《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于實(shí)施創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)所得稅優(yōu)惠問(wèn)題的通知》（國(guó)稅發(fā)【2009】87號(hào)）規(guī)定：“創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)采取股權(quán)投資方式投資于未上市的中小高新技術(shù)企業(yè)2年（24個(gè)月）以上，凡符合以下條件的，可以按照其對(duì)中小高新技術(shù)企業(yè)投資額的70%，在股權(quán)持有滿2年的當(dāng)年抵扣該創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)的應(yīng)納稅所得額；當(dāng)年不足抵扣的，可以在以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。”

1、公司制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)

公司制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)采取股權(quán)投資方式直接投資于種子期、初創(chuàng)期科技型企業(yè)（以下簡(jiǎn)稱(chēng)初創(chuàng)科技型企業(yè)）滿2年（24個(gè)月，下同）的，可以按照投資額的70%在股權(quán)持有滿2年的當(dāng)年抵扣該公司制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)的應(yīng)納稅所得額；當(dāng)年不足抵扣的，可以在以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。

2、天使個(gè)人投資者

天使投資個(gè)人采取股權(quán)投資方式直接投資于初創(chuàng)科技型企業(yè)滿2年的，可以按照投資額的70%抵扣轉(zhuǎn)讓該初創(chuàng)科技型企業(yè)股權(quán)取得的應(yīng)納稅所得額；當(dāng)期不足抵扣的，可以在以后取得轉(zhuǎn)讓該初創(chuàng)科技型企業(yè)股權(quán)的應(yīng)納稅所得額時(shí)結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。天使投資個(gè)人在試點(diǎn)地區(qū)投資多個(gè)初創(chuàng)科技型企業(yè)的，對(duì)其中辦理注銷(xiāo)清算的初創(chuàng)科技型企業(yè)，天使投資個(gè)人對(duì)其投資額的70%尚未抵扣完的，可自注銷(xiāo)清算之日起36個(gè)月內(nèi)抵扣天使投資個(gè)人轉(zhuǎn)讓其他初創(chuàng)科技型企業(yè)股權(quán)取得的應(yīng)納稅所得額。

綜上分析，直接投資方式下，公司制創(chuàng)投企業(yè)不管是投資初創(chuàng)科技公司還是未上市中小高新技術(shù)企業(yè)，投資限額可以抵扣該公司制創(chuàng)投企業(yè)的全部應(yīng)納稅所得額，不區(qū)分應(yīng)納稅所得額的來(lái)源。而天使個(gè)人只能抵扣初創(chuàng)科技公司股權(quán)的轉(zhuǎn)讓所得。

1、個(gè)人合伙人

個(gè)人通過(guò)合伙創(chuàng)投企業(yè)投資未上市中小高新技術(shù)企業(yè)不適用限額抵扣政策。

2、法人合伙人

《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)法人合伙人企業(yè)所得稅有關(guān)問(wèn)題的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2015年第81號(hào) ）規(guī)定：“有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)采取股權(quán)投資方式投資于未上市的中小高新技術(shù)企業(yè)滿2年（24個(gè)月，下同）的，其法人合伙人可按照對(duì)未上市中小高新技術(shù)企業(yè)投資額的70%抵扣該法人合伙人從該有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)分得的應(yīng)納稅所得額，當(dāng)年不足抵扣的，可以在以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。如果法人合伙人投資于多個(gè)符合條件的有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)，可合并計(jì)算其可抵扣的投資額和應(yīng)分得的應(yīng)納稅所得額。”

因此，法人合伙人通過(guò)合伙創(chuàng)投企業(yè)投資未上市中小高新技術(shù)企業(yè)，符合條件的投資額只能抵扣符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的所得，但是投資多個(gè)合伙創(chuàng)投企業(yè)，可以合并計(jì)算可以被抵扣的應(yīng)納稅所得額和限額抵扣的投資額。

1、法人合伙人

38號(hào)文規(guī)定：“有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)（以下簡(jiǎn)稱(chēng)合伙創(chuàng)投企業(yè)）采取股權(quán)投資方式直接投資于初創(chuàng)科技型企業(yè)滿2年的，法人合伙人可以按照對(duì)初創(chuàng)科技型企業(yè)投資額的70%抵扣法人合伙人從合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的所得?！?/p>

20號(hào)公告明確規(guī)定：“法人合伙人投資于多個(gè)符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)，可合并計(jì)算其可抵扣的投資額和分得的所得。”這里的符合條件包括投資未上市中小高新技術(shù)企業(yè)和初創(chuàng)科技公司，兩種情況的可抵扣限額合并計(jì)算，可以抵扣的應(yīng)納稅所得額為符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得合計(jì)。

2、個(gè)人合伙人

對(duì)于個(gè)人合伙人，雖然20號(hào)公告未明確的規(guī)定具體要求，但是，根據(jù)公告要求在合伙創(chuàng)投企業(yè)層面對(duì)其個(gè)人合伙人的所得分配情況進(jìn)行備案和申報(bào)，從申報(bào)邏輯中可以得出個(gè)人合伙人的投資限額只能抵扣從符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的經(jīng)營(yíng)所得，不可以抵扣不符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的經(jīng)營(yíng)所得，這種申報(bào)辦法也很難實(shí)現(xiàn)合并抵扣，因此不存在合并抵扣的問(wèn)題。 

結(jié)合上文的分析內(nèi)容來(lái)看，法人機(jī)構(gòu)需要確定間接投資和直接投資兩個(gè)抵扣限額：

間接投資抵扣限額：

通過(guò)合伙創(chuàng)投企業(yè)投資中小高新技術(shù)企業(yè)和初創(chuàng)科技公司的可抵扣限額合計(jì)z1

（該可抵扣限額為合并計(jì)算的金額，只可以抵扣符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的所得）

直接投資抵扣限額：

直接投資初創(chuàng)科技公司和未上市中小高新技術(shù)企業(yè)的可抵扣限額合計(jì) z2

（該抵扣限額可以抵扣法人合伙人的全部應(yīng)納稅所得額）

而且，法人機(jī)構(gòu)需要將應(yīng)納稅所得額劃分為三部分：

通過(guò)符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)間接投資中小高新技術(shù)企業(yè)和初創(chuàng)科技公司所分得的經(jīng)營(yíng)所得合計(jì)（這里的符合條件指符合滿2年條件）

通過(guò)不符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)間接投資中小高新技術(shù)企業(yè)和初創(chuàng)科技公司所分得的經(jīng)營(yíng)所得合計(jì)（同上）

直接投資的初創(chuàng)科技公司、中小高新技術(shù)企業(yè)取得所得合計(jì)

抵扣邏輯分析如圖一所示：

個(gè)人限額抵扣優(yōu)惠不涉及投資未上市中小高新技術(shù)企業(yè)，并且直接投資的方式下只適用于股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得。因此，個(gè)人投資者需要計(jì)算兩個(gè)抵扣限額：

直接投資初創(chuàng)科技公司的可抵扣限額n1 

（該可抵扣限額按照個(gè)人投資的各個(gè)初創(chuàng)科技公司分別計(jì)算，注銷(xiāo)清算前不能互抵）

通過(guò)合伙創(chuàng)投企業(yè)間接投資初創(chuàng)科技公司的可抵扣投資限額n2

（該抵扣限額在只能抵扣符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的所得）

而且，個(gè)人投資者需要將應(yīng)納稅所得額劃分為四部分：

從合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的股息、紅利所得

從符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的經(jīng)營(yíng)所得

從不符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的經(jīng)營(yíng)所得

從直接投資的初創(chuàng)科技公司取得的所得

個(gè)人合伙人從合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的股息、紅利所得由個(gè)人投資者單獨(dú)計(jì)算繳納個(gè)人所得稅。間接投資方式下個(gè)人投資者不存在合并抵扣的問(wèn)題，符合條件的限額投資額則只能抵扣從該符合條件的合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的經(jīng)營(yíng)所得。并且，個(gè)人合伙人以其投資的合伙創(chuàng)投企業(yè)分別填報(bào)《個(gè)人所得稅生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得納稅申報(bào)表（B表）》，分開(kāi)申報(bào)繳納個(gè)稅，最后匯總填報(bào)《個(gè)人所得稅生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)所得納稅申報(bào)表（C表）》。

但是在直接投資方式下，在天使投資個(gè)人在試點(diǎn)地區(qū)投資多個(gè)初創(chuàng)科技型企業(yè)的前提下，可在被投資企業(yè)注銷(xiāo)清算之日起36個(gè)月內(nèi)跨投資項(xiàng)目抵扣。例如：2017年5月A某投資了三個(gè)注冊(cè)在試點(diǎn)地區(qū)的初創(chuàng)科技公司B、C、D，實(shí)繳投資額均為100萬(wàn)，2019年9月B企業(yè)因經(jīng)營(yíng)不善注銷(xiāo)清算，C企業(yè)發(fā)生虧損但繼續(xù)經(jīng)營(yíng)，2019年10月，A某轉(zhuǎn)讓D企業(yè)一部分股權(quán)取得轉(zhuǎn)讓收入200萬(wàn)，則可以抵扣的限額為B企業(yè)和D企業(yè)的合計(jì)投資額的70%,共計(jì)為140萬(wàn)， 在C企業(yè)在注銷(xiāo)之前，A不得用對(duì)C企業(yè)的抵扣限額來(lái)抵扣轉(zhuǎn)讓D企業(yè)股權(quán)的所得，只有在其注銷(xiāo)清算后的36個(gè)月內(nèi)，A某才可以將C企業(yè)70萬(wàn)抵扣限額用于抵扣后期轉(zhuǎn)讓其他公司股權(quán)的所得。

38號(hào)文第二條第二點(diǎn)規(guī)定：“享受本通知規(guī)定稅收試點(diǎn)政策的創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)，應(yīng)同時(shí)符合以下條件: 4.創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)注冊(cè)地須位于本通知規(guī)定的試點(diǎn)地區(qū)。”

但是38號(hào)文并未規(guī)定創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)投資的初創(chuàng)科技公司也要在試點(diǎn)地區(qū)。因此，我們認(rèn)為注冊(cè)在試點(diǎn)地區(qū)的創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)投資非試點(diǎn)地區(qū)的初創(chuàng)科技公司可以適用限額抵扣稅收優(yōu)惠。如圖四所示，創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)甲投資的注冊(cè)在試點(diǎn)地區(qū)內(nèi)的初創(chuàng)科技公司A和非試點(diǎn)地區(qū)的初創(chuàng)科技公司B，都可以適用限額抵扣政策。

38號(hào)文第二條第三點(diǎn)規(guī)定：“享受本通知規(guī)定的稅收試點(diǎn)政策的天使投資個(gè)人，應(yīng)同時(shí)符合以下條件: 3.享受稅收試點(diǎn)政策的天使投資個(gè)人投資的初創(chuàng)科技型企業(yè)，其注冊(cè)地須位于本通知規(guī)定的試點(diǎn)地區(qū)?！币虼耍焓雇顿Y個(gè)人適用優(yōu)惠的地點(diǎn)要求不同于創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)，要求投資的初創(chuàng)科技公司必須在試點(diǎn)地區(qū)。具體如圖五所示，天使投資人乙投資的注冊(cè)在試點(diǎn)地區(qū)的初創(chuàng)科技公司C可以適用優(yōu)惠政策，但是投資的注冊(cè)在非試點(diǎn)地區(qū)的初創(chuàng)科技公司D則不可以享受優(yōu)惠政策。