shù)據(jù)集,追蹤神經(jīng)元并勾勒出大腦的環(huán)路。Bock稱這些數(shù)據(jù)是一種資源,可以被神經(jīng)科學(xué)家們自由地挖掘來探索果蠅的思維。“它使我們用來理解這種動物的工具包中又增加了一個(gè)工具?!?/p>

用戶可以在這個(gè)地址下載果蠅大腦的數(shù)據(jù)集。

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翻譯:張朔

審校:胡鵬博

編輯:孟婕

原文地址:https://www./releases/2018/07/180719142110.htm

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