DNA的復(fù)制需要RNA引物，這是由DNA聚合酶和RNA聚合酶的特性決定的。DNA聚合酶不能從頭合成DNA（需要引物DNA or RNA），因?yàn)镈NA聚合酶具有高保真系統(tǒng)，這個系統(tǒng)要求，在新鏈的延伸過程中，只有新添加的堿基與模板鏈形成雙螺旋才能繼續(xù)鏈的延伸，否則延伸終止，啟動切除修復(fù)機(jī)制，直至添加正確的堿基，也即是在DNA聚合酶的上游位置一定要互補(bǔ)形成雙鏈（可以是RNA-DNA）才能繼續(xù)下游DNA的合成，這是它的忠實(shí)性和高保真系統(tǒng)決定的。而RNA聚合酶可以從頭合成RNA，合成的RNA游離在模板外，不需要與模板形成互補(bǔ)配對的雙螺旋結(jié)構(gòu)就能繼續(xù)下游的合成。兩種酶的不同機(jī)制決定了DNA復(fù)制時用的只能是RNA引物。

PCR反應(yīng)中所用到的DNA引物，是用化學(xué)法人工合成的，與模板形成雙鏈后在DNA聚合酶的作用下就可以繼續(xù)鏈的延伸；而在體內(nèi)，由于DNA聚合酶的忠實(shí)性，不能從頭合成DNA，因此只能采用RNA引物來延伸了。

當(dāng)然，有些病毒的DNA復(fù)制不要RNA為引物：

有些病毒的基因組是線性DNA，在原核細(xì)胞和真核細(xì)胞中復(fù)制時不需要RNA引物。目前了解最清楚是的腺病毒DNA和枯草菌噬菌體φ29DNA的復(fù)制。盡管在表面上腺病毒DNA和φ29DNA與T7DNA相似，但是它們的復(fù)制不是從DNA內(nèi)部開始的，而是從DNA的一端開始，而且對兩端無選擇性，各占50%的機(jī)率。盡管腺病毒DNA和φ29DNA兩端也具有重復(fù)序列，但是方向相反。因此，在DNA復(fù)制過程中不能通過象T7DNA那樣的連環(huán)體(conctemer)來完成其末端的復(fù)制。
　　在這些DNA復(fù)制時，從一端開始，只能利用一條DNA鏈作為模板，即以3'→5'鏈為模板。這樣，新合成的DNA鏈便將原來的親代DNA鏈取代子鏈。原來的親代DNA鏈(從合成起始端看是5'→3'鏈)作為單鏈從雙螺旋中釋放出來。這條鏈自身的5'和3'可以互補(bǔ)配對，然后在3'端開始以此鏈為模板重新合成另一條子鏈。這樣，DNA復(fù)制即完成。產(chǎn)生兩個與親代DNA完成一樣的子代DNA。
 
　　前已述及，DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA鏈，需要有引物才能聚合核苷酸生成DNA鏈。那么，腺病毒和φ29DNA等沒有RNA引物是怎樣啟動其DNA復(fù)制的呢?研究發(fā)現(xiàn)，所有的腺病毒DNA生長鏈上都有一個特異的蛋白質(zhì)分子附著在其5'末端的胞嘧啶核苷酸上。在DNA復(fù)制開始之前，該末端蛋白質(zhì)通過共價鍵與dCMP的5'磷酸基相連。胞嘧啶通過堿基配對與腺病毒DNA模板3'末端的鳥嘌呤核苷酸配對結(jié)合，然后由病毒本身編碼的DNA聚合酶以此末端蛋白-dCMP復(fù)合物為引物連續(xù)合成腺病毒整個基因組的36000個核苷酸，在DNA復(fù)制過程中，由于DNA鏈被置換而產(chǎn)生了扭曲張力(torsional strain)，但細(xì)胞內(nèi)拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ可以消除張力。病毒自身編碼的72KD的單鏈結(jié)合蛋白可能也同時具有螺旋酶的功能促進(jìn)DNA雙鏈的解開。