1.綠豆芽長須根：生產綠豆芽時，有時長出的須根又長、又多、又密，影響食用。其主要原因是溫度過高，氧氣充足，生長迅速，澆水間隔時間太短等。防止措施有：降低室內溫度；用冷水淋澆豆芽；將培育豆芽的容器放置于能遮光且有空氣流動的場所；盡量減少揭開遮蓋物的次數；適當延長澆水間隔時間。

　　2.豌豆苗爛根：發(fā)病初期種子發(fā)育不良，種子微泛黑色，在播種床上點片發(fā)生，以后逐漸擴大，豌豆苗矮化或停止生長，根部嚴重腐爛。防止措施有：選擇抗爛品種；選用發(fā)芽率高的新種子并對生產用種進行嚴格清選；認真清洗生產容器、用具；加強管理，切忌澆水過量，防止溫度過高或過低；及時將爛豆、爛苗剔除。

　　3.蘿卜芽麻點病：蘿卜芽子葉展開時，子葉表面出現黑色小斑點，影響外觀商品質量。防止措施有：選用抗病品種；適當提高催芽溫度，加速出芽；降低空氣相對濕度；避免過量播種，造成芽苗擁擠。

　　4.香椿倒苗：多在發(fā)芽后8～10天發(fā)生，初期胚莖基部呈水漬狀，由白色變成黃褐色并干縮為線狀，往往子葉尚未凋萎，而幼苗倒伏貼在苗床上。防止措施有：栽培基質不能連茬使用，否則應進行高溫消毒后再用；前期控制澆水，避免基質過濕；加強管理，切忌長時間低溫。

　　5.蕎麥芽爛種：蕎麥芽在催芽期間爛種，主要原因是高溫高濕。防止措施有：嚴格控制水量，并給予適宜溫度，注意選用顆粒飽滿、發(fā)芽率高、無病蟲及機械損傷的種子。