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1.在Linux系統(tǒng)上搭建Git的環(huán)境 安裝所需要的一系列軟件： yum install curl-devel expat-devel gettext-devel openssl-devel zlib-devel yum install gcc-c++ perl-ExtUtils-MakeMaker 下載git文件，解壓，準備環(huán)境，編譯，安裝 wget https://www./pub/software/scm/git/git-2.7.0.tar.gz tar xvf git-2.7.0.ta.gz cd git-2.7.0 ./configure prefix==/data2/gyd/git #configure是shell腳本，會檢測平臺的目標特征，例如是否安裝cc,gcc,并生成Makefile，--prefix 可以特化安裝路徑 make #編譯，從Makefile中讀取指令，進行編譯 make install #安裝 make clean #清除臨時文件 以上3步均依賴Makefile 設(shè)置環(huán)境變量 vim ~/.bashrc_profile PATH=$PATH:$HOME/bin:/data2/gyd/git/bin export PETH source ~/.bashrc_profile 安裝成功 git --version 2.安裝 Miniconda以及 Bioconda進行軟件的管理 下載安裝 wget https://repo./miniconda/Miniconda3-4.3.21-Linux-x86_64.shbash Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh 詢問的時候默認Yes添加至環(huán)境變量 source ~/.bashrc添加channels conda config --add channels bioconda查看已經(jīng)添加的channels： conda config --get channels更新miniconda conda update conda |
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