李祁得中榜眼后，授應(yīng)奉翰林文字。時(shí)農(nóng)民起義爆發(fā)，元朝統(tǒng)治岌岌可危。李祁母老就養(yǎng)江南，李祁改任婺源州同知。累遷江浙儒學(xué)副提舉。以后，由于母親去世，回鄉(xiāng)服喪，李祁歸隱江西永新，后又躲避亂世，藏入云陽(yáng)山中。

　　李祁崇尚名節(jié)，平日與人談話(huà)，言語(yǔ)從不偏離君、臣之禮義。當(dāng)元朝復(fù)亡之際，李祁在家鄉(xiāng)聽(tīng)到元軍潰敗，常十分憂(yōu)憤，以至于食不下咽。每談及國(guó)家事，常常痛哭流涕。李祁的同科進(jìn)士余闕，為右榜第二名，后來(lái)在抗擊明軍中戰(zhàn)死。李祁為余闕的著述《青陽(yáng)集》作序時(shí)，自以“不得乘一障效死為恨”。在序中還寫(xiě)道“世之貪生畏死甘就屈辱，靦然以面目視人者，斯文之喪益掃地盡矣”?？傊菩掳驳墓賳T永新千戶(hù)余茂，在李祁歿后，刻印其遺文《云陽(yáng)先生集》十卷行世。到了以后的明朝弘治年間，李祁五世從孫李東陽(yáng)為大學(xué)士，又托吉安太守顧天錫重版該書(shū)。

　　洪武初年，明太祖開(kāi)“禮樂(lè)館”，征聘宿學(xué)名儒，李祁堅(jiān)決回絕明朝的邀請(qǐng)。自號(hào)不二心老人。蟄居窮鄉(xiāng)三十年，到了古稀之年，遭遇兵亂，亂中受傷，而后去世。時(shí)年73歲。李祁擅長(zhǎng)于行、草大字書(shū)法，風(fēng)格遒勁、飄逸而含古意。明李東陽(yáng)《懷麓堂集》中稱(chēng)：李祁楷書(shū)精湛。他也能詩(shī)擅文，他的詩(shī)作在《四庫(kù)提要》中給予高度評(píng)價(jià)，認(rèn)為他的詩(shī)作“沖融和平，自合節(jié)奏”。其詩(shī)文近千篇，僅存《云陽(yáng)集》。部分載于《明史·藝文志》。收入《沅湘耆舊集》一書(shū)的有七十五首。

　　著有《云陽(yáng)先生集》十卷。

　　注：在《新元史》、《中國(guó)書(shū)法大辭典》中都將李祁誤為一甲第一名狀元，將“齊”、“祁”相混淆。