1 EML4-ALK融合基因 EML4-ALK融合基因(gene fusion)是非小細胞肺癌(NSCLC)的重要驅動基因之一。EML4基因可在多個位點發(fā)生斷裂,與位于ALK第20外顯子的胞內(nèi)催化域相連,形成EML4-ALK融合基因。EML4斷裂位點不同可以與ALK形成至少10種以上的EML4-ALK融合基因變體(Variant),變體1和變體3最常見。ALK融合基因檢測目前存在FISH(檢測ALK擴增)、RT-PCR(檢測ALK變體類型)和Ventana IHC(檢測ALK蛋白表達)等三種主要檢測手段,三個方法高度一致[1]。 2 ALK二次突變 ALK蛋白激酶結構域的二次突變是克唑替尼的主要耐藥機制,最常見的8種二次突變見圖1。L1196M是守門員突變,機制類似EGFR的T790M突變,而G1202R對多數(shù)ALK抑制劑不敏感。其它耐藥機制為EGFR激活、ALK擴增、SRC激活和cKit擴增等[2]。 EML4-ALK 基因全長達到4860個堿基,編碼1620個氨基酸,可能發(fā)生的二次遠不止圖1中8種,臨床研究中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了其它二次突變,比如:F1174C、D1203N、I1171T等。一個ALK陽性NSCLC患者體內(nèi)還可能有一種以上ALK突變[2]。 3 ALK二次突變的演化規(guī)律 3.1色瑞替尼(Ceritinib) Gainor等對一項色瑞替尼臨床試驗(NCT01283516)中的23名ALK陽性患者進行克唑替尼治療后/色瑞替尼治療前的再活檢,用FISH方法在19例患者中發(fā)現(xiàn)了原發(fā)的ALK融合持續(xù)存在,在2例患者中發(fā)現(xiàn)了ALK擴增。用直接測序法在7例患者中發(fā)現(xiàn)了克唑替尼耐藥突變(C1156Y,L1196M,S1206Y,G1269M,1151T),色瑞替尼對7名患者均有效,其中1151T突變的患者PFS為2.7月,可能與色瑞替尼對1151T的IC50較高有關[3]。 克唑替尼和色瑞替尼對存在ALK二次突變和不存在ALK二次突變的二類患者的無進展生存期并未發(fā)現(xiàn)顯著統(tǒng)計學差異。 Gainor等另外對11名色瑞替尼耐藥患者進行了基因檢測,結果見表1。 3.2艾樂替尼(Alectinib) 艾樂替尼的耐藥突變?yōu)镚1202R、I1171N/S、R1209Q、V1180L等[5,6]。 Oscar Puig等用二代測序法(NGS)對艾樂替尼的二個臨床試驗NP28673和NP28761里的ALK陽性NSCLC患者進行了組織和外周血的基因檢測,見表2。 在12名克唑替尼患者身上發(fā)現(xiàn)了13種ALK耐藥突變(F1174C,L1196M,S1157F,R1231W,G1128A,V476A,I1171T,G1269A,C1156F,S1206Y,F1245C,A416P),其中5種突變?yōu)橐郧拔墨I未見。攜帶F1174C,L1196M,S1157F,R1231W,G1128A,G1269A,C1156F突變的患者經(jīng)艾樂替尼治療PFS超過3個月以上,攜帶S1206Y和F1245C雙突變的患者對艾樂替尼無效,攜帶S1157F突變的患者穩(wěn)定15.4個月。 對4名艾樂替尼耐藥后ALK突變情況進行了檢測,結果見表3。 另外,Oscar Puig對45名仍在服用艾樂替尼的患者進行了外周血中ALK等位基因豐度的變化趨勢,對艾樂替尼敏感的幾種Alk突(F1174V/L,S1157F,T1151R,S1206F,I1268V,G1269A,C1156C/F等)呈下降趨勢,而對艾樂替尼耐藥的幾種Alk突變(G1202R、I1171N/S、R1209Q、V1180L)呈上升趨勢,見圖2。 在2名患者中還發(fā)現(xiàn)了多種ALK突變共存現(xiàn)象,一名攜帶T1151M的患者,服用艾樂替尼期間出現(xiàn)了G1202R和I1171N/S三種突變,而T1151M突變消失了。另一名攜帶I1171T和F1174V的患者,服用艾樂替尼期間新增了R1209Q突變,而I1171T和F1174V的等位基因豐度不斷降低中[6]。 3.3 Brigatinib(AP26113) Scott N.gettinger等使用二代測序法(NGS)對Brigatinib的36名臨床試驗患者的腫瘤組織進行了基因檢測,其中32名檢測了入組前的組織,4名檢測了Brigatinib耐藥后的腫瘤組織。有效數(shù)據(jù)見表4,攜帶ALK突變的患者的ORR高于不攜帶ALK突變的患者[7]。 3.4 Ensartinib(X-396) 2016年ASCO會議報道了Ensartinib II期臨床部分數(shù)據(jù),劑量≥200mg每天一次的ALK陽性非小細胞肺癌患者38人,其中克唑替尼未治的8人,克唑替尼耐藥的20人,克唑替尼和色瑞替尼耐藥的7人,克唑替尼、色瑞替尼和艾樂替尼耐藥的2人,克唑替尼、色瑞替尼和Brigatinib耐藥的1人。使用二代測序NGS檢測患者中組織和血液的ALK突變基因 克唑替尼耐藥的患者可評價的人數(shù)為13人,85%的患者仍為ALK陽性,3人攜帶ALK二次突變,一名T1151M的患者PFS為4個月,一名L1196M的患者PFS為5個月,該2名患者Ensartinib耐藥后基因數(shù)據(jù)缺失;一名攜帶G1269A的患者PFS為13個月,Ensartinib耐藥后攜帶L1196M+G1269A突變;無效的一名患者為QSLP1188P+R1133Q+S1206F突變,肺部有效,腦部進展??诉蛱婺岷蜕鹛婺崮退幍幕颊呖傆行蕿?/span>29%,一名PFS大于9個月,另一名有G1202R+HER2突變,PFS5個月,進展后發(fā)現(xiàn)G1202R+V1149M突變,G1202R豐度從0.7%增加到1.7%;進展患者中有一名患者肺部完全緩解,腦部進展,另一名患者為G1202R突變(豐度0.5%)。
3.5 Lorlatinib (PF-06463922) Lorlatinib剛開始2期臨床,其耐藥信息不足,目前僅報道一例C1156Y+L1198F雙突變的耐藥患者,重回克唑替尼有效[9]。 4 總結和討論 ALK融合基因陽性和二次突變情況見表6。 4.1 ALK陽性患者在克唑替尼耐藥后,及經(jīng)艾樂替尼、色瑞替尼、Brigatinib或Ensartinib序貫治療后,絕大多數(shù)患者仍為ALK陽性。 4.2在多種ALK抑制劑序貫治療后,ALK二次突變在耐藥患者中所占比例大大增加,而種類大大減少。 4.3 克唑替尼耐藥患者經(jīng)2代或3代ALK抑制劑治療后,出現(xiàn)了雙突變,甚至三突變。比如Brigatinib對E1210K、D1203N、G1269A等單獨突變均有效,復合突變后無效。對于這類多重耐藥突變的機理仍需要進一步研究。 4.4雖然Brigatinib、Ensartinib 和Lorlatinib 在臨床試驗里顯示了對G1202R的有效性,但G1202R突變在除Lorlatinib外的ALK抑制劑耐藥患者中均有存在。 4.5 外周血中的ALK等位基因豐度變化趨勢可以輔助評估治療效果。 4.6 ALK抑制劑的序貫或切換使用,目前僅有極少數(shù)成功實例,還需要更多的臨床證據(jù)。 目前亟需準確可靠的二代測序服務,為ALK陽性患者用藥起指導作用。 文章來源:希望樹 |
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