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ALK二次突變的演化規(guī)律

 xiuqianwu 2016-07-23

1 EML4-ALK融合基因

EML4-ALK融合基因(gene fusion)是非小細胞肺癌(NSCLC)的重要驅動基因之一。EML4基因可在多個位點發(fā)生斷裂,與位于ALK20外顯子的胞內(nèi)催化域相連,形成EML4-ALK融合基因。EML4斷裂位點不同可以與ALK形成至少10種以上的EML4-ALK融合基因變體(Variant),變體1和變體3最常見。ALK融合基因檢測目前存在FISH(檢測ALK擴增)、RT-PCR(檢測ALK變體類型)和Ventana IHC(檢測ALK蛋白表達)等三種主要檢測手段,三個方法高度一致[1]


2 ALK二次突變

       ALK蛋白激酶結構域的二次突變是克唑替尼的主要耐藥機制,最常見的8種二次突變見圖1L1196M是守門員突變,機制類似EGFRT790M突變,而G1202R對多數(shù)ALK抑制劑不敏感。其它耐藥機制為EGFR激活、ALK擴增、SRC激活和cKit擴增等[2]。


EML4-ALK 基因全長達到4860個堿基,編碼1620個氨基酸,可能發(fā)生的二次遠不止圖18種,臨床研究中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了其它二次突變,比如:F1174CD1203N、I1171T等。一個ALK陽性NSCLC患者體內(nèi)還可能有一種以上ALK突變[2]。


3 ALK二次突變的演化規(guī)律

3.1色瑞替尼(Ceritinib

Gainor等對一項色瑞替尼臨床試驗(NCT01283516)中的23ALK陽性患者進行克唑替尼治療后/色瑞替尼治療前的再活檢,用FISH方法在19例患者中發(fā)現(xiàn)了原發(fā)的ALK融合持續(xù)存在,在2例患者中發(fā)現(xiàn)了ALK擴增。用直接測序法在7例患者中發(fā)現(xiàn)了克唑替尼耐藥突變(C1156Y,L1196MS1206Y,G1269M,1151T),色瑞替尼對7名患者均有效,其中1151T突變的患者PFS2.7月,可能與色瑞替尼對1151TIC50較高有關[3]。


克唑替尼和色瑞替尼對存在ALK二次突變和不存在ALK二次突變的二類患者的無進展生存期并未發(fā)現(xiàn)顯著統(tǒng)計學差異。

Gainor等另外對11名色瑞替尼耐藥患者進行了基因檢測,結果見表1。

3.2艾樂替尼(Alectinib

艾樂替尼的耐藥突變?yōu)镚1202R、I1171N/S、R1209Q、V1180L等[5,6]。

Oscar Puig等用二代測序法(NGS)對艾樂替尼的二個臨床試驗NP28673和NP28761里的ALK陽性NSCLC患者進行了組織和外周血的基因檢測,見表2。

12名克唑替尼患者身上發(fā)現(xiàn)了13ALK耐藥突變(F1174C,L1196M,S1157F,R1231W,G1128A,V476A,I1171TG1269A,C1156F,S1206YF1245C,A416P),其中5種突變?yōu)橐郧拔墨I未見。攜帶F1174C,L1196M,S1157FR1231W,G1128AG1269A,C1156F突變的患者經(jīng)艾樂替尼治療PFS超過3個月以上,攜帶S1206YF1245C雙突變的患者對艾樂替尼無效,攜帶S1157F突變的患者穩(wěn)定15.4個月。

4名艾樂替尼耐藥后ALK突變情況進行了檢測,結果見表3。

另外,Oscar Puig45名仍在服用艾樂替尼的患者進行了外周血中ALK等位基因豐度的變化趨勢,對艾樂替尼敏感的幾種Alk突(F1174V/L,S1157F,T1151R,S1206F,I1268V,G1269A,C1156C/F等)呈下降趨勢,而對艾樂替尼耐藥的幾種Alk突變(G1202RI1171N/S、R1209Q、V1180L)呈上升趨勢,見圖2。

2名患者中還發(fā)現(xiàn)了多種ALK突變共存現(xiàn)象,一名攜帶T1151M的患者,服用艾樂替尼期間出現(xiàn)了G1202RI1171N/S三種突變,而T1151M突變消失了。另一名攜帶I1171TF1174V的患者,服用艾樂替尼期間新增了R1209Q突變,而I1171TF1174V的等位基因豐度不斷降低中[6]。


3.3 BrigatinibAP26113

Scott N.gettinger等使用二代測序法(NGS)對Brigatinib36名臨床試驗患者的腫瘤組織進行了基因檢測,其中32名檢測了入組前的組織,4名檢測了Brigatinib耐藥后的腫瘤組織。有效數(shù)據(jù)見表4攜帶ALK突變的患者的ORR高于不攜帶ALK突變的患者[7]。           


3.4 EnsartinibX-396

2016ASCO會議報道了Ensartinib II期臨床部分數(shù)據(jù),劑量≥200mg每天一次的ALK陽性非小細胞肺癌患者38人,其中克唑替尼未治的8人,克唑替尼耐藥的20人,克唑替尼和色瑞替尼耐藥的7人,克唑替尼、色瑞替尼和艾樂替尼耐藥的2人,克唑替尼、色瑞替尼和Brigatinib耐藥的1人。使用二代測序NGS檢測患者中組織和血液的ALK突變基因


克唑替尼耐藥的患者可評價的人數(shù)為13人,85%的患者仍為ALK陽性,3人攜帶ALK二次突變,一名T1151M的患者PFS4個月,一名L1196M的患者PFS5個月,該2名患者Ensartinib耐藥后基因數(shù)據(jù)缺失;一名攜帶G1269A的患者PFS13個月,Ensartinib耐藥后攜帶L1196M+G1269A突變;無效的一名患者為QSLP1188P+R1133Q+S1206F突變,肺部有效,腦部進展??诉蛱婺岷蜕鹛婺崮退幍幕颊呖傆行蕿?/span>29%,一名PFS大于9個月,另一名有G1202R+HER2突變,PFS5個月,進展后發(fā)現(xiàn)G1202R+V1149M突變,G1202R豐度從0.7%增加到1.7%;進展患者中有一名患者肺部完全緩解,腦部進展,另一名患者為G1202R突變(豐度0.5%)。

              

3.5 Lorlatinib PF-06463922

Lorlatinib剛開始2期臨床,其耐藥信息不足,目前僅報道一例C1156Y+L1198F雙突變的耐藥患者,重回克唑替尼有效[9]


4 總結和討論

ALK融合基因陽性和二次突變情況見表6。


4.1 ALK陽性患者在克唑替尼耐藥后,及經(jīng)艾樂替尼、色瑞替尼、BrigatinibEnsartinib序貫治療后,絕大多數(shù)患者仍為ALK陽性。


4.2在多種ALK抑制劑序貫治療后,ALK二次突變在耐藥患者中所占比例大大增加,而種類大大減少。


4.3 克唑替尼耐藥患者經(jīng)2代或3ALK抑制劑治療后,出現(xiàn)了雙突變,甚至三突變。比如BrigatinibE1210K、D1203N、G1269A等單獨突變均有效,復合突變后無效。對于這類多重耐藥突變的機理仍需要進一步研究。


4.4雖然Brigatinib、Ensartinib Lorlatinib 在臨床試驗里顯示了對G1202R的有效性,但G1202R突變在除Lorlatinib外的ALK抑制劑耐藥患者中均有存在。


4.5 外周血中的ALK等位基因豐度變化趨勢可以輔助評估治療效果。


4.6 ALK抑制劑的序貫或切換使用,目前僅有極少數(shù)成功實例,還需要更多的臨床證據(jù)。

目前亟需準確可靠的二代測序服務,為ALK陽性患者用藥起指導作用。


文章來源:希望樹

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