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常規(guī)研究套路升華之換個(gè)角度看問(wèn)題

 解螺旋 2020-08-27

作者:荷葉

轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明:解螺旋·臨床醫(yī)生科研成長(zhǎng)平臺(tái)


上次荷葉介紹了給常規(guī)研究套路加個(gè)“高大上”的理論假說(shuō)來(lái)升華文章的檔次,但是很多時(shí)候沒(méi)有這種理論假說(shuō)怎么辦呢?今天荷葉借一篇研究腫瘤內(nèi)T細(xì)胞的文章一窺其研究套路的升華。

文章梗概:腫瘤抗原特異的CD8+T細(xì)胞是殺傷腫瘤的主力細(xì)胞群,但是腫瘤中的CD8+T細(xì)胞常常“發(fā)揮失常”。

Ying Zhang等通過(guò)研究了在腫瘤微環(huán)境中黑色素瘤抗原特異的CD8+T細(xì)胞的變化,發(fā)現(xiàn)在低氧、低糖的腫瘤微環(huán)境中CD8+T細(xì)胞利用脂肪酸分解代謝供能,維持CD8+T細(xì)胞殺傷能力;同時(shí)他們還發(fā)現(xiàn)促進(jìn)脂肪酸代謝的PPAR激動(dòng)劑能夠與PD-1抗體相互協(xié)同抑制腫瘤生長(zhǎng)。研究成果發(fā)表在2017年9月的《Cancer Cell》上。

常規(guī)研究套路

第一步,獲得腫瘤抗原特異的TILs。

1)以黑色素瘤細(xì)胞系B16BrafV600E皮下荷瘤3天后,利用腺病毒系統(tǒng)表達(dá)黑色素瘤特異的抗原表位MAA(Trp-1455-463)和E7免疫小鼠;

2)利用OT-1轉(zhuǎn)基因小鼠(表達(dá)OVA抗原表位),皮下接種B16OVA(表達(dá)OVA的B16細(xì)胞)。研究發(fā)現(xiàn)以腫瘤疫苗免疫的小鼠腫瘤生長(zhǎng)緩慢。

第二步,觀察、檢測(cè)隨著腫瘤進(jìn)展腫瘤特異CD8+TILs的變化。作者從細(xì)胞數(shù)目、功能和形態(tài)等方面展開(kāi)研究。

研究發(fā)現(xiàn)隨著腫瘤進(jìn)展,CD8+TILs細(xì)胞數(shù)目逐漸減少,同時(shí)PD-1和LAG-3免疫檢查點(diǎn)表達(dá)水平逐漸升高。對(duì)CD8+TIL的功能研究發(fā)現(xiàn),其顆粒酶GrmB、IFNr和穿孔素Perforin表達(dá)水平下降。

作者進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)隨著腫瘤進(jìn)展CD8+TILs的線粒體膜電位降低,而線粒體ROS升高。透射電鏡觀察了線粒體的超微結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)腫瘤生長(zhǎng)時(shí)間長(zhǎng)的CD8+TILs的線粒體腫脹,線粒體嵴減少,這些結(jié)果提示TILs的線粒體隨著荷瘤時(shí)間的延長(zhǎng)而發(fā)生改變。

第三步,探討在腫瘤微環(huán)境中CD8+TILs發(fā)生這些變化的原因。由于腫瘤細(xì)胞的快速增殖能力,消耗大量的氧氣和葡萄糖(有氧糖酵解),因此腫瘤微環(huán)境常常是低氧、低糖的。研究發(fā)現(xiàn)TILs細(xì)胞HIF1α表達(dá)水平隨腫瘤進(jìn)展而升高,HIF1α下游分子Glut1表達(dá)亦升高,這些提示TILs隨著腫瘤進(jìn)展而逐漸缺氧。進(jìn)一步分析血清、荷瘤14天和30天的腫瘤組織的血糖水平,發(fā)現(xiàn)隨著腫瘤進(jìn)展腫瘤內(nèi)血糖逐漸降低。

為了明確HIF1α在TILs和腫瘤中的作用,作者敲低CD8+T細(xì)胞的HIF1α的表達(dá),發(fā)現(xiàn)敲低HIF1α后T細(xì)胞的殺傷能力增強(qiáng)。T細(xì)胞過(guò)繼實(shí)驗(yàn)在體內(nèi)證實(shí)敲低HIF1α能夠抑制腫瘤的生長(zhǎng)。

研究套路之升華

很可能大多數(shù)的研究者研究到這就接近尾聲了,有表型,有機(jī)制,還做了體內(nèi)的挽救實(shí)驗(yàn),發(fā)個(gè)7-8分的文章還是不成問(wèn)題的。但是這篇文章的作者沒(méi)有淺嘗輒止。

第四步,作者沒(méi)有局限于HIF1α,而是將HIF1α作為一個(gè)引子,換了個(gè)研究角度,從代謝的層面出發(fā),繼續(xù)深入研究低氧、低糖的腫瘤微環(huán)境中CD8+TILs發(fā)生變化的原因。作者發(fā)現(xiàn)敲低HIF1α后TILs的代謝發(fā)生改變:糖酵解相關(guān)酶表達(dá)下降,脂肪酸代謝相關(guān)酶升高。

作者轉(zhuǎn)換研究角度,分析了CD8+T細(xì)胞低糖、低氧環(huán)境的代謝表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)葡萄糖攝取、糖酵解相關(guān)基因表達(dá)下降,而脂肪酸攝取、脂肪酸代謝相關(guān)基因表達(dá)升高。

通過(guò)同位素標(biāo)記跟蹤13C的去向,作者在腫瘤模型的TILs中驗(yàn)證表達(dá)譜實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,CD8+TILs隨著腫瘤進(jìn)展逐漸由脂肪酸分解代謝供能。同時(shí)對(duì)人腫瘤樣本的研究發(fā)現(xiàn),黑色素瘤轉(zhuǎn)移灶內(nèi)脂肪酸的含量增高,進(jìn)一步提示脂肪酸分解代謝在腫瘤進(jìn)展中的作用。

第五步,TILs的脂肪酸代謝特征如何影響腫瘤呢?作者通過(guò)PPARα的激活或抑制觀察脂肪酸代謝對(duì)TILs功能的影響:發(fā)現(xiàn)PPARα激動(dòng)劑fenofibrate能促進(jìn)TILs向腫瘤組織的浸潤(rùn),提高CD8+T細(xì)胞的殺傷能力,抑制黑色素瘤的生長(zhǎng)。

而PPARα敲除后TILs的功能顯著下降,GrmB、IFNr和Perforin表達(dá)水平明顯下降。

第六步,研究了調(diào)節(jié)代謝藥物與腫瘤免疫療法相結(jié)合療法的可行性。作者發(fā)現(xiàn)腫瘤微環(huán)境能夠影響TILs免疫檢查點(diǎn)的表達(dá)水平:HIF1α與LAG-3的表達(dá)呈正相關(guān)(可能與LAG-3啟動(dòng)子上有HIF1α的結(jié)合區(qū)有關(guān)),PPARα與PD-1的表達(dá)呈正相關(guān)。

抑制免疫檢查點(diǎn)抗體與代謝藥物聯(lián)合作用效果如何呢?研究發(fā)現(xiàn)PD-1抗體治療不影響TILs的脂肪酸代謝。但是PPARα激動(dòng)劑fenofibrate能夠協(xié)同PD-1抗體增強(qiáng)腫瘤治療的效果。

綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)在低糖、低氧的腫瘤微環(huán)境中CD8+TILs激活PPARα信號(hào)和脂肪酸的分解代謝,加速脂肪酸的分解代謝(燃燒脂肪)能夠協(xié)同PD-1抗體增強(qiáng)腫瘤治療效果。

科研狗們,你是否有這樣的經(jīng)歷:當(dāng)我們千辛萬(wàn)苦終于確認(rèn)了一個(gè)表型,但是深入研究分子機(jī)制的時(shí)候常常力不從心,越做方向越窄,最終圍繞著某個(gè)分子打轉(zhuǎn),盡管最終發(fā)了一篇paper,但是連你自己都不很自信,“我找的這個(gè)分子是主要機(jī)制嗎?”如同本篇文章,大多數(shù)人很可能就會(huì)圍繞HIF1α繼續(xù)研究了,其創(chuàng)新性就不夠。但是跳出這個(gè)窠臼,從更高層面研究——從HIF1α轉(zhuǎn)到脂肪酸代謝,妥妥的高分文章。

苦惱于分子機(jī)制研究的科研狗們,不甘于發(fā)個(gè)低分文章的科研狗們,換個(gè)研究角度大膽的試一試吧!

參考文獻(xiàn)

1. Zhang Y, Kurupati R, Liu L, Zhou XY, Zhang G, Hudaihed A, Filisio F, Giles-Davis W, Xu X, Karakousis GC, Schuchter LM, Xu W, Amaravadi R, Xiao M, Sadek N, Krepler C, Herlyn M, Freeman GJ, Rabinowitz JD, Ertl HCJ. Enhancing CD8+ T Cell Fatty Acid Catabolism within a Metabolically Challenging TumorMicroenvironment Increases the Efficacy of Melanoma Immunotherapy. Cancer?Cell. 2017 Sep 11;32(3):377-391.e9. doi: 10.1016/j.ccell.2017.08.004.

2. Bailis W, Shyer JA, Chiorazzi M, Flavell RA.No Oxygen? No Glucose? No Problem: Fatty Acid Catabolism Enhances Effector CD8+?TILs.Cancer Cell. 2017 Sep 11;32(3):280-281. doi: 10.1016/j.ccell.2017.08.013.

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