10月14日，我們?cè)?jīng)介紹過(guò)一個(gè)實(shí)時(shí)定量PCR的內(nèi)參基因知識(shí)庫(kù)。文章鏈接如下：論文題目： ICG: a wiki-driven knowledgebase of internal control genes for RT-qPCR normalization 發(fā)表期刊：Nucleic Acids Research 數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址：http://icg./ 研究團(tuán)隊(duì)：中科院北京基因組生命與健康大數(shù)據(jù)中心章張研究團(tuán)隊(duì) 今天，補(bǔ)充一個(gè)引物數(shù)據(jù)庫(kù)： 定量PCR引物數(shù)據(jù)庫(kù)qPrimerDB 論文題目： qPrimerDB: a thermodynamics-based gene-specific qPCR primer database for 147 organisms 發(fā)表期刊：Nucleic Acids Research 數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址： http://biodb./qprimerdb/ 研究團(tuán)隊(duì)： 西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物科技學(xué)院李加納教授團(tuán)隊(duì) 147個(gè)物種，5100＋萬(wàn)引物 該數(shù)據(jù)庫(kù)包含人、小鼠、家蠶、斑馬魚(yú)、線蟲(chóng)、酵母、擬南芥、水稻、玉米和油菜等147個(gè)物種的全基因組qPCR引物設(shè)計(jì)和驗(yàn)證分析，包含80種動(dòng)物（37種哺乳動(dòng)物、17種昆蟲(chóng)、10種魚(yú)類(lèi)、4種鳥(niǎo)類(lèi)和12種其他動(dòng)物）、66種植物（39種雙子葉植物、18種單子葉植物和9種其他植物）和1種真菌（酵母）。 基于這些數(shù)據(jù)，構(gòu)建了qPrimerDB數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄了147個(gè)物種共3331426個(gè)基因的51091785對(duì)qPCR引物，提供了查詢、批量下載和BLAST比對(duì)等工具，并定期更新。 /End. |
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