提及遺傳，我們都習(xí)慣于理解為基因組的編碼信息存在于 ATGC 這四種堿基的排列順序中。然而，諸如胞嘧啶的甲基化修飾及其分布、組蛋白的乙?；?，同樣影響著表型。這就構(gòu)成了表觀遺傳學(xué) (epigenetics) 的主要研究?jī)?nèi)容。

對(duì)于表觀遺傳學(xué)，比較統(tǒng)一的認(rèn)識(shí)是，在細(xì)胞核 DNA 序列不改變的情況下，基因功能的可逆可遺傳的改變。也就是說(shuō)，不改變基因組序列，通過(guò) DNA 和組蛋白的修飾等來(lái)調(diào)控基因表達(dá)。

而 DNA 甲基化 (DNA methylation) 在表觀遺傳學(xué)的研究中最為常見(jiàn)。DNA 甲基化是重要的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記信息，對(duì)生命活動(dòng)非常重要，是基因調(diào)控的手段之一。DNA 甲基化在維持細(xì)胞正常功能、傳遞基因組印記、胚胎發(fā)育、腫瘤發(fā)生等方面都起著至關(guān)重要的作用。

[可逆的 DNA 甲基化過(guò)程]

RNA 甲基化（m6A）是目前甲基化研究的新熱點(diǎn)，m6A 甲基化是真核生物中最常見(jiàn)的一種轉(zhuǎn)錄組后修飾。已有研究表明，m6A 與 mRNA 剪切、生物鐘調(diào)節(jié)、mRNA 穩(wěn)定性等功能有關(guān)。

[可逆的 RNA 甲基化過(guò)程]

隨著甲基化研究的不斷深入，其檢測(cè)方法也層出不窮。高通量測(cè)序的不斷發(fā)展，更是大大提高了甲基化檢測(cè)的分辨率、靈敏度、動(dòng)態(tài)范圍，獲取更全面的甲基化信息。

甲基化研究手段特點(diǎn)

• 全基因組甲基化測(cè)序（WGBS）能繪制全基因組 DNA 甲基化圖譜，檢測(cè)到甲基化密度低的區(qū)域，檢測(cè)精度高。
  

• MeDIP-seq，是通過(guò)使用 5’-甲基胞嘧啶抗體富集高甲基化的 DNA 片段再測(cè)序的方法。價(jià)格相對(duì)低，適用廣泛。

• MBD-seq，利用 MBD 蛋白富集高甲基化 DNA 序列區(qū)域，對(duì)富集到的 DNA 片段進(jìn)行測(cè)序，從而檢測(cè)全基因組范圍內(nèi)的甲基化位點(diǎn)。多適用于哺乳動(dòng)物，實(shí)驗(yàn)相對(duì)穩(wěn)定。

• 人 DNA 甲基化芯片，Illumina 850K 芯片，可檢測(cè) 853,307 個(gè) CpG 位點(diǎn)，保持了 450K 芯片 CpG 島和啟動(dòng)子區(qū)覆蓋，并加強(qiáng)了增強(qiáng)子區(qū)及編碼區(qū)的探針覆蓋。價(jià)格便宜，準(zhǔn)確度高，可重復(fù)性好。

• RRBS，是通過(guò)酶切富集啟動(dòng)子及 CpG 島區(qū)域后進(jìn)行 BS 測(cè)序，具備單堿基分辨率，經(jīng)濟(jì)實(shí)用，更適用于人和小鼠。

• MeRIP-seq，則是借助二代測(cè)序技術(shù)通量高、快速高效的特點(diǎn)，將免疫沉淀方法與高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合，快速高效的檢測(cè)基因組 m6A 甲基化的研究方法。